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Biología computacional - Wikipedia, la enciclopedia libre

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class="interlanguage-link interwiki-bn mw-list-item"><a href="https://bn.wikipedia.org/wiki/%E0%A6%AA%E0%A6%B0%E0%A6%BF%E0%A6%97%E0%A6%A3%E0%A6%A8%E0%A6%BE%E0%A6%AE%E0%A7%82%E0%A6%B2%E0%A6%95_%E0%A6%9C%E0%A7%80%E0%A6%AC%E0%A6%AC%E0%A6%BF%E0%A6%9C%E0%A7%8D%E0%A6%9E%E0%A6%BE%E0%A6%A8" title="পরিগণনামূলক জীববিজ্ঞান (bengalí)" lang="bn" hreflang="bn" data-title="পরিগণনামূলক জীববিজ্ঞান" data-language-autonym="বাংলা" data-language-local-name="bengalí" class="interlanguage-link-target"><span>বাংলা</span></a></li><li class="interlanguage-link interwiki-ca mw-list-item"><a href="https://ca.wikipedia.org/wiki/Biologia_computacional" title="Biologia computacional (catalán)" lang="ca" hreflang="ca" data-title="Biologia computacional" data-language-autonym="Català" data-language-local-name="catalán" class="interlanguage-link-target"><span>Català</span></a></li><li class="interlanguage-link interwiki-el mw-list-item"><a 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Commons</span></a></li><li id="t-wikibase" class="wb-otherproject-link wb-otherproject-wikibase-dataitem mw-list-item"><a href="https://www.wikidata.org/wiki/Special:EntityPage/Q177005" title="Enlace al elemento conectado del repositorio de datos [g]" accesskey="g"><span>Elemento de Wikidata</span></a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </nav> </div> </div> </div> <div class="vector-column-end"> <div class="vector-sticky-pinned-container"> <nav class="vector-page-tools-landmark" aria-label="Página de herramientas"> <div id="vector-page-tools-pinned-container" class="vector-pinned-container"> </div> </nav> <nav class="vector-appearance-landmark" aria-label="Apariencia"> <div id="vector-appearance-pinned-container" class="vector-pinned-container"> <div id="vector-appearance" class="vector-appearance vector-pinnable-element"> <div class="vector-pinnable-header vector-appearance-pinnable-header vector-pinnable-header-pinned" data-feature-name="appearance-pinned" data-pinnable-element-id="vector-appearance" data-pinned-container-id="vector-appearance-pinned-container" data-unpinned-container-id="vector-appearance-unpinned-container" > <div class="vector-pinnable-header-label">Apariencia</div> <button class="vector-pinnable-header-toggle-button vector-pinnable-header-pin-button" data-event-name="pinnable-header.vector-appearance.pin">mover a la barra lateral</button> <button class="vector-pinnable-header-toggle-button vector-pinnable-header-unpin-button" data-event-name="pinnable-header.vector-appearance.unpin">ocultar</button> </div> </div> </div> </nav> </div> </div> <div id="bodyContent" class="vector-body" aria-labelledby="firstHeading" data-mw-ve-target-container> <div class="vector-body-before-content"> <div class="mw-indicators"> </div> <div id="siteSub" class="noprint">De Wikipedia, la enciclopedia libre</div> </div> <div id="contentSub"><div id="mw-content-subtitle"></div></div> <div id="mw-content-text" class="mw-body-content"><div class="mw-content-ltr mw-parser-output" lang="es" dir="ltr"><p>La <b>biología computacional</b> es el uso de <a href="/wiki/Algoritmo" title="Algoritmo">algoritmos</a> y <a href="/wiki/Computadora" title="Computadora">computadores</a> para facilitar el entendimiento de problemas <a href="/wiki/Biolog%C3%ADa" title="Biología">biológicos</a>. Rama de las ciencias que estudia sistemas <a href="/wiki/Biolog%C3%ADa" title="Biología">biológicos</a> mediante el diseño, estudio y aplicación de algoritmos computacionales. Se focaliza en el análisis de datos, modelado matemático y simulación computacional.<sup id="cite_ref-:0_1-0" class="reference separada"><a href="#cite_note-:0-1"><span class="corchete-llamada">[</span>1<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; Los sistemas estudiados abarcan desde la escala molecular a los ecosistemas, pasando por las células, el sistema nervioso, y los sistemas sociales. La biología computacional abarca varios campos ya establecidos: <a href="/wiki/Qu%C3%ADmica" title="Química">química</a>, <a href="/wiki/Bioqu%C3%ADmica" title="Bioquímica">bioquímica</a>, <a href="/wiki/Gen%C3%A9tica" title="Genética">genética</a>, <a href="/wiki/Matem%C3%A1tica" class="mw-redirect" title="Matemática">matemáticas</a>, <a href="/wiki/Ingenier%C3%ADa_de_sistemas" title="Ingeniería de sistemas">ingeniería de sistemas</a>, <a href="/wiki/F%C3%ADsica" title="Física">física</a>, <a href="/wiki/Estad%C3%ADstica" title="Estadística">estadísticas</a>, etc. </p> <meta property="mw:PageProp/toc" /> <div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Introducción"><span id="Introducci.C3.B3n"></span>Introducción</h2><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=1" title="Editar sección: Introducción"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <p>La biología computacional es a veces definida como sinónimo de <b>Bioinformática</b> y a veces como una disciplina emparentada, pero distinta, de esta. El <a href="/wiki/NIH" class="mw-redirect" title="NIH">NIH</a> define a ambas disciplinas como distintas aunque con cierto grado de solapamiento, según esta definición la bioinformática esta más relacionada con el desarrollo de herramientas computacionales con el fin de analizar y procesar datos y la biología computacional con el estudio por medios computacionales de sistemas biológicos.<sup id="cite_ref-:0_1-1" class="reference separada"><a href="#cite_note-:0-1"><span class="corchete-llamada">[</span>1<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; </p> <div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Subcampos">Subcampos</h2><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=2" title="Editar sección: Subcampos"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Bioinformática"><span id="Bioinform.C3.A1tica"></span>Bioinformática</h3><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=3" title="Editar sección: Bioinformática"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <div class="noprint AP rellink"><span style="font-size:88%">Artículo principal:</span>&#32;<i><a href="/wiki/Bioinform%C3%A1tica" title="Bioinformática"> Bioinformática</a></i></div><p>La bioinformática es el campo de la biología computacional centrado en la investigación, desarrollo y aplicación de herramientas computacionales para la adquisición, almacenamiento, organización, análisis y visualización de datos biológicos.<sup id="cite_ref-:0_1-2" class="reference separada"><a href="#cite_note-:0-1"><span class="corchete-llamada">[</span>1<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; Se trata de un área de trabajo multidisciplinar, donde se utiliza una gran variedad de métodos y herramientas de <a href="/wiki/Miner%C3%ADa_de_datos" title="Minería de datos">minería de datos</a>, <a href="/wiki/Reconocimiento_de_patrones" title="Reconocimiento de patrones">reconocimiento de patrones</a>, <a href="/wiki/Aprendizaje_autom%C3%A1tico" title="Aprendizaje automático">machine learning</a> o <a href="/wiki/Procesamiento_digital_de_im%C3%A1genes" title="Procesamiento digital de imágenes">procesamiento digital de imágenes</a> para resolver cuestiones biológicas como <a href="/wiki/Alineamiento_de_secuencias" title="Alineamiento de secuencias">alineamiento de secuencias</a>, <a href="/wiki/Predicci%C3%B3n_de_genes" title="Predicción de genes">predicción de genes</a>, <a href="/wiki/Gen%C3%B3mica_comparativa" title="Genómica comparativa">comparación de genomas</a> de diferentes especies, <a href="/wiki/Predicci%C3%B3n_de_la_estructura_de_las_prote%C3%ADnas" title="Predicción de la estructura de las proteínas">predicción de la estructura de proteínas</a> o <a href="/wiki/Acoplamiento_molecular" title="Acoplamiento molecular">modelado de interacciones moleculares</a>, entre muchas otras. </p><figure typeof="mw:File/Thumb"><a href="/wiki/Archivo:Multiple_Sequence_Alignment_of_ZNF226_Protein_Sequence_Across_20_Species_(1).png" class="mw-file-description"><img src="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/59/Multiple_Sequence_Alignment_of_ZNF226_Protein_Sequence_Across_20_Species_%281%29.png/434px-Multiple_Sequence_Alignment_of_ZNF226_Protein_Sequence_Across_20_Species_%281%29.png" decoding="async" width="434" height="200" class="mw-file-element" srcset="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/59/Multiple_Sequence_Alignment_of_ZNF226_Protein_Sequence_Across_20_Species_%281%29.png/651px-Multiple_Sequence_Alignment_of_ZNF226_Protein_Sequence_Across_20_Species_%281%29.png 1.5x, //upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/5/59/Multiple_Sequence_Alignment_of_ZNF226_Protein_Sequence_Across_20_Species_%281%29.png/868px-Multiple_Sequence_Alignment_of_ZNF226_Protein_Sequence_Across_20_Species_%281%29.png 2x" data-file-width="1539" data-file-height="709" /></a><figcaption>Ejemplo de alineamiento múltiple de secuencias de la proteína ZNF226, procedentes de 20 especies diferentes en un estudio de búsqueda de patrones conservados evolutivamente.</figcaption></figure> <p>Los temas de estudio más relevantes en la bioinformática son el <a href="/wiki/An%C3%A1lisis_de_secuencias" title="Análisis de secuencias">análisis de secuencias</a> y el análisis de <a href="/wiki/Expresi%C3%B3n_g%C3%A9nica" title="Expresión génica">expresión génica</a> y su <a href="/wiki/Regulaci%C3%B3n_de_la_expresi%C3%B3n_g%C3%A9nica" title="Regulación de la expresión génica">regulación</a>. </p><p>El análisis de secuencias suele comprender la identificación de una serie determinada de bases nucleotídicas, búsqueda de patrones o secuencias repetitivas e identificación de características genéticas y genómicas (ej.: genes que codifican proteínas o ARN, <a href="/wiki/Promotor_(gen%C3%A9tica)" title="Promotor (genética)">promotores</a>, sitios de unión de <a href="/wiki/Factor_de_transcripci%C3%B3n" title="Factor de transcripción">factores de transcripción</a> o de <a href="/wiki/Histona" title="Histona">histonas</a>, variantes genéticas etc.). Todos estos elementos tienen implicaciones estructurales y funcionales para los sistemas biológicos a diferentes niveles: ADN, <a href="/wiki/Cromatina" title="Cromatina">cromatina</a>, proteínas y su expresión, composición y organización celular o regulación de <a href="/wiki/Ruta_metab%C3%B3lica" title="Ruta metabólica">rutas metabólicas</a> esenciales para el desarrollo celular o de un organismo completo. La creación de bases de datos como <a href="/wiki/RefSeq" title="RefSeq">RefSeq</a>, <a href="/wiki/GenBank" title="GenBank">GenBank</a>, <a href="/wiki/Ensembl" title="Ensembl">Ensembl</a> o <a href="/wiki/ENCODE" title="ENCODE">ENCODE</a> y de herramientas computacionales como <a href="/wiki/BLAST" title="BLAST">BLAST</a>, <a href="/wiki/FASTA" title="FASTA">FASTA</a> y <a href="/wiki/ClustalW" class="mw-redirect" title="ClustalW">ClustalW</a>, para alineamiento de secuencias, o <a href="/w/index.php?title=GLIMMER&amp;action=edit&amp;redlink=1" class="new" title="GLIMMER (aún no redactado)">GLIMMER</a>, <a href="/w/index.php?title=GENSCAN&amp;action=edit&amp;redlink=1" class="new" title="GENSCAN (aún no redactado)">GENSCAN</a>, análisis de <a href="/wiki/K-mero" title="K-mero">k-meros</a> o métodos de <a href="/wiki/Aprendizaje_autom%C3%A1tico" title="Aprendizaje automático">aprendizaje automático</a> supervisado, para la identificación de genes y otros elementos genómicos, han supuesto importantes avances en el campo de la bioinformática.<sup id="cite_ref-2" class="reference separada"><a href="#cite_note-2"><span class="corchete-llamada">[</span>2<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-3" class="reference separada"><a href="#cite_note-3"><span class="corchete-llamada">[</span>3<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-4" class="reference separada"><a href="#cite_note-4"><span class="corchete-llamada">[</span>4<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-5" class="reference separada"><a href="#cite_note-5"><span class="corchete-llamada">[</span>5<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; </p><p>El análisis de expresión génica se aborda, o bien, cuantificando los niveles celulares de ARNm, para lo cual los métodos experimentales más relevantes son <a href="/wiki/RNA-Seq" title="RNA-Seq">RNA-Seq</a>, <a href="/wiki/Chip_de_ADN" title="Chip de ADN">microarrays de ADN</a>, secuenciación de <a href="/wiki/Marcador_de_secuencia_expresada" title="Marcador de secuencia expresada">EST</a>, entre otras, o bien, cuantificando los niveles de proteínas, mediante <a href="/wiki/Microarray" title="Microarray">microarrays</a> de proteínas y la <a href="/wiki/Espectr%C3%B3metro_de_masas" class="mw-redirect" title="Espectrómetro de masas">espectrometría de masas</a>. En ambos casos, la bioinformática tiene un papel clave en el desarrollo de herramientas y métodos de control de calidad de los datos obtenidos y asegurar una generación de datos robusta y <a href="/wiki/Reproducibilidad_y_repetibilidad" title="Reproducibilidad y repetibilidad">reproducible</a>. Debido a factores experimentales, es muy común obtener una variabilidad muy alta de señales, ya se correspondan con lecturas de secuencias de ARN o secuencias de proteínas, con un alto ratio de ruido de fondo/señales, siendo necesario limpiar este ruido para obtener señales claras y específicas de las moléculas de estudio. En estos métodos es fundamental la normalización de los datos para una cuantificación correcta de las secuencias; en RNA-Seq, el alineamiento de secuencias cortas de ARN contra un genoma de referencia presenta retos bioinformáticos específicos para no generar falsos positivos; o en espectrometría de masas, es necesario diferenciar secuencias originarias de proteínas con estructura, función y localización celular muy diferentes y de proporciones variables. Algunos ejemplos, entre muchos otros, de herramientas computacionales más relevantes para estos análisis son: STAR, para alineamiento de secuencias cortas obtenidas en RNA-Seq, Picard para control de calidad de secuencias, métodos de <a href="/wiki/Agrupamiento_jer%C3%A1rquico" title="Agrupamiento jerárquico">agrupamiento jerárquico</a> con <a href="/wiki/Aprendizaje_autom%C3%A1tico" title="Aprendizaje automático">aprendizaje automático</a> no supervisado para clasificar familias de proteínas y cuantificar su abundancia celular.<sup id="cite_ref-6" class="reference separada"><a href="#cite_note-6"><span class="corchete-llamada">[</span>6<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-7" class="reference separada"><a href="#cite_note-7"><span class="corchete-llamada">[</span>7<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-8" class="reference separada"><a href="#cite_note-8"><span class="corchete-llamada">[</span>8<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; </p><p>El análisis de la regulación de la expresión génica también se puede abordar, o bien, identificando <a href="/wiki/Secuencia_reguladora" title="Secuencia reguladora">secuencias reguladoras</a> y <a href="/wiki/Motivo_de_secuencia" title="Motivo de secuencia">secuencias motivo</a> asociadas en el ADN (ej.: promotores, <a href="/wiki/Enhancer" title="Enhancer">enhancers</a>, sitios de unión de factores de transcripción o de histonas etc.), o bien, identificando modificaciones epigenéticas (ej.: apertura de la cromatina y modificaciones de histonas), modificaciones <a href="/wiki/Regulaci%C3%B3n_postranscripcional" title="Regulación postranscripcional">post-transcripcionales</a> del ARNm (ej.: splicing alternativo, adición de cadenas de poli-A etc.) y <a href="/wiki/Modificaci%C3%B3n_postraduccional" title="Modificación postraduccional">post-traduccionales</a> de proteínas (ej.: adición de grupos funcionales: fosfato, metilo etc.) y modificaciones químicas del ADN (ej.: <a href="/wiki/Metilaci%C3%B3n_del_ADN" title="Metilación del ADN">metilación</a>). En estos casos, la bioinformática ha sido fundamental para el desarrollo de bases de datos de secuencias motivo y sitios de unión de factores de transcripción como JASPAR o TFBSshape y para el análisis de datos obtenidos por métodos experimentales de identificación de interacciones entre regiones reguladoras, mediante la comprensión de la <a href="/wiki/Dominios_asociados_topol%C3%B3gicamente" title="Dominios asociados topológicamente">organización tridimensional</a> del ADN en el núcleo celular. Estos últimos se engloban en los denominados <a href="/wiki/M%C3%A9todo_de_captura_de_la_conformaci%C3%B3n_de_los_cromosomas" title="Método de captura de la conformación de los cromosomas">métodos de captura de la conformación de cromosomas o métodos 3C</a>.<sup id="cite_ref-9" class="reference separada"><a href="#cite_note-9"><span class="corchete-llamada">[</span>9<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-10" class="reference separada"><a href="#cite_note-10"><span class="corchete-llamada">[</span>10<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-11" class="reference separada"><a href="#cite_note-11"><span class="corchete-llamada">[</span>11<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; </p> <div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Biomodelado_computacional">Biomodelado computacional</h3><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=4" title="Editar sección: Biomodelado computacional"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <div class="noprint AP rellink"><span style="font-size:88%">Artículo principal:</span>&#32;<i><a href="/w/index.php?title=Modelling_biological_systems&amp;action=edit&amp;redlink=1" class="new" title="Modelling biological systems (aún no redactado)"> Modelling biological systems</a></i></div> <div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Biología_de_sistemas"><span id="Biolog.C3.ADa_de_sistemas"></span>Biología de sistemas</h3><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=5" title="Editar sección: Biología de sistemas"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <div class="noprint AP rellink"><span style="font-size:88%">Artículo principal:</span>&#32;<i><a href="/wiki/Biolog%C3%ADa_de_sistemas" title="Biología de sistemas"> Biología de sistemas</a></i></div> <figure typeof="mw:File/Thumb"><a href="/wiki/Archivo:Signal_transduction_pathways.svg" class="mw-file-description"><img src="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b0/Signal_transduction_pathways.svg/357px-Signal_transduction_pathways.svg.png" decoding="async" width="357" height="262" class="mw-file-element" srcset="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b0/Signal_transduction_pathways.svg/536px-Signal_transduction_pathways.svg.png 1.5x, //upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b0/Signal_transduction_pathways.svg/714px-Signal_transduction_pathways.svg.png 2x" data-file-width="1858" data-file-height="1364" /></a><figcaption>Ejemplos de rutas de <a href="/wiki/Transducci%C3%B3n_de_se%C3%B1al" title="Transducción de señal">transducción de señales</a> a nivel intracelular, que en conjunto pueden suponer un <a href="/wiki/Sistema_biol%C3%B3gico" title="Sistema biológico">sistema biológico</a>. Diferentes moléculas (ej.: <a href="/wiki/Hormona" title="Hormona">hormonas</a>, <a href="/wiki/Citoquina" title="Citoquina">citocinas</a>, <a href="/wiki/Factor_de_crecimiento" title="Factor de crecimiento">factores de crecimiento</a> etc.) pueden actuar en sus respectivos <a href="/wiki/Receptor_celular" title="Receptor celular">receptores diana</a> en la célula de destino. Esto puede generar una serie de reacciones en cadena entre diferentes proteínas intracelulares, provocando una respuesta (ej.: activación/desactivación de la <a href="/wiki/Expresi%C3%B3n_g%C3%A9nica" title="Expresión génica">expresión génica</a>, promover la <a href="/wiki/Proliferaci%C3%B3n_celular" title="Proliferación celular">proliferación celular</a> o la <a href="/wiki/Apoptosis" title="Apoptosis">apoptosis</a>.</figcaption></figure> <p>La biología de sistemas es el análisis computacional de <a href="/wiki/Sistema_biol%C3%B3gico" title="Sistema biológico">sistemas biológicos</a>, desde el nivel molecular hasta poblaciones completas, vía el modelado matemático de sus componentes, sus interacciones intra- e intersistemas y <a href="/wiki/Emergencia_(filosof%C3%ADa)" title="Emergencia (filosofía)">propiedades emergentes</a>.<sup id="cite_ref-12" class="reference separada"><a href="#cite_note-12"><span class="corchete-llamada">[</span>12<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; Se caracteriza por basarse en un enfoque <a href="/wiki/Holismo" title="Holismo">holístico</a> o integral del estudio de los procesos biológicos, en contraposición del <a href="/wiki/Reduccionismo" title="Reduccionismo">reduccionismo</a>, el cual ha sido históricamente la aproximación más utilizada para comprender la <a href="/wiki/Organizaci%C3%B3n_biol%C3%B3gica" title="Organización biológica">organización biológica</a>.<sup id="cite_ref-13" class="reference separada"><a href="#cite_note-13"><span class="corchete-llamada">[</span>13<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; Si bien este campo abarca variedad de sistemas biológicos, los más típicamente estudiados son las <a href="/wiki/Ruta_metab%C3%B3lica" title="Ruta metabólica">rutas metabólicas</a>, por ejemplo la <a href="/wiki/Gluc%C3%B3lisis" title="Glucólisis">glucólisis</a> para la obtención de energía a partir de moléculas de <a href="/wiki/Glucosa" title="Glucosa">glucosa</a> a nivel celular, y de <a href="/wiki/Comunicaci%C3%B3n_celular" title="Comunicación celular">señalización</a> y <a href="/wiki/Transducci%C3%B3n_de_se%C3%B1al" title="Transducción de señal">transducción de señales celulares</a>, por ejemplo la vía de señalización del <a href="/wiki/Factor_de_crecimiento_epid%C3%A9rmico" title="Factor de crecimiento epidérmico">factor de crecimiento epidérmico (EGF)</a> al unirse a su receptor diana y la consecutiva cascada de modificaciones bioquímicas a nivel celular. </p><p>Las ciencias <a href="/wiki/%C3%93mica" title="Ómica">ómicas</a>, cuyos análisis pueden abarcar gran parte de un sistema biológico generando datos masivos, están frecuentemente asociadas con la biología de sistemas, especialmente la <a href="/wiki/Metabol%C3%B3mica" title="Metabolómica">metabolómica</a>, <a href="/wiki/Prote%C3%B3mica" title="Proteómica">proteómica</a>, <a href="/wiki/Interact%C3%B3mica" title="Interactómica">interactómica</a> o la <a href="/wiki/Gen%C3%B3mica" title="Genómica">genómica</a>.<sup id="cite_ref-14" class="reference separada"><a href="#cite_note-14"><span class="corchete-llamada">[</span>14<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-15" class="reference separada"><a href="#cite_note-15"><span class="corchete-llamada">[</span>15<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-16" class="reference separada"><a href="#cite_note-16"><span class="corchete-llamada">[</span>16<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; En metabolómica, uno de los métodos de estudio más relevante es el <a href="/wiki/An%C3%A1lisis_de_balance_de_flujo" title="Análisis de balance de flujo">análisis de balance de flujo</a>, centrado en construir y analizar un modelo de los flujos de diferentes <a href="/wiki/Metabolito" title="Metabolito">metabolitos</a> y otros componentes de una <a href="/wiki/Ruta_metab%C3%B3lica" title="Ruta metabólica">ruta metabólica</a>, por ejemplo: los componentes intermedios de la <a href="/wiki/Gluc%C3%B3lisis" title="Glucólisis">glucólisis</a>, que son modificados bioquímicamente por <a href="/wiki/Enzima" title="Enzima">enzimas</a> sucesivamente hasta generar un producto final.<sup id="cite_ref-17" class="reference separada"><a href="#cite_note-17"><span class="corchete-llamada">[</span>17<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; A mayor escala, es posible crear <a href="/wiki/Modelado_de_redes_metab%C3%B3licas" title="Modelado de redes metabólicas">modelos de simulación de redes metabólicas</a>, en las que se describe la interrelación de <a href="/wiki/Gen" title="Gen">genes</a>, <a href="/wiki/Prote%C3%ADna" title="Proteína">proteínas</a>, <a href="/wiki/Metabolito" title="Metabolito">metabolitos</a> y otros componentes. Esto permite, dependiendo de la precisión del modelo, predecir el <a href="/wiki/Fenotipo" title="Fenotipo">fenotipo</a> resultante de todos estos mecanismos moleculares subyacentes.<sup id="cite_ref-18" class="reference separada"><a href="#cite_note-18"><span class="corchete-llamada">[</span>18<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; En estos estudios son necesarias herramientas computacionales capaces de clasificar grupos asociados de metabolitos, calcular <a href="/wiki/Correlaci%C3%B3n" title="Correlación">correlaciones</a> entre estos grupos,<sup id="cite_ref-19" class="reference separada"><a href="#cite_note-19"><span class="corchete-llamada">[</span>19<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; describir la <a href="/wiki/Cin%C3%A9tica_enzim%C3%A1tica" title="Cinética enzimática">cinética de reacciones enzimáticas</a>, de acuerdo con la <a href="/wiki/Ley_de_masas" title="Ley de masas">ley de masas</a>,<sup id="cite_ref-20" class="reference separada"><a href="#cite_note-20"><span class="corchete-llamada">[</span>20<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; y el uso de minería de textos para obtener información bibliográfica sobre las biomoléculas de interés.<sup id="cite_ref-21" class="reference separada"><a href="#cite_note-21"><span class="corchete-llamada">[</span>21<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-22" class="reference separada"><a href="#cite_note-22"><span class="corchete-llamada">[</span>22<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; </p><p>Un campo estrechamente relacionado con la biología de sistemas es la <a href="/wiki/Biolog%C3%ADa_sint%C3%A9tica" title="Biología sintética">biología sintética</a>, la cual se centra en mejorar sistemas biológicos que existen en la naturaleza (ej.: añadiendo nuevas funcionalidades a una enzima o una ruta metabólica) o en diseñar y construir nuevos sistemas biológicos mediante <a href="/wiki/Ingenier%C3%ADa_gen%C3%A9tica" title="Ingeniería genética">ingeniería genética</a> (ej.: sintetizando artificialmente biomoléculas capaces de cumplir tareas específicas). Ambos campos se retroalimentan, junto con otros como la <a href="/wiki/Ingenier%C3%ADa_de_control" title="Ingeniería de control">ingeniería de control</a> y el diseño de <a href="/wiki/Biomaterial" title="Biomaterial">biomateriales</a>. Algunos de los temas de estudio más relevantes son la síntesis <i>de novo</i> de secuencias de genes, incluso de un genoma completo (ver caso del genoma mínimo de <i><a href="/wiki/Mycoplasma_laboratorium" title="Mycoplasma laboratorium">Mycoplasma laboratorium</a></i>),<sup id="cite_ref-23" class="reference separada"><a href="#cite_note-23"><span class="corchete-llamada">[</span>23<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; síntesis de factores de transcripción sintéticos<sup id="cite_ref-24" class="reference separada"><a href="#cite_note-24"><span class="corchete-llamada">[</span>24<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; y creación de <a href="/wiki/Circuito_biol%C3%B3gico_sint%C3%A9tico" title="Circuito biológico sintético">circuitos biológicos sintéticos</a> capaces de regular la <a href="/wiki/Transcripci%C3%B3n_gen%C3%A9tica" title="Transcripción genética">transcripción</a>, <a href="/wiki/Traducci%C3%B3n_(gen%C3%A9tica)" title="Traducción (genética)">traducción</a> y <a href="/wiki/Regulaci%C3%B3n_de_la_expresi%C3%B3n_g%C3%A9nica" title="Regulación de la expresión génica">regulación de la expresión génica</a>.<sup id="cite_ref-25" class="reference separada"><a href="#cite_note-25"><span class="corchete-llamada">[</span>25<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; </p> <div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Biología_evolutiva"><span id="Biolog.C3.ADa_evolutiva"></span>Biología evolutiva</h3><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=6" title="Editar sección: Biología evolutiva"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <div class="noprint AP rellink"><span style="font-size:88%">Artículo principal:</span>&#32;<i><a href="/wiki/Biolog%C3%ADa_evolutiva" title="Biología evolutiva"> Biología evolutiva</a></i></div> <p>Las herramientas computacionales/estadísticas permiten el estudio de las relaciones evolutivas entre moléculas (como proteínas) y/o entre individuos. </p> <div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Genómica_computacional"><span id="Gen.C3.B3mica_computacional"></span>Genómica computacional</h3><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=7" title="Editar sección: Genómica computacional"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <div class="noprint AP rellink"><span style="font-size:88%">Artículo principal:</span>&#32;<i><a href="/wiki/Gen%C3%B3mica_computacional" title="Genómica computacional"> Genómica computacional</a></i></div> <figure class="mw-default-size" typeof="mw:File/Thumb"><a href="/wiki/Archivo:Genome_viewer_screenshot_small.png" class="mw-file-description"><img src="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/43/Genome_viewer_screenshot_small.png/220px-Genome_viewer_screenshot_small.png" decoding="async" width="220" height="242" class="mw-file-element" srcset="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/43/Genome_viewer_screenshot_small.png/330px-Genome_viewer_screenshot_small.png 1.5x, //upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/43/Genome_viewer_screenshot_small.png/440px-Genome_viewer_screenshot_small.png 2x" data-file-width="490" data-file-height="540" /></a><figcaption>Ideograma del cromosoma X del genoma humano (extraído del <a href="/wiki/Centro_Nacional_para_la_Informaci%C3%B3n_Biotecnol%C3%B3gica" title="Centro Nacional para la Información Biotecnológica">NCBI</a>)</figcaption></figure> <p>La genómica computacional es el estudio de la secuencia de los genomas, tanto de ADN como de ARN mediante herramientas computacionales y estadísticas. Dos de los tipos de estudios más frecuentes en este campo son el <a href="/wiki/Alineamiento_de_secuencias" title="Alineamiento de secuencias">alineamiento de secuencias</a> y la <a href="/wiki/Secuenciaci%C3%B3n_del_ADN" title="Secuenciación del ADN">secuenciación del ADN</a>. Para el primero, se han desarrollado diferentes algoritmos como el <a href="/wiki/Algoritmo_Needleman-Wunsch" title="Algoritmo Needleman-Wunsch">algoritmo Needleman-Wunsch</a> y <a href="/wiki/BLAST" title="BLAST">BLAST</a> para comparar dos o más secuencias y cuantificar el grado de similitud entre estas.<sup id="cite_ref-26" class="reference separada"><a href="#cite_note-26"><span class="corchete-llamada">[</span>26<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; </p><p>Para el segundo, existe una gran variedad de métodos experimentales desde la secuenciación por el <a href="/wiki/M%C3%A9todo_de_Sanger" title="Método de Sanger">Método de Sanger</a> hasta los más utilizados actualmente de tipo <a href="/wiki/Secuenciaci%C3%B3n_del_ADN#Nuevos_métodos_de_secuenciación" title="Secuenciación del ADN">"Next Generation Sequencing" o NGS</a>. El constante progreso en el desarrollo y aplicación de estos métodos experimentales a llevado consigo un desarrollo paralelo de herramientas computacionales capaces de tratar conjuntos de datos cada vez más masivos. Etapas clave en un análisis de datos de secuenciación, como pueden ser la identificación de las <a href="/wiki/Nucle%C3%B3tido" title="Nucleótido">bases nucleotídicas</a> para la lectura de una secuencia, el alineamiento de esta contra un <a href="/wiki/Genoma_de_referencia" title="Genoma de referencia">genoma de referencia</a> o la identificación de variantes genéticas, requieren de potentes algoritmos como <a href="/wiki/Red_neuronal_artificial" title="Red neuronal artificial">redes neuronales</a>, <a href="/wiki/M%C3%A1quinas_de_vectores_de_soporte" class="mw-redirect" title="Máquinas de vectores de soporte">algoritmos SVM</a> o métodos de <a href="/wiki/Inferencia_bayesiana" title="Inferencia bayesiana">inferencia Bayesiana</a>.<sup id="cite_ref-27" class="reference separada"><a href="#cite_note-27"><span class="corchete-llamada">[</span>27<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-28" class="reference separada"><a href="#cite_note-28"><span class="corchete-llamada">[</span>28<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; </p><p>El <a href="/wiki/Proyecto_Genoma_Humano" title="Proyecto Genoma Humano">Proyecto Genoma Humano</a> es un ejemplo de genómica computacional realizada a una escala internacional, en el cual se consiguió secuenciar por primera vez el 99% de la eucromatina del genoma humano con una precisión del 99.99% en el año 2003.<sup id="cite_ref-29" class="reference separada"><a href="#cite_note-29"><span class="corchete-llamada">[</span>29<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; Tras posteriores estudios, se han publicado diferentes versiones del genoma humano, cada cual más completa que la anterior, hasta que en enero de 2022 el Consorcio <i>Telomere-to-Telomere</i> (T2T)<sup id="cite_ref-30" class="reference separada"><a href="#cite_note-30"><span class="corchete-llamada">[</span>30<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; publicó los resultados de la secuenciación completa.<sup id="cite_ref-31" class="reference separada"><a href="#cite_note-31"><span class="corchete-llamada">[</span>31<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-32" class="reference separada"><a href="#cite_note-32"><span class="corchete-llamada">[</span>32<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; </p><p>Tras el éxito histórico que supuso este proyecto, se han llevado a cabo otros muchos centrados en la secuenciación de genomas. Algunos ejemplos: el <a href="/wiki/Proyecto_1000_genomas" title="Proyecto 1000 genomas">Proyecto 1000 Genomas</a>, con el objetivo de estudiar la <a href="/wiki/Variaci%C3%B3n_gen%C3%A9tica_humana" title="Variación genética humana">variabilidad del genoma humano</a> a escala mundial, identificar frecuencias de variantes raras en poblaciones humanas y mejorar los resultados del <a href="/wiki/Genoma_de_referencia" title="Genoma de referencia">genoma de referencia</a> humano obtenido en el Proyecto Genoma Humano;<sup id="cite_ref-33" class="reference separada"><a href="#cite_note-33"><span class="corchete-llamada">[</span>33<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-34" class="reference separada"><a href="#cite_note-34"><span class="corchete-llamada">[</span>34<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; el <a href="/w/index.php?title=Proyecto_1000_000_Genomas&amp;action=edit&amp;redlink=1" class="new" title="Proyecto 1000 000 Genomas (aún no redactado)">Proyecto 1000 000 Genomas</a>, centrado en investigar variantes genéticas asociadas con <a href="/wiki/Enfermedad_rara" title="Enfermedad rara">enfermedades raras</a>, <a href="/wiki/C%C3%A1ncer" title="Cáncer">cancer</a> y <a href="/wiki/Enfermedad_infecciosa" title="Enfermedad infecciosa">enfermedades infecciosas</a> y potenciar el diagnóstico clínico de pacientes del Reino Unido;<sup id="cite_ref-35" class="reference separada"><a href="#cite_note-35"><span class="corchete-llamada">[</span>35<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; el <a href="/w/index.php?title=Proyecto_Earth_BioGenome&amp;action=edit&amp;redlink=1" class="new" title="Proyecto Earth BioGenome (aún no redactado)">Proyecto <i>Earth BioGenome</i></a><i>,</i> dedicado en la secuenciación de todos los organismos <a href="/wiki/Eukaryota" title="Eukaryota">eucariotas</a> en la Tierra con el propósito de generar genomas de referencia para cada <a href="/wiki/Familia_(biolog%C3%ADa)" title="Familia (biología)">familia taxonómica</a> y así promover iniciativas de conservación de la <a href="/wiki/Biodiversidad" title="Biodiversidad">biodiversidad</a>.<sup id="cite_ref-36" class="reference separada"><a href="#cite_note-36"><span class="corchete-llamada">[</span>36<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;<sup id="cite_ref-37" class="reference separada"><a href="#cite_note-37"><span class="corchete-llamada">[</span>37<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203; </p> <div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Neurociencia_computacional">Neurociencia computacional</h3><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=8" title="Editar sección: Neurociencia computacional"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <div class="noprint AP rellink"><span style="font-size:88%">Artículo principal:</span>&#32;<i><a href="/wiki/Neurociencia_computacional" title="Neurociencia computacional"> Neurociencia computacional</a></i></div> <div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Farmacología"><span id="Farmacolog.C3.ADa"></span>Farmacología</h3><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=9" title="Editar sección: Farmacología"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <div class="noprint AP rellink"><span style="font-size:88%">Artículo principal:</span>&#32;<i><a href="/wiki/Farmacolog%C3%ADa" title="Farmacología"> Farmacología</a></i></div> <div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Software_y_herramientas">Software y herramientas</h2><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=10" title="Editar sección: Software y herramientas"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <p>Los biólogos computacionales usan un amplio rango de herramientas computacionales. Desde programas que se ejecutan en la línea de comandos a programas con entorno gráfico y aplicaciones web. Es común que los biólogos computacionales escriban su propio software. La complejidad de este software varía ampliamente desde pequeños _scripts_ para facilitar la comunicación entre programas o el análisis de datos a programas realmente complejos con miles de líneas de código. </p> <div class="mw-heading mw-heading3"><h3 id="Software_de_código_abierto"><span id="Software_de_c.C3.B3digo_abierto"></span>Software de código abierto</h3><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=11" title="Editar sección: Software de código abierto"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <p>Programas de <a href="/wiki/C%C3%B3digo_abierto" title="Código abierto">Código abierto</a> (y de <a href="/wiki/Software_libre" title="Software libre">Software libre</a>) proveen de una plataforma ideal para el desarrollo de métodos biológicos. El código abierto permite que cualquier persona tenga acceso y pueda corregir y modificar el código fuente de un programa. La revista <i><a href="/wiki/PLOS_Computational_Biology" title="PLOS Computational Biology">PLOS Computational Biology</a></i> cita cuatro principales razones para utilizar código abierto en ciencia: </p> <ul><li>Reproducibilidad: Esto permite a los investigadores usar exactamente los mismos métodos para el análisis y/o modelado de datos biológicos.</li> <li>Desarrollo más rápido: En vez de re-inventar la rueda los científicos pueden hacer uso de código preexistente y adaptarlo a sus necesidades.</li> <li>Mayor calidad: Al hacer el código accesible a terceros, se hace más fácil que se encuentren y corrijan errores, que de otra forma podrían pasar inadvertidos.</li> <li>Disponibilidad a largo plazo: El código abierto (y el software libre) no están atados a una empresa en particular o a patentes, lo que fomenta su diseminación a lo largo de la web y aumenta las chances de que el código este disponible en el futuro.<sup id="cite_ref-38" class="reference separada"><a href="#cite_note-38"><span class="corchete-llamada">[</span>38<span class="corchete-llamada">]</span></a></sup>&#8203;</li></ul> <div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Véase_también"><span id="V.C3.A9ase_tambi.C3.A9n"></span>Véase también</h2><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=12" title="Editar sección: Véase también"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <div style="overflow:auto hidden;"> <table width="100%" border="0" cellspacing="0" cellpadding="0" style="table-layout:fixed;"> <tbody><tr valign="top"> <td><div style="margin-right:20px;"> <ul><li><a href="/wiki/Biocibern%C3%A9tica" title="Biocibernética">Biocibernética</a></li> <li><a href="/wiki/Bioestad%C3%ADstica" title="Bioestadística">Bioestadística</a></li> <li><a href="/wiki/Biof%C3%ADsica" title="Biofísica">Biofísica</a></li> <li><a href="/wiki/Bioinform%C3%A1tica" title="Bioinformática">Bioinformática</a></li> <li><a href="/wiki/Bioqu%C3%ADmica" title="Bioquímica">Bioquímica</a></li> <li><a href="/wiki/Gen%C3%B3mica_computacional" title="Genómica computacional">Genómica computacional</a></li> <li><a href="/wiki/Gen%C3%B3mica_estructural" title="Genómica estructural">Genómica estructural</a></li></ul> </div> </td> <td><div style="margin-right: 20px;"> <ul><li><a href="/wiki/Computaci%C3%B3n_cient%C3%ADfica" title="Computación científica">Computación científica</a></li> <li><a href="/wiki/Filogenia" title="Filogenia">Filogenia</a></li> <li><a href="/wiki/%C3%93micas" class="mw-redirect" title="Ómicas">Ómicas</a></li> <li><a href="/wiki/Multi%C3%B3mica" title="Multiómica">Multiómica</a></li> <li><a href="/wiki/Vida_artificial" title="Vida artificial">Vida artificial</a></li> <li><a href="/wiki/Red_biol%C3%B3gica" title="Red biológica">Red biológica</a></li> <li><a href="/wiki/Sistema_biol%C3%B3gico" title="Sistema biológico">Sistema biológico</a></li></ul> </div> </td> <td><div style="margin-right: 20px;"> <ul><li><a href="/wiki/Modelado_molecular" title="Modelado molecular">Modelado molecular</a></li> <li><a href="/wiki/Metabol%C3%B3mica" title="Metabolómica">Metabolómica</a></li> <li><a href="/wiki/Predicci%C3%B3n_de_estructura_de_prote%C3%ADnas" class="mw-redirect" title="Predicción de estructura de proteínas">Predicción de estructura de proteínas</a></li> <li><a href="/wiki/Prote%C3%B3mica" title="Proteómica">Proteómica</a></li> <li><a href="/wiki/Qu%C3%ADmica_computacional" title="Química computacional">Química computacional</a></li></ul> </div> </td> <td><div style="margin-right: 20px;"> <ul><li><a href="/wiki/Anexo:Revistas_cient%C3%ADficas_de_bioinform%C3%A1tica" title="Anexo:Revistas científicas de bioinformática">Anexo:Revistas científicas de bioinformática</a></li></ul> </div> </td></tr></tbody></table></div> <div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Referencias">Referencias</h2><span class="mw-editsection"><span class="mw-editsection-bracket">[</span><a href="/w/index.php?title=Biolog%C3%ADa_computacional&amp;action=edit&amp;section=13" title="Editar sección: Referencias"><span>editar</span></a><span class="mw-editsection-bracket">]</span></span></div> <div class="listaref" style="-moz-column-count:3; -webkit-column-count:3; column-count:3; list-style-type: decimal;"><ol class="references"> <li id="cite_note-:0-1"><span class="mw-cite-backlink">↑ <a href="#cite_ref-:0_1-0"><sup><i><b>a</b></i></sup></a> <a href="#cite_ref-:0_1-1"><sup><i><b>b</b></i></sup></a> <a href="#cite_ref-:0_1-2"><sup><i><b>c</b></i></sup></a></span> <span class="reference-text"><span id="CITAREFHuerta_M.,_Haseltine_F.,_Liu_Y.,_Downing_G._&amp;_Seto_B.17-07-2000" class="citation web">Huerta M., Haseltine F., Liu Y., Downing G. &amp; Seto B. 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Consultado el 26 de julio de 2022</span>.</span><span title="ctx_ver=Z39.88-2004&amp;rfr_id=info%3Asid%2Fes.wikipedia.org%3ABiolog%C3%ADa+computacional&amp;rft.atitle=NIH+working+definition+of+Bioinformatics+and+Computational+Biology&amp;rft.au=Huerta+M.%2C+Haseltine+F.%2C+Liu+Y.%2C+Downing+G.+%26+Seto+B.&amp;rft.aulast=Huerta+M.%2C+Haseltine+F.%2C+Liu+Y.%2C+Downing+G.+%26+Seto+B.&amp;rft.date=17-07-2000&amp;rft.genre=article&amp;rft.jtitle=web.archive.org&amp;rft_id=http%3A%2F%2Fwww.bisti.nih.gov%2Fdocs%2FCompuBioDef.pdf&amp;rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal" class="Z3988"><span style="display:none;">&#160;</span></span></span> </li> <li id="cite_note-2"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-2">↑</a></span> <span class="reference-text"><span id="CITAREFKorf2004-05-14" class="citation publicación">Korf, Ian (14 de mayo de 2004). <a rel="nofollow" class="external text" href="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15144565/">«Gene finding in novel genomes»</a>. <i>BMC bioinformatics</i> <b>5</b>: 59. <small><a href="/wiki/ISSN" class="mw-redirect" title="ISSN">ISSN</a>&#160;<a rel="nofollow" class="external text" href="//portal.issn.org/resource/issn/1471-2105">1471-2105</a></small>. <small><a href="/wiki/PubMed_Identifier" class="mw-redirect" title="PubMed Identifier">PMID</a>&#160;<a rel="nofollow" class="external text" href="//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15144565">15144565</a></small>. <small><a href="/wiki/Digital_object_identifier" class="mw-redirect" title="Digital object identifier">doi</a>:<a rel="nofollow" class="external text" href="https://dx.doi.org/10.1186%2F1471-2105-5-59">10.1186/1471-2105-5-59</a></small><span class="reference-accessdate">. Consultado el 27 de julio de 2022</span>.</span><span title="ctx_ver=Z39.88-2004&amp;rfr_id=info%3Asid%2Fes.wikipedia.org%3ABiolog%C3%ADa+computacional&amp;rft.atitle=Gene+finding+in+novel+genomes&amp;rft.au=Korf%2C+Ian&amp;rft.aufirst=Ian&amp;rft.aulast=Korf&amp;rft.date=2004-05-14&amp;rft.genre=article&amp;rft.issn=1471-2105&amp;rft.jtitle=BMC+bioinformatics&amp;rft.pages=59&amp;rft.volume=5&amp;rft_id=https%3A%2F%2Fpubmed.ncbi.nlm.nih.gov%2F15144565%2F&amp;rft_id=info%3Adoi%2F10.1186%2F1471-2105-5-59&amp;rft_id=info%3Apmid%2F15144565&amp;rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal" class="Z3988"><span style="display:none;">&#160;</span></span></span> </li> <li id="cite_note-3"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-3">↑</a></span> <span class="reference-text"><span class="citation publicación"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.science.org/doi/10.1126/science.1105136">«The ENCODE (ENCyclopedia Of DNA Elements) Project»</a>. <i>Science</i> <span style="color:var(--color-subtle, #555 );">(en inglés)</span> <b>306</b> (5696): 636-640. 22 de octubre de 2004. <small><a href="/wiki/ISSN" class="mw-redirect" title="ISSN">ISSN</a>&#160;<a rel="nofollow" class="external text" href="//portal.issn.org/resource/issn/0036-8075">0036-8075</a></small>. <small><a href="/wiki/Digital_object_identifier" class="mw-redirect" title="Digital object identifier">doi</a>:<a rel="nofollow" class="external text" href="https://dx.doi.org/10.1126%2Fscience.1105136">10.1126/science.1105136</a></small><span class="reference-accessdate">. Consultado el 27 de julio de 2022</span>.</span><span title="ctx_ver=Z39.88-2004&amp;rfr_id=info%3Asid%2Fes.wikipedia.org%3ABiolog%C3%ADa+computacional&amp;rft.atitle=The+ENCODE+%28ENCyclopedia+Of+DNA+Elements%29+Project&amp;rft.date=2004-10-22&amp;rft.genre=article&amp;rft.issn=0036-8075&amp;rft.issue=5696&amp;rft.jtitle=Science&amp;rft.pages=636-640&amp;rft.volume=306&amp;rft_id=https%3A%2F%2Fwww.science.org%2Fdoi%2F10.1126%2Fscience.1105136&amp;rft_id=info%3Adoi%2F10.1126%2Fscience.1105136&amp;rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal" class="Z3988"><span style="display:none;">&#160;</span></span></span> </li> <li id="cite_note-4"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-4">↑</a></span> <span class="reference-text"><span id="CITAREFYandellEnce2012-05" class="citation publicación">Yandell, Mark; Ence, Daniel (2012-05). <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.nature.com/articles/nrg3174">«A beginner's guide to eukaryotic genome annotation»</a>. <i>Nature Reviews Genetics</i> <span style="color:var(--color-subtle, #555 );">(en inglés)</span> <b>13</b> (5): 329-342. <small><a href="/wiki/ISSN" class="mw-redirect" title="ISSN">ISSN</a>&#160;<a rel="nofollow" class="external text" href="//portal.issn.org/resource/issn/1471-0064">1471-0064</a></small>. <small><a href="/wiki/Digital_object_identifier" class="mw-redirect" title="Digital object identifier">doi</a>:<a rel="nofollow" class="external text" href="https://dx.doi.org/10.1038%2Fnrg3174">10.1038/nrg3174</a></small><span class="reference-accessdate">. Consultado el 27 de julio de 2022</span>.</span><span title="ctx_ver=Z39.88-2004&amp;rfr_id=info%3Asid%2Fes.wikipedia.org%3ABiolog%C3%ADa+computacional&amp;rft.atitle=A+beginner%27s+guide+to+eukaryotic+genome+annotation&amp;rft.au=Ence%2C+Daniel&amp;rft.au=Yandell%2C+Mark&amp;rft.aufirst=Mark&amp;rft.aulast=Yandell&amp;rft.date=2012-05&amp;rft.genre=article&amp;rft.issn=1471-0064&amp;rft.issue=5&amp;rft.jtitle=Nature+Reviews+Genetics&amp;rft.pages=329-342&amp;rft.volume=13&amp;rft_id=https%3A%2F%2Fwww.nature.com%2Farticles%2Fnrg3174&amp;rft_id=info%3Adoi%2F10.1038%2Fnrg3174&amp;rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal" class="Z3988"><span style="display:none;">&#160;</span></span></span> </li> <li id="cite_note-5"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-5">↑</a></span> <span class="reference-text"><span id="CITAREFPrjibelskiKorobeynikovLapidus2019-01-01" class="citation libro">Prjibelski, Andrey D.; Korobeynikov, Anton I.; Lapidus, Alla L. (1 de enero de 2019). 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Consultado el 27 de julio de 2022</span>.</span><span title="ctx_ver=Z39.88-2004&amp;rfr_id=info%3Asid%2Fes.wikipedia.org%3ABiolog%C3%ADa+computacional&amp;rft.au=Korobeynikov%2C+Anton+I.&amp;rft.au=Lapidus%2C+Alla+L.&amp;rft.au=Prjibelski%2C+Andrey+D.&amp;rft.aufirst=Andrey+D.&amp;rft.aulast=Prjibelski&amp;rft.btitle=Sequence+Analysis&amp;rft.date=2019-01-01&amp;rft.genre=book&amp;rft.isbn=978-0-12-811432-2&amp;rft.pages=292-322&amp;rft.pub=Academic+Press&amp;rft_id=https%3A%2F%2Fwww.sciencedirect.com%2Fscience%2Farticle%2Fpii%2FB9780128096338201064&amp;rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Abook" class="Z3988"><span style="display:none;">&#160;</span></span></span> </li> <li id="cite_note-6"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-6">↑</a></span> <span class="reference-text"><span id="CITAREFJiSadreyev2018-10" class="citation publicación">Ji, Fei; Sadreyev, Ruslan I. 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Consultado el 29 de julio de 2022</span>.</span><span title="ctx_ver=Z39.88-2004&amp;rfr_id=info%3Asid%2Fes.wikipedia.org%3ABiolog%C3%ADa+computacional&amp;rft.atitle=RNA-seq%3A+Basic+Bioinformatics+Analysis&amp;rft.au=Ji%2C+Fei&amp;rft.au=Sadreyev%2C+Ruslan+I.&amp;rft.aufirst=Fei&amp;rft.aulast=Ji&amp;rft.date=2018-10&amp;rft.genre=article&amp;rft.issn=1934-3647&amp;rft.issue=1&amp;rft.jtitle=Current+Protocols+in+Molecular+Biology&amp;rft.pages=e68&amp;rft.volume=124&amp;rft_id=https%3A%2F%2Fpubmed.ncbi.nlm.nih.gov%2F30222249%2F&amp;rft_id=info%3Adoi%2F10.1002%2Fcpmb.68&amp;rft_id=info%3Apmc%2F6168365&amp;rft_id=info%3Apmid%2F30222249&amp;rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal" class="Z3988"><span style="display:none;">&#160;</span></span></span> </li> <li id="cite_note-7"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-7">↑</a></span> <span class="reference-text"><span id="CITAREFBittremieuxTabbImpensStaes2018-09" class="citation publicación">Bittremieux, Wout; Tabb, David L.; Impens, Francis; Staes, An; Timmerman, Evy; Martens, Lennart; Laukens, Kris (2018-09). <a rel="nofollow" class="external text" href="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28802010/">«Quality control in mass spectrometry-based proteomics»</a>. <i>Mass Spectrometry Reviews</i> <b>37</b> (5): 697-711. <small><a href="/wiki/ISSN" class="mw-redirect" title="ISSN">ISSN</a>&#160;<a rel="nofollow" class="external text" href="//portal.issn.org/resource/issn/1098-2787">1098-2787</a></small>. <small><a href="/wiki/PubMed_Identifier" class="mw-redirect" title="PubMed Identifier">PMID</a>&#160;<a rel="nofollow" class="external text" href="//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28802010">28802010</a></small>. <small><a href="/wiki/Digital_object_identifier" class="mw-redirect" title="Digital object identifier">doi</a>:<a rel="nofollow" class="external text" href="https://dx.doi.org/10.1002%2Fmas.21544">10.1002/mas.21544</a></small><span class="reference-accessdate">. Consultado el 29 de julio de 2022</span>.</span><span title="ctx_ver=Z39.88-2004&amp;rfr_id=info%3Asid%2Fes.wikipedia.org%3ABiolog%C3%ADa+computacional&amp;rft.atitle=Quality+control+in+mass+spectrometry-based+proteomics&amp;rft.au=Bittremieux%2C+Wout&amp;rft.au=Impens%2C+Francis&amp;rft.au=Laukens%2C+Kris&amp;rft.au=Martens%2C+Lennart&amp;rft.au=Staes%2C+An&amp;rft.au=Tabb%2C+David+L.&amp;rft.au=Timmerman%2C+Evy&amp;rft.aufirst=Wout&amp;rft.aulast=Bittremieux&amp;rft.date=2018-09&amp;rft.genre=article&amp;rft.issn=1098-2787&amp;rft.issue=5&amp;rft.jtitle=Mass+Spectrometry+Reviews&amp;rft.pages=697-711&amp;rft.volume=37&amp;rft_id=https%3A%2F%2Fpubmed.ncbi.nlm.nih.gov%2F28802010%2F&amp;rft_id=info%3Adoi%2F10.1002%2Fmas.21544&amp;rft_id=info%3Apmid%2F28802010&amp;rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal" class="Z3988"><span style="display:none;">&#160;</span></span></span> </li> <li id="cite_note-8"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-8">↑</a></span> <span class="reference-text"><span id="CITAREFChenHouTannerCheng2020-04-20" class="citation publicación">Chen, Chen; Hou, Jie; Tanner, John J.; Cheng, Jianlin (20 de abril de 2020). <a rel="nofollow" class="external text" href="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32326049/">«Bioinformatics Methods for Mass Spectrometry-Based Proteomics Data Analysis»</a>. <i>International Journal of Molecular Sciences</i> <b>21</b> (8): E2873. <small><a href="/wiki/ISSN" class="mw-redirect" title="ISSN">ISSN</a>&#160;<a rel="nofollow" class="external text" href="//portal.issn.org/resource/issn/1422-0067">1422-0067</a></small>. <small><a href="/wiki/PubMed_Central" title="PubMed Central">PMC</a>&#160;<a rel="nofollow" class="external text" href="//www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7216093">7216093</a></small>. <small><a href="/wiki/PubMed_Identifier" class="mw-redirect" title="PubMed Identifier">PMID</a>&#160;<a rel="nofollow" class="external text" href="//www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/32326049">32326049</a></small>. <small><a href="/wiki/Digital_object_identifier" class="mw-redirect" title="Digital object identifier">doi</a>:<a rel="nofollow" class="external text" href="https://dx.doi.org/10.3390%2Fijms21082873">10.3390/ijms21082873</a></small><span class="reference-accessdate">. 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(2015). <a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.openscienceonline.com/journal/archive2?journalId=705&amp;paperId=2496"><i>Can Bioinformatics Be Considered as an Experimental Biological Science?</i></a> <span style="color:var(--color-subtle, #555 );">(en inglés)</span><span class="reference-accessdate">. Consultado el 21 de septiembre de 2015</span>.</span><span title="ctx_ver=Z39.88-2004&amp;rfr_id=info%3Asid%2Fes.wikipedia.org%3ABiolog%C3%ADa+computacional&amp;rft.au=Ilzins%2C+O.%2C+Isea%2C+R.+and+Hoebeke%2C+J.&amp;rft.aulast=Ilzins%2C+O.%2C+Isea%2C+R.+and+Hoebeke%2C+J.&amp;rft.btitle=Can+Bioinformatics+Be+Considered+as+an+Experimental+Biological+Science%3F&amp;rft.date=2015&amp;rft.genre=book&amp;rft_id=http%3A%2F%2Fwww.openscienceonline.com%2Fjournal%2Farchive2%3FjournalId%3D705%26paperId%3D2496&amp;rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Abook" class="Z3988"><span style="display:none;">&#160;</span></span></li> <li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://cnls.lanl.gov/q-bio/">The First q-bio Conference on Cellular Information Processing</a> - Conferencias en Santa Fe (NM) (8-11 de agosto de 2007), centradas en el modelado de sistemas y experimentación cuantitativa de regulación génica y transducción de señales.</li> <li><a rel="nofollow" class="external free" href="http://www.embnet.org/">http://www.embnet.org/</a> La primera red bioinformática cumple 20 años en 2008.</li> <li><a rel="nofollow" class="external text" href="https://web.archive.org/web/20080601064746/http://www.physiome.ox.ac.uk/">The Wellcome Trust Heart Physiome Project</a> - Enlaces.</li> <li><a rel="nofollow" class="external text" href="https://web.archive.org/web/20080908002039/http://compbiol.plosjournals.org/">PLoS Computational Biology</a> - Publicación de acceso libre con revisión por pares.</li> <li><a rel="nofollow" class="external text" href="http://computationalbiologynews.blogspot.com/">Computational Biology News</a></li> <li><a rel="nofollow" class="external text" href="https://web.archive.org/web/20080227003124/http://bioinf.cs.auckland.ac.nz/">Computational Biology and Evolution</a> — Una mezcla emocionante de computación, biología evolutiva y otras cosas importantes.</li></ul> <style data-mw-deduplicate="TemplateStyles:r161257576">.mw-parser-output .mw-authority-control{margin-top:1.5em}.mw-parser-output .mw-authority-control .navbox table{margin:0}.mw-parser-output .mw-authority-control .navbox hr:last-child{display:none}.mw-parser-output .mw-authority-control .navbox+.mw-mf-linked-projects{display:none}.mw-parser-output .mw-authority-control .mw-mf-linked-projects{display:flex;padding:0.5em;border:1px solid var(--border-color-base,#a2a9b1);background-color:var(--background-color-neutral,#eaecf0);color:var(--color-base,#202122)}.mw-parser-output .mw-authority-control .mw-mf-linked-projects ul li{margin-bottom:0}.mw-parser-output .mw-authority-control .navbox{border:1px solid var(--border-color-base,#a2a9b1);background-color:var(--background-color-neutral-subtle,#f8f9fa)}.mw-parser-output .mw-authority-control .navbox-list{border-color:#f8f9fa}.mw-parser-output .mw-authority-control .navbox th{background-color:#eeeeff}html.skin-theme-clientpref-night .mw-parser-output .mw-authority-control .mw-mf-linked-projects{border:1px solid var(--border-color-base,#72777d);background-color:var(--background-color-neutral,#27292d);color:var(--color-base,#eaecf0)}html.skin-theme-clientpref-night .mw-parser-output .mw-authority-control .navbox{border:1px solid var(--border-color-base,#72777d)!important;background-color:var(--background-color-neutral-subtle,#202122)!important}html.skin-theme-clientpref-night .mw-parser-output .mw-authority-control .navbox-list{border-color:#202122!important}html.skin-theme-clientpref-night .mw-parser-output .mw-authority-control .navbox th{background-color:#27292d!important}@media(prefers-color-scheme:dark){html.skin-theme-clientpref-os .mw-parser-output .mw-authority-control .mw-mf-linked-projects{border:1px solid var(--border-color-base,#72777d)!important;background-color:var(--background-color-neutral,#27292d)!important;color:var(--color-base,#eaecf0)!important}html.skin-theme-clientpref-os .mw-parser-output .mw-authority-control .navbox{border:1px solid 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style="white-space:nowrap;"><span typeof="mw:File"><a href="/wiki/Wikidata" title="Wikidata"><img alt="Wd" src="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/ff/Wikidata-logo.svg/20px-Wikidata-logo.svg.png" decoding="async" width="20" height="11" class="mw-file-element" srcset="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/ff/Wikidata-logo.svg/30px-Wikidata-logo.svg.png 1.5x, //upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/ff/Wikidata-logo.svg/40px-Wikidata-logo.svg.png 2x" data-file-width="1050" data-file-height="590" /></a></span> Datos:</span> <span class="uid"><a href="https://www.wikidata.org/wiki/Q177005" class="extiw" title="wikidata:Q177005">Q177005</a></span></li> <li><span style="white-space:nowrap;"><span typeof="mw:File"><a href="/wiki/Wikimedia_Commons" title="Commonscat"><img alt="Commonscat" src="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4a/Commons-logo.svg/15px-Commons-logo.svg.png" decoding="async" width="15" height="20" class="mw-file-element" srcset="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4a/Commons-logo.svg/23px-Commons-logo.svg.png 1.5x, //upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4a/Commons-logo.svg/30px-Commons-logo.svg.png 2x" data-file-width="1024" data-file-height="1376" /></a></span> Multimedia:</span> <span class="uid"><span class="plainlinks"><a class="external text" href="https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Bioinformatics">Bioinformatics</a></span> / <span class="plainlinks"><a class="external text" href="https://commons.wikimedia.org/wiki/Special:MediaSearch?type=image&amp;search=%22Q177005%22">Q177005</a></span></span></li></ul> <hr /> <ul><li><b>Identificadores</b></li> <li><span style="white-space:nowrap;"><a href="/wiki/Biblioteca_Nacional_de_la_Rep%C3%BAblica_Checa" title="Biblioteca Nacional de la República Checa">NKC</a>:</span> <span class="uid"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://aleph.nkp.cz/F/?func=find-c&amp;local_base=aut&amp;ccl_term=ica=ph309636">ph309636</a></span></li> <li><b>Diccionarios y enciclopedias</b></li> <li><span style="white-space:nowrap;"><a href="/wiki/Enciclopedia_Brit%C3%A1nica" title="Enciclopedia Británica">Britannica</a>:</span> <span class="uid"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.britannica.com/science/computational-biology">url</a></span></li> <li><b>Identificadores médicos</b></li> <li><span style="white-space:nowrap;"><a href="/wiki/Medical_Subject_Headings" title="Medical Subject Headings">MeSH</a>:</span> <span class="uid"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://meshb.nlm.nih.gov/record/ui?ui=D019295">D019295</a></span></li> <li><span style="white-space:nowrap;">UMLS:</span> <span class="uid"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://ncim-stage.nci.nih.gov/ncimbrowser/ConceptReport.jsp?dictionary=NCI%20Metathesaurus&amp;code=C1140695">C1140695</a></span></li></ul> </div></td></tr></tbody></table></div><div class="mw-mf-linked-projects hlist"> <ul><li><span style="white-space:nowrap;"><span typeof="mw:File"><a href="/wiki/Wikidata" title="Wikidata"><img alt="Wd" src="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/ff/Wikidata-logo.svg/20px-Wikidata-logo.svg.png" decoding="async" width="20" height="11" class="mw-file-element" srcset="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/ff/Wikidata-logo.svg/30px-Wikidata-logo.svg.png 1.5x, //upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/ff/Wikidata-logo.svg/40px-Wikidata-logo.svg.png 2x" data-file-width="1050" data-file-height="590" /></a></span> Datos:</span> <span class="uid"><a href="https://www.wikidata.org/wiki/Q177005" class="extiw" title="wikidata:Q177005">Q177005</a></span></li> <li><span style="white-space:nowrap;"><span typeof="mw:File"><a href="/wiki/Wikimedia_Commons" title="Commonscat"><img alt="Commonscat" src="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4a/Commons-logo.svg/15px-Commons-logo.svg.png" decoding="async" width="15" height="20" class="mw-file-element" srcset="//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4a/Commons-logo.svg/23px-Commons-logo.svg.png 1.5x, //upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/4a/Commons-logo.svg/30px-Commons-logo.svg.png 2x" data-file-width="1024" data-file-height="1376" /></a></span> Multimedia:</span> <span class="uid"><span class="plainlinks"><a class="external text" href="https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Bioinformatics">Bioinformatics</a></span> / <span class="plainlinks"><a class="external text" href="https://commons.wikimedia.org/wiki/Special:MediaSearch?type=image&amp;search=%22Q177005%22">Q177005</a></span></span></li></ul> </div></div> <!-- NewPP limit report Parsed by mw‐web.eqiad.main‐64476968cd‐c6dbj Cached time: 20241102135726 Cache expiry: 2592000 Reduced expiry: false Complications: [show‐toc] CPU time usage: 0.361 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