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<!doctype html> <html lang="ja" dir="ltr" class="docs-wrapper plugin-docs plugin-id-default docs-version-current docs-doc-page docs-doc-id-guides/top" data-has-hydrated="false"> <head> <meta charset="UTF-8"> <meta name="generator" content="Docusaurus v3.6.3"> <title data-rh="true">遺伝研スーパーコンピュータシステム | NIG supercomputer</title><meta data-rh="true" name="viewport" content="width=device-width,initial-scale=1"><meta data-rh="true" name="twitter:card" content="summary_large_image"><meta data-rh="true" property="og:image" content="http://192.168.11.50/~oogasawa/nigsc_homepage3/img/docusaurus-social-card.jpg"><meta data-rh="true" name="twitter:image" content="http://192.168.11.50/~oogasawa/nigsc_homepage3/img/docusaurus-social-card.jpg"><meta data-rh="true" property="og:url" content="http://192.168.11.50/~oogasawa/nigsc_homepage3/"><meta data-rh="true" property="og:locale" content="ja"><meta data-rh="true" property="og:locale:alternate" content="en"><meta data-rh="true" 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class="breadcrumbs__item"><span class="breadcrumbs__link">システム構成</span><meta itemprop="position" content="1"></li><li itemscope="" itemprop="itemListElement" itemtype="https://schema.org/ListItem" class="breadcrumbs__item breadcrumbs__item--active"><span class="breadcrumbs__link" itemprop="name">トップページ</span><meta itemprop="position" content="2"></li></ul></nav><div class="tocCollapsible_ETCw theme-doc-toc-mobile tocMobile_ITEo"><button type="button" class="clean-btn tocCollapsibleButton_TO0P">On this page</button></div><div class="theme-doc-markdown markdown"><header><h1>遺伝研スーパーコンピュータシステム</h1></header><p>国立遺伝学研究所は生命・医学系研究における情報処理のための大規模計算基盤として、大規模クラスタ型計算機・大規模メモリ共有型計算機・大容量高速ディスク装置を備えた最新鋭のスーパーコンピュータシステムサービスを提供しています。</p> <p><img decoding="async" loading="lazy" alt="top_image2" src="/~oogasawa/nigsc_homepage3/assets/images/top_image2-ba13e11bd9079ceeda752e9aa200a6bf.png" width="725" height="233" class="img_ev3q"></p> <img 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<p>ディスク容量が逼迫しているためユーザーホームディレクトリ内のデータについて当研究所ではバックアップを取っておりません。利用者の責任においてバックアップを取っていただくようお願いいたします。</p> <div class="clearfix"></div> <h2 class="anchor anchorWithStickyNavbar_LWe7" id="featured-news">重要なお知らせ<a href="#featured-news" class="hash-link" aria-label="見出しへの直接リンク" title="見出しへの直接リンク"></a></h2> <ul> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/blog/2024-12-13-scheduled-maintenance">2024年12月13日～12月19日法定停電に伴い、定期メンテナンスを行います</a>　(2024.11.06) 🆕</li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/blog/2024-10-25-account_system_maintenance">⚠ アカウント申請システムのメンテナンスを行います</a> (2024.10.25) 🆕</li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/blog/2024-09-04-Lustre8_maintenance">(終了) Lustre8で緊急メンテナンスを行います</a> (2024.09.04)</li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/blog/2024-07-08-news_medium-ubuntu-q">MediumノードのUbuntu Linuxへの一部移行とGride Engineキュー(medium-ubuntu.q)新設をしました</a> (2024.07.08)</li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/blog/2024-07-01-news_renewal-date-extended">(終了) 2023年度年度末アカウント継続申請の申請受付期限を、2024年7月31日(水)まで延長しました</a> (2024.07.01)</li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/blog/2024-06-24-important_notice_2024_April-July">遺伝研スパコンからの重要なお知らせ : 2024年第1期(4～7月)</a> (2024.06.24)</li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/guides/ISMS_Certificate">ISMS 認証(ISO27001)を取得しました</a> (2023.11.22)</li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/advanced_guides/advanced_guide_2023#%E3%82%AA%E3%83%9F%E3%82%AF%E3%82%B9%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%82%B0%E3%83%A9%E3%83%95%E5%8C%96%E3%83%84%E3%83%BC%E3%83%AB-rias%25EF%25B8%258F-visualization%20%E3%81%AE-%E6%8F%90%E4%BE%9B%E3%82%92%E5%A7%8B%E3%82%81%E3%81%BE%E3%81%97%E3%81%9F">オミクスデータグラフ化ツール「RIAS®️ Visualization」の提供を始めました</a> (2023.10.26)</li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/blog/2023-08-04-news_GPU_slurm">個人ゲノム解析区画で使用可能な GPU 専用 Slurm パーティションを新設しました</a>　(2023.08.04)</li> </ul> <h2 class="anchor anchorWithStickyNavbar_LWe7" id="year-end-renewals">年度末アカウント継続申請について<a href="#year-end-renewals" class="hash-link" aria-label="見出しへの直接リンク" title="見出しへの直接リンク"></a></h2> <p>例年通り年度末アカウント継続申請の受付を行っています。<strong>6月30日を過ぎると、ホームディレクトを削除しますのでご注意願います。</strong></p> <ul> <li>1月4日から、その年度の年度末アカウント継続申請を受け付けます。3月31日までに年度末アカウント継続申請を行ってください。</li> <li>3月31日までに年度末アカウント継続申請を行わなかった場合は、4月1日からログインできなくなります。 <ul> <li>4月1日以降でも、年度末アカウント継続申請はできます。申請すると、ログインできるようになります。</li> <li><strong>現在のアカウント継続申請システムは、アカウント停止状態の際にアカウント継続システムにログインできません。年度末アカウントの継続申請をご希望の場合は、お手数ですが<a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/application/reference">問い合わせ先窓口までご連絡ください</a>。</strong></li> </ul> </li> <li>6月30日を過ぎると、ホームディレクトを削除します。 <ul> <li>6月30日以降でも、年度末アカウント継続申請はできますが、データはすべて無くなっています。ご了承ください。</li> </ul> </li> </ul> <h2 class="anchor anchorWithStickyNavbar_LWe7" id="next-gen-supercomputer">次期遺伝研スパコンへのリプレースのお知らせ<a href="#next-gen-supercomputer" class="hash-link" aria-label="見出しへの直接リンク" title="見出しへの直接リンク"></a></h2> <p>2024年度末に次期遺伝研スーパーコンピュータシステムへのリプレースを行います。現在の遺伝研スパコンは2025年2月28日までの契約になっています。次期遺伝研スパコンは 2025年3月1日より稼働開始予定です。リプレースに伴い、2025年2月後半に遺伝研スパコンが利用できなくなる時期が1週間程度生じる見込みです。詳細は開札後の2024年11月末ごろに掲載予定です。</p> <h2 class="anchor anchorWithStickyNavbar_LWe7" id="2024-annual-maintenance">2024 年度の定期メンテナンス等<a href="#2024-annual-maintenance" class="hash-link" aria-label="見出しへの直接リンク" title="見出しへの直接リンク"></a></h2> <p><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/blog/2024-12-13-scheduled-maintenance">2024年度の定期メンテナンスは、2024年12月13日-12月19日に行います。</a></p> <p>以下は例年通りの実施となります。</p> <ul> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/application/renewal">2024 年 6 月 30 日 : 年度末更アカウント継続申請をしていないユーザのアカウント削除</a></li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/application/invoice/#issuing-invoices">2024 年 7 月 31 日 : 課金サービス第 1 期締め日</a></li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/application/invoice/#issuing-invoices">2024 年 11 月 30 日 : 課金サービス第 2 期締め日</a></li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/application/invoice/#issuing-invoices">2024 年 12 月 31 日 : 課金を伴う計画の変更締め切り。</a></li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/application/renewal">2025 年 1 月 4 日より年度末アカウント継続申請を受け付けます。</a></li> <li><a href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/application/resource_extension">2025 年 1 月 4 日より次年度の利用計画表を受け付けます。</a></li> </ul> <h2 class="anchor anchorWithStickyNavbar_LWe7" id="temporary-registration">2022 年 5 月 13 日(金) 個人ゲノム解析区画および一般解析区画大規模ユーザのアカウントの新規登録受付の一時停止<a href="#temporary-registration" class="hash-link" aria-label="見出しへの直接リンク" title="見出しへの直接リンク"></a></h2> <p>平素より、遺伝研スパコンをご利用いただき誠にありがとうございます。</p> <p>現在、スパコンの計算リソースが CPU,ディスクとも非常に逼迫しているため、以下のユーザのアカウントの新規登録を一時停止させていただきます。</p> <ul> <li>一般解析区画の大規模利用ユーザのアカウントの新規登録</li> <li>個人ゲノム解析区画ユーザのアカウントの新規登録</li> </ul> <p>以下の申請についてはこれまで通り受け付けます。</p> <ul> <li>現在すでに一般解析区画の大規模利用ユーザである方々、個人ゲノム解析区画のユーザである方々に付きましては、利用計画表の変更による利用リソースの追加はこれまで通り受け付けます。</li> <li>また、一般解析区画の通常のユーザー登録についてもこれまで通り受け付けます。その場合はディスクは初期設定の 1TB までの利用となります。</li> <li>講習会などでの利用ついてもこれまで通り受け付けます。</li> </ul> <p>その場合も、ご希望に添えない場合がありますのでご了承いただけますようお願いいたします。</p> <p>アカウントの新規登録受付の再開時期につきましては、計算リソースの空き状況を見ながら決めていくこととなります。４ヶ月ごとの空き状況の見通しを随時ホームページから公開しますので、利用を希望される方は空き状況の見通しを参考に、予め利用計画表を提出してください。ただし、空き状況は確定ではありませんのでご希望に添えない場合がありますのでご了承願います。</p> <h2 class="anchor anchorWithStickyNavbar_LWe7" id="acknowledgement">謝辞について<a href="#acknowledgement" class="hash-link" aria-label="見出しへの直接リンク" title="見出しへの直接リンク"></a></h2> <p>遺伝研スーパーコンピュータシステムの活動は皆様の謝辞で評価されています。当スーパーコンピュータシステムを利用した論文が採択された際には以下の記載例を参考に謝辞への記載をお願いします。</p> <p>記載例</p> <div class="codeBlockContainer_Ckt0 theme-code-block" style="--prism-color:#393A34;--prism-background-color:#f6f8fa"><div class="codeBlockContent_biex"><pre tabindex="0" class="prism-code language-text codeBlock_bY9V thin-scrollbar" style="color:#393A34;background-color:#f6f8fa"><code class="codeBlockLines_e6Vv"><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain">==============================================</span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain" style="display:inline-block"></span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain">　　＜謝辞　英語＞</span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain">　　Computations were partially performed on the NIG supercomputer</span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain">　　at ROIS National Institute of Genetics.</span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain" style="display:inline-block"></span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain">==============================================</span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain" style="display:inline-block"></span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain">　　＜謝辞　日本語＞</span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain">　　本研究は、情報・システム研究機構国立遺伝学研究所が</span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain"> 有する遺伝研スーパーコンピュータシステムを利用しました。</span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain" style="display:inline-block"></span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain">================================================</span><br></span><span class="token-line" style="color:#393A34"><span class="token plain" style="display:inline-block"></span><br></span></code></pre><div class="buttonGroup__atx"><button type="button" aria-label="クリップボードにコードをコピー" title="コピー" class="clean-btn"><span class="copyButtonIcons_eSgA" aria-hidden="true"><svg viewBox="0 0 24 24" class="copyButtonIcon_y97N"><path fill="currentColor" d="M19,21H8V7H19M19,5H8A2,2 0 0,0 6,7V21A2,2 0 0,0 8,23H19A2,2 0 0,0 21,21V7A2,2 0 0,0 19,5M16,1H4A2,2 0 0,0 2,3V17H4V3H16V1Z"></path></svg><svg viewBox="0 0 24 24" class="copyButtonSuccessIcon_LjdS"><path fill="currentColor" d="M21,7L9,19L3.5,13.5L4.91,12.09L9,16.17L19.59,5.59L21,7Z"></path></svg></span></button></div></div></div></div><footer class="theme-doc-footer docusaurus-mt-lg"><div class="row margin-top--sm theme-doc-footer-edit-meta-row"><div class="col"></div><div class="col lastUpdated_JAkA"><span class="theme-last-updated"><b><time datetime="2024-11-20T08:01:53.000Z" itemprop="dateModified">2024年11月20日</time></b>に最終更新</span></div></div></footer></article><nav class="pagination-nav docusaurus-mt-lg" aria-label="ドキュメントのナビゲーション"><a class="pagination-nav__link pagination-nav__link--next" href="/~oogasawa/nigsc_homepage3/guides/security-policy"><div class="pagination-nav__sublabel">次へ</div><div class="pagination-nav__label">情報セキュリティ方針 (ISO27001)</div></a></nav></div></div><div class="col col--3"><div class="tableOfContents_bqdL thin-scrollbar theme-doc-toc-desktop"><ul class="table-of-contents table-of-contents__left-border"><li><a href="#featured-news" class="table-of-contents__link toc-highlight">重要なお知らせ</a></li><li><a href="#year-end-renewals" class="table-of-contents__link toc-highlight">年度末アカウント継続申請について</a></li><li><a href="#next-gen-supercomputer" class="table-of-contents__link toc-highlight">次期遺伝研スパコンへのリプレースのお知らせ</a></li><li><a href="#2024-annual-maintenance" class="table-of-contents__link toc-highlight">2024 年度の定期メンテナンス等</a></li><li><a href="#temporary-registration" class="table-of-contents__link toc-highlight">2022 年 5 月 13 日(金) 個人ゲノム解析区画および一般解析区画大規模ユーザのアカウントの新規登録受付の一時停止</a></li><li><a href="#acknowledgement" class="table-of-contents__link toc-highlight">謝辞について</a></li></ul></div></div></div></div></main></div></div></div><footer class="footer"><div class="container container-fluid"><div class="row footer__links"><div class="col footer__col"><div class="footer__title">検索</div><ul class="footer__items clean-list"><li class="footer__item"><a href="http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/top-j.html" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="footer__link-item">getentry<svg width="13.5" height="13.5" aria-hidden="true" viewBox="0 0 24 24" class="iconExternalLink_nPIU"><path fill="currentColor" d="M21 13v10h-21v-19h12v2h-10v15h17v-8h2zm3-12h-10.988l4.035 4-6.977 7.07 2.828 2.828 6.977-7.07 4.125 4.172v-11z"></path></svg></a></li><li class="footer__item"><a href="https://www.ddbj.nig.ac.jp/services/arsa.html" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="footer__link-item">ARSA<svg width="13.5" height="13.5" aria-hidden="true" viewBox="0 0 24 24" class="iconExternalLink_nPIU"><path fill="currentColor" d="M21 13v10h-21v-19h12v2h-10v15h17v-8h2zm3-12h-10.988l4.035 4-6.977 7.07 2.828 2.828 6.977-7.07 4.125 4.172v-11z"></path></svg></a></li><li class="footer__item"><a href="https://ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="footer__link-item">DRASearch<svg width="13.5" height="13.5" aria-hidden="true" viewBox="0 0 24 24" class="iconExternalLink_nPIU"><path fill="currentColor" d="M21 13v10h-21v-19h12v2h-10v15h17v-8h2zm3-12h-10.988l4.035 4-6.977 7.07 2.828 2.828 6.977-7.07 4.125 4.172v-11z"></path></svg></a></li></ul></div><div class="col footer__col"><div class="footer__title">データベース</div><ul class="footer__items clean-list"><li class="footer__item"><a href="https://www.ddbj.nig.ac.jp/ddbj/index.html" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="footer__link-item">Annotated/Assembled Sequences (DDBJ)<svg width="13.5" height="13.5" aria-hidden="true" viewBox="0 0 24 24" class="iconExternalLink_nPIU"><path fill="currentColor" d="M21 13v10h-21v-19h12v2h-10v15h17v-8h2zm3-12h-10.988l4.035 4-6.977 7.07 2.828 2.828 6.977-7.07 4.125 4.172v-11z"></path></svg></a></li><li class="footer__item"><a href="https://www.ddbj.nig.ac.jp/dra/index.html" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="footer__link-item">Sequence Read Archive (DRA)<svg width="13.5" height="13.5" aria-hidden="true" viewBox="0 0 24 24" class="iconExternalLink_nPIU"><path fill="currentColor" d="M21 13v10h-21v-19h12v2h-10v15h17v-8h2zm3-12h-10.988l4.035 4-6.977 7.07 2.828 2.828 6.977-7.07 4.125 4.172v-11z"></path></svg></a></li><li class="footer__item"><a href="https://www.ddbj.nig.ac.jp/jga/index.html" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="footer__link-item">Japanese Genotype-phenotype Archive (JGA)<svg width="13.5" height="13.5" aria-hidden="true" viewBox="0 0 24 24" class="iconExternalLink_nPIU"><path fill="currentColor" d="M21 13v10h-21v-19h12v2h-10v15h17v-8h2zm3-12h-10.988l4.035 4-6.977 7.07 2.828 2.828 6.977-7.07 4.125 4.172v-11z"></path></svg></a></li><li class="footer__item"><a href="https://ddbj.nig.ac.jp/D-way/" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="footer__link-item">Submission portal D-way<svg width="13.5" height="13.5" aria-hidden="true" viewBox="0 0 24 24" class="iconExternalLink_nPIU"><path fill="currentColor" d="M21 13v10h-21v-19h12v2h-10v15h17v-8h2zm3-12h-10.988l4.035 4-6.977 7.07 2.828 2.828 6.977-7.07 4.125 4.172v-11z"></path></svg></a></li></ul></div><div class="col footer__col"><div class="footer__title">スパコン</div><ul class="footer__items clean-list"><li class="footer__item"><a href="https://sc.ddbj.nig.ac.jp" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="footer__link-item">NIG Supercomputer<svg width="13.5" height="13.5" aria-hidden="true" viewBox="0 0 24 24" class="iconExternalLink_nPIU"><path fill="currentColor" d="M21 13v10h-21v-19h12v2h-10v15h17v-8h2zm3-12h-10.988l4.035 4-6.977 7.07 2.828 2.828 6.977-7.07 4.125 4.172v-11z"></path></svg></a></li></ul></div></div><div class="footer__bottom text--center"><div class="footer__copyright">Copyright © 2024 National Institute of Genetics.</div></div></div></footer></div> </body> </html>