CINXE.COM
RCSB PDB - 2DLN: VANCOMYCIN RESISTANCE: STRUCTURE OF D-ALANINE:D-ALANINE LIGASE AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION
<!DOCTYPE html><html lang="en"><head><script src="https://www.googletagmanager.com/gtag/js?id=G-5JMGYPWJRR" async></script><script>//- global rcsb-config object var RC = { googleAnalyticsTrackingId: 'UA-3923365-3' , instance: 'production' , isProductionServer: true , dataUrl: 'https://data.rcsb.org/' , searchUrl: 'https://search.rcsb.org/rcsbsearch/v2/' , alignmentHost: 'https://alignment.rcsb.org' , alignmentUrl: 'https://alignment.rcsb.org/api/v1/' , fileStorageUrl: 'https://user-upload.rcsb.org/v1/' , fileStoragePutEndpoint: 'putMultipart' , fileStorageGetEndpoint: 'download' , sequenceCoordinatesUrl: 'https://1d-coordinates.rcsb.org/' , internalAnalyticsOriginHeaderKey: 'Rcsb-Analytics-Traffic-Origin' , internalAnalyticsOriginHeaderValue: 'internal' , internalAnalyticsStageHeaderKey: 'Rcsb-Analytics-Traffic-Stage' , internalAnalyticsStageHeaderValue: 'production' , MOLSTAR_IMG_URL: 'https://cdn.rcsb.org/images/structures/' }; </script><script src="/search/search-data?ts=5774771"></script><script src="/js/search/react-search.js?ts=5774771"></script><script>!function(){if("performance"in window==0&&(window.performance={}),Date.now=Date.now||function(){return(new Date).getTime()},"now"in window.performance==0){var n=Date.now();performance.timing&&performance.timing.navigationStart&&(n=performance.timing.navigationStart),window.performance.now=function(){return Date.now()-n}}}();(function(){var h="undefined"!=typeof window&&window===this?this:"undefined"!=typeof global&&null!=global?global:this,k="function"==typeof Object.defineProperties?Object.defineProperty:function(a,b,c){a!=Array.prototype&&a!=Object.prototype&&(a[b]=c.value)};function l(){l=function(){};h.Symbol||(h.Symbol=m)}var n=0;function m(a){return"jscomp_symbol_"+(a||"")+n++} function p(){l();var a=h.Symbol.iterator;a||(a=h.Symbol.iterator=h.Symbol("iterator"));"function"!=typeof Array.prototype[a]&&k(Array.prototype,a,{configurable:!0,writable:!0,value:function(){return q(this)}});p=function(){}}function q(a){var b=0;return r(function(){return b<a.length?{done:!1,value:a[b++]}:{done:!0}})}function r(a){p();a={next:a};a[h.Symbol.iterator]=function(){return this};return a}function t(a){p();var b=a[Symbol.iterator];return b?b.call(a):q(a)} function u(a){if(!(a instanceof Array)){a=t(a);for(var b,c=[];!(b=a.next()).done;)c.push(b.value);a=c}return a}var v=0;function w(a,b){var c=XMLHttpRequest.prototype.send,d=v++;XMLHttpRequest.prototype.send=function(f){for(var e=[],g=0;g<arguments.length;++g)e[g-0]=arguments[g];var E=this;a(d);this.addEventListener("readystatechange",function(){4===E.readyState&&b(d)});return c.apply(this,e)}} function x(a,b){var c=fetch;fetch=function(d){for(var f=[],e=0;e<arguments.length;++e)f[e-0]=arguments[e];return new Promise(function(d,e){var g=v++;a(g);c.apply(null,[].concat(u(f))).then(function(a){b(g);d(a)},function(a){b(a);e(a)})})}}var y="img script iframe link audio video source".split(" ");function z(a,b){a=t(a);for(var c=a.next();!c.done;c=a.next())if(c=c.value,b.includes(c.nodeName.toLowerCase())||z(c.children,b))return!0;return!1} function A(a){var b=new MutationObserver(function(c){c=t(c);for(var b=c.next();!b.done;b=c.next())b=b.value,"childList"==b.type&&z(b.addedNodes,y)?a(b):"attributes"==b.type&&y.includes(b.target.tagName.toLowerCase())&&a(b)});b.observe(document,{attributes:!0,childList:!0,subtree:!0,attributeFilter:["href","src"]});return b} function B(a,b){if(2<a.length)return performance.now();var c=[];b=t(b);for(var d=b.next();!d.done;d=b.next())d=d.value,c.push({timestamp:d.start,type:"requestStart"}),c.push({timestamp:d.end,type:"requestEnd"});b=t(a);for(d=b.next();!d.done;d=b.next())c.push({timestamp:d.value,type:"requestStart"});c.sort(function(a,b){return a.timestamp-b.timestamp});a=a.length;for(b=c.length-1;0<=b;b--)switch(d=c[b],d.type){case "requestStart":a--;break;case "requestEnd":a++;if(2<a)return d.timestamp;break;default:throw Error("Internal Error: This should never happen"); }return 0}function C(a){a=a?a:{};this.w=!!a.useMutationObserver;this.u=a.minValue||null;a=window.__tti&&window.__tti.e;var b=window.__tti&&window.__tti.o;this.a=a?a.map(function(a){return{start:a.startTime,end:a.startTime+a.duration}}):[];b&&b.disconnect();this.b=[];this.f=new Map;this.j=null;this.v=-Infinity;this.i=!1;this.h=this.c=this.s=null;w(this.m.bind(this),this.l.bind(this));x(this.m.bind(this),this.l.bind(this));D(this);this.w&&(this.h=A(this.B.bind(this)))} C.prototype.getFirstConsistentlyInteractive=function(){var a=this;return new Promise(function(b){a.s=b;"complete"==document.readyState?F(a):window.addEventListener("load",function(){F(a)})})};function F(a){a.i=!0;var b=0<a.a.length?a.a[a.a.length-1].end:0,c=B(a.g,a.b);G(a,Math.max(c+5E3,b))} function G(a,b){!a.i||a.v>b||(clearTimeout(a.j),a.j=setTimeout(function(){var b=performance.timing.navigationStart,d=B(a.g,a.b),b=(window.a&&window.a.A?1E3*window.a.A().C-b:0)||performance.timing.domContentLoadedEventEnd-b;if(a.u)var f=a.u;else performance.timing.domContentLoadedEventEnd?(f=performance.timing,f=f.domContentLoadedEventEnd-f.navigationStart):f=null;var e=performance.now();null===f&&G(a,Math.max(d+5E3,e+1E3));var g=a.a;5E3>e-d?d=null:(d=g.length?g[g.length-1].end:b,d=5E3>e-d?null:Math.max(d, f));d&&(a.s(d),clearTimeout(a.j),a.i=!1,a.c&&a.c.disconnect(),a.h&&a.h.disconnect());G(a,performance.now()+1E3)},b-performance.now()),a.v=b)} function D(a){a.c=new PerformanceObserver(function(b){b=t(b.getEntries());for(var c=b.next();!c.done;c=b.next())if(c=c.value,"resource"===c.entryType&&(a.b.push({start:c.fetchStart,end:c.responseEnd}),G(a,B(a.g,a.b)+5E3)),"longtask"===c.entryType){var d=c.startTime+c.duration;a.a.push({start:c.startTime,end:d});G(a,d+5E3)}});a.c.observe({entryTypes:["longtask","resource"]})}C.prototype.m=function(a){this.f.set(a,performance.now())};C.prototype.l=function(a){this.f.delete(a)}; C.prototype.B=function(){G(this,performance.now()+5E3)};h.Object.defineProperties(C.prototype,{g:{configurable:!0,enumerable:!0,get:function(){return[].concat(u(this.f.values()))}}});var H={getFirstConsistentlyInteractive:function(a){a=a?a:{};return"PerformanceLongTaskTiming"in window?(new C(a)).getFirstConsistentlyInteractive():Promise.resolve(null)}}; "undefined"!=typeof module&&module.exports?module.exports=H:"function"===typeof define&&define.amd?define("ttiPolyfill",[],function(){return H}):window.ttiPolyfill=H;})();function gtag(){dataLayer.push(arguments)}var logger=function(){"use strict";function n(n){if(n=JSON.stringify(n),"sendBeacon"in navigator)navigator.sendBeacon(t,n);else{var e=new XMLHttpRequest;e.open("POST",t,!1),e.setRequestHeader("Content-Type","text/plain;charset=UTF-8"),e.send(n)}}function e(e,t,i){if(!RC.isProductionServer)switch(e){case"error":case"warn":case"info":i?console[e](t,i):console[e](t);break;default:console.log(t,i)}"error"!==e&&"warn"!==e||(r.push({level:e,msg:t||"",info:Object.assign({},i,{path:window.location.pathname,userAgent:navigator.userAgent})}),r.length>=o&&n(r.splice(0,o)))}var t="/analytics",o=10,r=[];return window.addEventListener("unload",function(){n(r)},!1),{stack:Function.prototype.bind.call(function(n){n&&e("error",n.name+': "'+n.message+'"',{type:n.name,description:n.message,trace:n.stack})}),error:Function.prototype.bind.call(function(n,t){e("error",n,t)}),warn:Function.prototype.bind.call(function(n,t){e("warn",n,t)}),info:Function.prototype.bind.call(function(n,t){e("info",n,t)}),verbose:Function.prototype.bind.call(function(n,t){e("verbose",n,t)}),debug:Function.prototype.bind.call(function(n,t){e("debug",n,t)}),silly:Function.prototype.bind.call(function(n,t){e("silly",n,t)})}}();window.dataLayer=window.dataLayer||[],gtag("js",new Date),gtag("config","G-5JMGYPWJRR"),window.addEventListener("error",function(n){logger.stack(n.error)}),window.addEventListener("unhandledrejection",function(n){n&&n.reason&&logger.error('Unhandled promise rejection: "'+n.reason.message+'"',{type:"PromiseRejection",description:n.reason.message,trace:n.reason.stack})});var gtagFirstMeaningfulPaint=function(){var n=!1;return function(){n?logger.warn('Timing for "firstMeaningfulPaint" already sent'):(console.log("firstMeaningfulPaint",Math.round(performance.now())),n=!0)}}();!function(){"use strict";var n=0;if("PerformanceObserver"in window&&"PerformancePaintTiming"in window){new PerformanceObserver(function(e){e.getEntries().forEach(function(e){if(0===n){e.startTime,e.duration}})}).observe({entryTypes:["paint"]});var e=window.__tti={e:[]};e.o=new PerformanceObserver(function(n){e.e=e.e.concat(n.getEntries())}),e.o.observe({entryTypes:["longtask"]}),ttiPolyfill.getFirstConsistentlyInteractive({}).then(function(n){});new PerformanceObserver(function(n){n.getEntries().forEach(function(n){var e=n.attribution[0]||{},t={containerType:e.containerType,containerName:e.containerName,containerId:e.containerId,containerSrc:e.containerSrc,frameOrigin:n.name,durationMs:n.duration,startTimeMs:n.startTime};n.duration>500&&logger.warn("Long running task, duration "+n.duration.toFixed(2)+"ms.",t)})}).observe({entryTypes:["longtask"]})}var t=performance.now();window.addEventListener("visibilitychange",function(){document.hidden?t=performance.now():n+=performance.now()-t}),window.addEventListener("load",function(){performance.now()}),window.addEventListener("DOMContentLoaded",function(){performance.now()})}();</script><title>RCSB PDB - 2DLN: VANCOMYCIN RESISTANCE: STRUCTURE OF D-ALANINE:D-ALANINE LIGASE AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION</title><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8"><meta property="og:title" content="RCSB PDB - 2DLN: VANCOMYCIN RESISTANCE: STRUCTURE OF D-ALANINE:D-ALANINE LIGASE AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION"><meta property="og:description" content="VANCOMYCIN RESISTANCE: STRUCTURE OF D-ALANINE:D-ALANINE LIGASE AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION"><meta property="og:image" content="https://cdn.rcsb.org/images/structures/2dln_assembly-1.jpeg"><meta name="twitter:card" content="summary_large_image"><meta name="twitter:title" content="RCSB PDB - 2DLN: VANCOMYCIN RESISTANCE: STRUCTURE OF D-ALANINE:D-ALANINE LIGASE AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION"><meta name="twitter:description" content="VANCOMYCIN RESISTANCE: STRUCTURE OF D-ALANINE:D-ALANINE LIGASE AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION"><meta name="twitter:image" content="https://cdn.rcsb.org/images/structures/2dln_assembly-1.jpeg"><meta name="description" content="VANCOMYCIN RESISTANCE: STRUCTURE OF D-ALANINE:D-ALANINE LIGASE AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION"><meta name="author" content="RCSB Protein Data Bank"><meta name="email" content="info@rcsb.org"><meta name="Charset" content="UTF-8"><meta name="Distribution" content="Global"><meta name="Rating" content="General"><meta http-equiv="content-language" content="en-US"><meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1"><meta name="theme-color" content="#5e94c3"><meta class="elastic" name="release_date" content="release.date:undef"><link rel="manifest" href="/manifest.json"><link rel="apple-touch-icon" href="/img/rcsb-apple-touch-icon.jpg"><link rel="stylesheet" href="https://cdn.rcsb.org/javascript/bootstrap/latest/css/bootstrap.min.css"><link rel="stylesheet" href="https://cdn.rcsb.org/javascript/fontawesome/latest/css/font-awesome.min.css"><link rel="stylesheet" href="/build/css/main.css"><link rel="stylesheet" href="/css/search.css?ts=5774771"><script>window.addEventListener('load', function () { // load the JIRA feedback button only after everything else has been loaded var script = document.createElement("script"); script.src = "/js/jira-fdbck.js"; script.type = "text/javascript"; document.getElementsByTagName("head")[0].appendChild(script); var link = document.createElement("link"); link.rel = "stylesheet"; link.href = "https://cdn.rcsb.org/jira-feedback/css/jira-fdbck.css"; document.getElementsByTagName("head")[0].appendChild(link); // load the ekko-lightbox css only after everything else has been loaded var link = document.createElement("link"); link.rel = "stylesheet"; link.href = "/css/ekko-lightbox.css"; document.getElementsByTagName("head")[0].appendChild(link); }); </script><script src="https://cdn.rcsb.org/javascript/jquery/jquery-3.3.1.min.js"></script><script src="https://cdn.rcsb.org/javascript/bootstrap/latest/js/bootstrap.min.js"></script><script src="/js/ekko-lightbox.min.js" defer></script><script>$(document).delegate('*[data-toggle="lightbox"]',"click",function(t){t.preventDefault(),$(this).ekkoLightbox()});$(function(){$(".nav>.dropdown").on("mouseenter",function(o){$(this).addClass("open")}),$(".nav>.dropdown").on("mouseleave",function(o){$(".dropdown").removeClass("open")}),$('[data-toggle="tooltip"]').tooltip()});</script><link rel="stylesheet" href="/css/pages/staticpages.css"><link rel="stylesheet" href="/css/structure/structuresummarypage.css"><link rel="stylesheet" href="/css/material-switch.css"><script type="text/javascript" src="/saguaro/app.js"></script><script type="text/javascript" src="/saguaro/plot.js"></script><style>.nav-tabs>li.active>a,.nav-tabs>li.active>a:focus,.nav-tabs>li.active>a:hover{color:#fff;cursor:default;background-color:#5e6973;border:1px solid #ddd;border-bottom-color:transparent}#structuretabs>li.active>a,#structuretabs>li.active>a:focus,#structuretabs>li.active>a:hover{background-color:#325880;border:1px solid transparent;border-bottom:none}#structuretabs{border-bottom:5px solid #325880}#structuretabs>li{margin-bottom:0}#structuretabs>li>a{background-color:#efeded;border-bottom:none}#navbar-collapse-SSP{padding:0;margin:0}.secondaryheader h1{float:left;margin-right:10px}.secondaryheader h4{margin-top:30px}#entitynext{margin-top:10px;background-color:#416d93}.panel-default>.panel-heading{color:#fff;background-color:#5e6973;border-color:#ddd}table .highlight td{background-color:#fff2e0}table td ul{-webkit-padding-start:15px}.noteSearchQuery{margin-bottom:0;padding:5px}.querySearchLink{font-weight:700;text-decoration:underline}table tr td button{margin:4px 1px}table thead .externalannotation>th{background-color:#f0ad4e;color:#fff;border-bottom-width:1px;font-weight:400}#structuretabs .dropdown .dropdown-menu{min-width:100%}.actionButtons{display:flex;justify-content:flex-end;margin-bottom:0}@media screen and (min-width:768px) and (max-width:991px){.actionButtons{margin-top:20px;margin-bottom:20px;justify-content:start}}@media screen and (max-width:767px){#collapsedHeader>div{padding-left:0;padding-right:0}#SSP-collapsed-tabs{background-color:#efeded;margin-top:0;border:1px solid #ccc}#navbar-collapse-SSP{width:100%;margin:0}#structuretabs{border:0}#structuretabs li{width:100%}#collapsedHeader h1{float:left;width:100%}.actionButtons{margin-top:20px;margin-bottom:20px;justify-content:center}}</style><style>td { word-break: break-word; } </style><script>var structureId = "2DLN"; console.log("CHECK: Summary Structure ID: " + structureId); var proteinNumber = 0, nonProteinNumber = 0; </script><script>proteinNumber = 1 + proteinNumber, nonProteinNumber = 0 + nonProteinNumber; </script></head><body><div data-elastic-exclude><div data-elastic-exclude><nav class="navbar navbar-inverse navbar-fixed-top hidden-print" id="nav" role="navigation"><div class="hide hidden-print" id="UnsupportedBrowser" style="width: 100%; border-bottom: 2px solid #FFA500; background-color: #FFFFFF; color: #000000; display: inline-block; font-size: .9em; line-height: 2em; text-align: center; font-weight: bold; font-style: italic;"><span class="label label-warning" style="font-size: 100%;">Warning</span> You are using a web browser that we do not support. Our website will not work properly. Please update to a newer version or download a new web browser, such as Chrome or Firefox.</div><div class="container"><div class="row pull-right"><div class="col-sm-12"><div class="input-group"> <a class="button btn btn-sm basic navbar-buttons" href="/help">Help</a><div class="button btn btn-sm basic jira-fdbck-btn navbar-buttons" id="feedbackLink-ContactUs">Contact us</div><div class="navbar-buttons hidden-xs mypdb-style" id="mypdb-menu-container"></div></div></div></div><!-- Brand and toggle get grouped for better mobile display--><div class="navbar-header"><button class="navbar-toggle pull-left" type="button" data-toggle="collapse" data-target="#navbar-collapse-RCSB"><span class="sr-only">Toggle navigation</span><span class="icon-bar"></span><span class="icon-bar"></span><span class="icon-bar"></span></button><a class="navbar-brand" href="/">RCSB PDB</a></div><div class="collapse navbar-collapse" id="navbar-collapse-RCSB" style="max-height: 420px;"><ul class="nav navbar-nav pull-left"><li class="dropdown" id="headnav_deposit"><a class="dropdown-toggle" href="#" data-toggle="dropdown" aria-expanded="false">Deposit <b class="caret"></b></a><div class="dropdown-menu multi-column" id="DepositDropdownNav"><div class="row"><div class="col-xs-12 col-sm-2 col-md-2"><ul class="dropdown-menu" id="head-deposit_prepare"><h4>Prepare Data</h4><li> <a href="https://www.wwpdb.org/deposition/preparing-pdbx-mmcif-files" rel="noopener" target="_blank">PDBx/mmCIF file</a></li><li> <a href="https://pdb-extract.wwpdb.org/" rel="noopener" target="_blank">pdb_extract</a></li><li> <a href="http://sf-tool.wwpdb.org/" rel="noopener" target="_blank">SF-Tool</a></li><li> <a href="http://ligand-expo.rcsb.org/" rel="noopener" target="_blank">Ligand Expo</a></li><li> <a href="https://sw-tools.rcsb.org/apps/MAXIT/index.html" rel="noopener" target="_blank">MAXIT</a></li></ul></div><div class="col-xs-12 col-sm-3 col-md-3"><ul class="dropdown-menu" id="head-deposit_validate"><h4>Validate Data</h4><li> <a href="https://validate-rcsb.wwpdb.org" rel="noopener" target="_blank">Validation Server</a></li><li> <a href="http://www.wwpdb.org/validation/onedep-validation-web-service-interface" rel="noopener" target="_blank">Validation API</a></li><li> <a href="http://www.wwpdb.org/documentation/journals" rel="noopener" target="_blank">Information for Journals</a></li><li> <a href="http://www.wwpdb.org/task/validation-task-forces.php" rel="noopener" target="_blank">Validation Task Forces</a></li></ul></div><div class="col-xs-12 col-sm-3 col-md-3"><ul class="dropdown-menu" id="head-deposit_deposit-data"><h4>Deposit Data</h4><li style="word-break: normal"> <a href="https://deposit.wwpdb.org/deposition/" rel="noopener" target="_blank" style="word-break: normal">wwPDB OneDep System</a></li><li style="word-break: normal"> <a href="https://pdb-dev.wwpdb.org/" rel="noopener" target="_blank" style="word-break: normal">PDB-Dev</a></li></ul></div><div class="col-xs-12 col-sm-2 col-md-3"><ul class="dropdown-menu" id="head-deposit_deposit-help"><h4>Help and Resources</h4><li> <a href="http://www.wwpdb.org/deposition/faq" rel="noopener" target="_blank">Deposit FAQ</a></li><li> <a href="http://www.wwpdb.org/validation/2017/FAQs" rel="noopener" target="_blank">Validation FAQ</a></li><li> <a href="http://www.wwpdb.org/deposition/tutorial" rel="noopener" target="_blank">Tutorials</a></li><li> <a href="http://www.wwpdb.org/documentation/policy" rel="noopener" target="_blank">Annotation Policies</a></li><li> <a href="http://www.wwpdb.org/documentation/procedure" rel="noopener" target="_blank">Processing Procedures</a></li><li> <a href="https://mmcif.wwpdb.org/" rel="noopener" target="_blank">PDBx/mmCIF Dictionary</a></li><li> <a href="https://mmcif.wwpdb.org/docs/user-guide/guide.html" rel="noopener" target="_blank">PDBx/mmCIF User Guide</a></li><li> <a href="https://www.wwpdb.org/data/ccd" rel="noopener" target="_blank">Chemical Component Dictionary</a></li><li> <a href="https://www.wwpdb.org/data/bird" rel="noopener" target="_blank">Biologically Interesting Molecule Reference Dictionary (BIRD)</a></li><li> <a href="https://biosync.sbkb.org/" rel="noopener" target="_blank">BioSync/Beamlines/Facilities</a></li><li> <a href="https://sw-tools.rcsb.org/" rel="noopener" target="_blank">Related Tools</a></li></ul></div></div></div></li><li class="dropdown" id="headnav_search"><a class="dropdown-toggle" href="#" data-toggle="dropdown">Search <b class="caret"></b></a><ul class="dropdown-menu"><li><a href="/search/advanced" rel="noopener">Advanced Search</a></li><li><a href="/search/advanced/sequence" rel="noopener">Sequence Similarity Search</a></li><li><a href="/search/advanced/structure" rel="noopener">Structure Similarity Search</a></li><li><a href="/search/advanced/chemical" rel="noopener">Chemical Similarity Search</a></li><li><a href="/chemical-sketch" rel="noopener">Chemical Sketch Tool</a></li><li><a href="/search/browse/atc" rel="noopener">Browse by Annotations</a></li><li><a href="/search?query=%7B%22parameters%22%3A%7B%22attribute%22%3A%22rcsb_accession_info.initial_release_date%22%2C%22operator%22%3A%22range%22%2C%22value%22%3A%7B%22from%22%3A%22now-1w%22%2C%22include_lower%22%3Afalse%2C%22to%22%3A%22now%22%2C%22include_upper%22%3Atrue%7D%7D%7D" rel="noopener">New Entries</a></li><li><a href="/pages/unreleased" rel="noopener">Unreleased Entries</a></li><li><a href="/stats" rel="noopener">PDB Statistics</a></li></ul></li><li class="dropdown" id="headnav_visualize"><a class="dropdown-toggle" href="#" data-toggle="dropdown">Visualize <b class="caret"></b></a><ul class="dropdown-menu"> <li><a href="/3d-view" rel="noopener">Mol* (MolStar)</a></li><li><a href="/docs/sequence-viewers/sequence-annotations-viewer" rel="noopener">Sequence Annotations Viewer</a></li><li><a href="/docs/sequence-viewers/genome-view" rel="noopener">Genome View</a></li></ul></li><li class="dropdown" id="headnav_analyze"><a class="dropdown-toggle" href="#" data-toggle="dropdown">Analyze <b class="caret"></b></a><ul class="dropdown-menu"><li><a href="/alignment" rel="noopener">Pairwise Structure Alignment</a></li><li><a href="/docs/general-help/symmetry-resources-in-the-pdb" rel="noopener">Symmetry Resources in the PDB</a></li><li><a href="https://www.wwpdb.org/validation/validation-reports" rel="noopener" target="_blank">Structure Quality </a></li><li><a href="/docs/grouping-structures/overview-grouping-structures" rel="noopener">Grouping Structures</a></li><li><a href="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb/pdb50mesh/index.html" rel="noopener" target="_blank">PDB Citation MeSH Network Explorer </a></li><li><a href="/stats" rel="noopener">PDB Statistics</a></li><li><a href="https://www.eppic-web.org" rel="noopener" target="_blank">EPPIC Biological Assemblies </a></li><li class="extraList">External Data and Resources </li><li class="extraMargin"><a href="/docs/general-help/data-from-external-resources-integrated-into-rcsb-pdb" rel="noopener">Integrated Resources </a></li><li class="extraMargin"><a href="/docs/additional-resources/databases-and-knowledgebases" rel="noopener">Additional Resources </a></li></ul></li><li class="dropdown hidden-xs hidden-sm" id="headnav_download"><a class="dropdown-toggle" href="#" data-toggle="dropdown">Download <b class="caret"></b></a><ul class="dropdown-menu"> <li><a href="/downloads" rel="noopener">Coordinates and Experimental Data</a></li><li><a href="/downloads/fasta" rel="noopener">Sequences</a></li><li><a href="/downloads/ligands" rel="noopener">Ligands</a></li><li><a href="/docs/programmatic-access/file-download-services" rel="noopener">File Download Services</a></li><li><a href="/docs/programmatic-access/web-apis-overview" rel="noopener">Web APIs</a></li></ul></li><li class="dropdown" id="headnav_learn"><a class="dropdown-toggle" href="#" data-toggle="dropdown">Learn <b class="caret"></b></a><ul class="dropdown-menu"><h4><a href="http://pdb101.rcsb.org" target="_blank" rel="noopener"><img class="image_submenu" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb/v2/home/images/menuImgs/pdb101Logo.png"></a></h4><li><a href="https://pdb101.rcsb.org/train/training-events" rel="noopener" target="_blank">Training Courses </a></li><li><a href="https://pdb101.rcsb.org/learn/guide-to-understanding-pdb-data/introduction" rel="noopener" target="_blank">Guide to PDB Data </a></li><li><a href="https://pdb101.rcsb.org/motm/motm-by-date" rel="noopener" target="_blank">Molecule of the Month </a></li><li><a href="https://pdb101.rcsb.org/learn/paper-models" rel="noopener" target="_blank">Educational Resources </a></li><li><a href="https://pdb101.rcsb.org/teach/overview" rel="noopener" target="_blank">Curricula </a></li><li><a href="https://pdb101.rcsb.org/browse" rel="noopener" target="_blank">Browse </a></li><li><a href="https://pdb101.rcsb.org/news/2023" rel="noopener" target="_blank">News </a></li><li class="extraList">SciArt Galleries </li><li class="extraMargin"><a href="https://pdb101.rcsb.org/sci-art/geis-archive/gallery-by-name" rel="noopener" target="blank">Irving Geis </a></li><li class="extraMargin"><a href="https://pdb101.rcsb.org/sci-art/goodsell-gallery" rel="noopener" target="blank">David Goodsell </a></li></ul></li><li class="dropdown" id="headnav_more"><a class="dropdown-toggle" href="#" data-toggle="dropdown">About <b class="caret"></b></a><ul class="dropdown-menu"><li><a href="/pages/contactus" rel="noopener">Contact Us</a></li><li><a href="/pages/about-us/index" rel="noopener">About RCSB PDB</a></li><li><a href="/pages/about-us/mission" rel="noopener">Vision and Mission</a></li><li><a href="/pages/policies" rel="noopener">Citation, Usage, Privacy Policies, Logo</a></li><li><a href="/pages/news" rel="noopener">News</a></li><li><a href="/pages/about-us/history" rel="noopener">PDB History</a></li><li><a href="/pages/pdb50" rel="noopener">PDB50</a></li><li><a href="/pages/about-us/pdb-user-community" rel="noopener">User Community</a></li><li><a href="/pages/publications" rel="noopener">Publications</a></li><li><a href="/pages/advisory-committee" rel="noopener">RCSB PDB Advisory Committee</a></li><li><a href="/pages/team" rel="noopener">Team Members</a></li><li><a href="/pages/about-us/deia" rel="noopener">Diversity, Equity, Inclusion, and Access</a></li><li><a href="https://status.rcsb.org/" rel="noopener" target="_blank">Service Status </a></li></ul></li><li class="nodropdown"><a class="dropdown-toggle" href="/pages/jobs">Careers</a></li><li class="nodropdown"><a class="dropdown-toggle" href="/news/feature/5e74d55d2d410731e9944f52">COVID-19</a></li><li class="dropdown visible-xs"><div id="socialmedia_section_mobile"><ul class="fa-ul hidden-print"><li><a href="https://www.facebook.com/RCSBPDB" target="_blank" rel="noopener" title="Facebook" data-placement="top" data-toggle="tooltip"><i class="fa fa-facebook-square fa-lg"></i></a></li><li><a href="https://twitter.com/buildmodels" target="_blank" rel="noopener" title="Twitter" data-placement="top" data-toggle="tooltip"><i class="fa fa-twitter fa-lg"></i></a></li><li><a href="https://www.youtube.com/user/RCSBProteinDataBank" target="_blank" rel="noopener" title="YouTube" data-placement="top" data-toggle="tooltip"><i class="fa fa-youtube-play fa-lg"></i></a></li><li><a href="https://github.com/rcsb" target="_blank" rel="noopener" title="Github" data-placement="top" data-toggle="tooltip"><i class="fa fa-github fa-lg"></i></a></li><li><a href="https://www.linkedin.com/company/rcsb-protein-data-bank" target="_blank" rel="noopener" title="LinkedIn" data-placement="top" data-toggle="tooltip"><i class="fa fa-linkedin fa-lg"></i></a></li></ul></div></li></ul></div></div></nav></div><style>#PDBmembers li {margin-right: 15px; } </style><div data-elastic-exclude><div id="header"><div class="container"><div class="row" style="margin-bottom: 0px;"><div class="col-md-6 col-lg-5 hidden-sm hidden-xs" id="logo_container" style="padding-bottom: 15px;"><table class="header-left"><tr><td><a href="/"><img id="rcsblogo" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb/v2/common/images/rcsb_logo.png" alt="RCSB PDB"></a></td><td><table id="header-counts"><tr><td><div class="results-content-type-sm experimental"><span class="fa fa-flask" data-toggle="tooltip" data-placement="right" data-original-title="Experimental PDB Structure"></span></div></td><td><a href="/search?request=%7B%22query%22%3A%7B%22type%22%3A%22group%22%2C%22nodes%22%3A%5B%7B%22type%22%3A%22group%22%2C%22nodes%22%3A%5B%7B%22type%22%3A%22group%22%2C%22nodes%22%3A%5B%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22text%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22attribute%22%3A%22rcsb_entry_info.structure_determination_methodology%22%2C%22operator%22%3A%22exact_match%22%2C%22value%22%3A%22experimental%22%7D%7D%5D%2C%22logical_operator%22%3A%22and%22%7D%5D%2C%22logical_operator%22%3A%22and%22%2C%22label%22%3A%22text%22%7D%5D%2C%22logical_operator%22%3A%22and%22%7D%2C%22return_type%22%3A%22entry%22%2C%22request_options%22%3A%7B%22scoring_strategy%22%3A%22combined%22%2C%22results_content_type%22%3A%5B%22experimental%22%5D%7D%7D" style="font-weight: bold; font-size: 110%">227,561</a><span> Structures from the PDB</span></td></tr><tr><td><div class="results-content-type-sm computational"><span class="fa fa-desktop" data-toggle="tooltip" data-placement="right" data-original-title="Computed Structure Model"></span></div></td><td><a href="/search?request=%7B%22query%22%3A%7B%22type%22%3A%22group%22%2C%22nodes%22%3A%5B%7B%22type%22%3A%22group%22%2C%22nodes%22%3A%5B%7B%22type%22%3A%22group%22%2C%22nodes%22%3A%5B%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22text%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22attribute%22%3A%22rcsb_entry_info.structure_determination_methodology%22%2C%22operator%22%3A%22exact_match%22%2C%22value%22%3A%22computational%22%7D%7D%5D%2C%22logical_operator%22%3A%22and%22%7D%5D%2C%22logical_operator%22%3A%22and%22%2C%22label%22%3A%22text%22%7D%5D%2C%22logical_operator%22%3A%22and%22%7D%2C%22return_type%22%3A%22entry%22%2C%22request_options%22%3A%7B%22scoring_strategy%22%3A%22combined%22%2C%22results_content_type%22%3A%5B%22computational%22%5D%7D%7D" style="font-weight: bold; font-size: 110%">1,068,577</a><span> Computed Structure Models (CSM)</span></td></tr></table></td></tr></table></div><div class="col-sm-12 col-md-6 col-lg-7 hidden-print" id="search-bar-container"></div></div></div><div class="logos_bcg"><div class="container"><ul class="hidden-xs hidden-print" id="PDBmembers"><li><span data-toggle="tooltip" data-placement="right" data-original-title="PDB-101: Training and outreach portal of RCSB PDB"><a href="https://pdb101.rcsb.org/"><img id="pdb101logo" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb/v2/common/images/pdb101-truncated.png" alt="PDB-101"></a></span></li><li><span data-toggle="tooltip" data-placement="right" data-original-title="wwPDB: Worldwide Protein Data Bank"><a href="https://www.wwpdb.org/" target="_blank" rel="noopener"><img id="wwpdblogo" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb/v2/common/images/wwpdb-truncated.png" alt="wwPDB"></a></span></li><li><span data-toggle="tooltip" data-placement="right" data-original-title="EMDataResource: 3DEM resources"><a href="https://www.emdataresource.org" target="_blank" rel="noopener"><img id="emdatabanklogo" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb/v2/common/images/emdb-truncated.png" alt="EMDataResource"></a></span></li><li><span data-toggle="tooltip" data-placement="right" data-original-title="NAKB: Nucleic Acid Knowledgebase"><a href="https://nakb.org/" target="_blank" rel="noopener"><img id="nakblogo" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb/v2/common/images/nakb-logo.png" alt="NAKB: Nucleic Acid Knowledgebase"></a></span></li><li><span data-toggle="tooltip" data-placement="right" data-original-title="wwPDB Foundation: Donate to support wwPDB outreach activities"><a href="https://foundation.wwpdb.org/" target="_blank" rel="noopener"><img id="wwpdbfoundationlogo" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb/v2/common/images/foundation-truncated.png" alt="wwPDB Foundation"></a></span></li><li><span data-toggle="tooltip" data-placement="right" data-original-title="PDB-Dev: Prototype Archiving System for Integrative Structures"><a href="https://pdb-dev.wwpdb.org/" target="_blank" rel="noopener"><img id="pdbdevlogo" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb/v2/common/images/pdb-dev-logo.png" alt="PDB-Dev Logo"></a></span></li></ul><div id="socialmedia_section"><ul class="fa-ul hidden-print"><li><a href="https://www.facebook.com/RCSBPDB" target="_blank" rel="noopener" title="Facebook" data-placement="top" data-toggle="tooltip"><i class="fa fa-facebook-square fa-lg"></i></a></li><li><a href="https://twitter.com/buildmodels" target="_blank" rel="noopener" title="Twitter" data-placement="top" data-toggle="tooltip"><i class="fa fa-twitter fa-lg"></i></a></li><li><a href="https://www.youtube.com/user/RCSBProteinDataBank" target="_blank" rel="noopener" title="YouTube" data-placement="top" data-toggle="tooltip"><i class="fa fa-youtube-play fa-lg"></i></a></li><li><a href="https://github.com/rcsb" target="_blank" rel="noopener" title="Github" data-placement="top" data-toggle="tooltip"><i class="fa fa-github fa-lg"></i></a></li><li><a href="https://www.linkedin.com/company/rcsb-protein-data-bank" target="_blank" rel="noopener" title="LinkedIn" data-placement="top" data-toggle="tooltip"><i class="fa fa-linkedin fa-lg"></i></a></li></ul></div></div></div></div></div><div class="container" id="maincontentcontainer"><button class="navbar-toggle pull-left" id="SSP-collapsed-tabs" type="button" data-toggle="collapse" data-target="#navbar-collapse-SSP"><span class="glyphicon glyphicon-menu-hamburger" aria-hidden="true"></span> Navigation Tabs</button><div class="collapse navbar-collapse" id="navbar-collapse-SSP"><ul class="nav nav-tabs hidden-print" id="structuretabs" role="tablist"><li id="structuresummarytab" role="presentation"><a href="/structure/2DLN">Structure Summary</a></li><li id="3dviewtab" role="presentation"><a href="/3d-view/2DLN">Structure</a></li><li id="annotationstab" role="presentation"><a href="/annotations/2DLN">Annotations</a></li><li id="MoreOptions-Method" role="presentation"><a href="/experimental/2DLN">Experiment</a></li><li id="sequencetab" role="presentation"><a href="/sequence/2DLN">Sequence</a></li><li id="genometab" role="presentation"><a href="/genome/2DLN">Genome</a></li><li id="versionstab" role="presentation"><a href="/versions/2DLN">Versions</a></li><!--+tab( 'Sequence', '/pdb/explore/remediatedSequence.do?structureId=' + entryId, 'Sequence' )--><!--+tab( 'MoreOptions-Method', '/experimental/' + entryId, 'Experiment' )--></ul></div><br><div class="tab-content"><div class="tab-pane active" id="summary" role="tabpanel"><div class="row"><div class="col-md-8 col-sm-12 col-xs-12 pull-right"><div class="actionButtons btn-toolbar" role="toolbar"><style>#DownloadFilesButton .dropdown-menu li.filedivider:not(:first-child), #DisplayFilesButton .dropdown-menu li.filedivider:not(:first-child) { height: 1px; margin: 9px 0; overflow: hidden; background-color: #e5e5e5; } </style><div class="btn-group" id="ProductPrimaryActions" role="group"><div class="btn-group" id="DisplayFilesButton" role="group"><button class="btn btn-sm btn-primary dropdown-toggle" id="dropdownMenuDisplayFiles" type="button" data-toggle="dropdown" aria-expanded="false"><span class="fa fa-file" aria-hidden="true"></span> Display Files <span class="caret"></span></button><ul class="dropdown-menu pull-right" role="menu" aria-labelledby="dropdownMenuDisplayFiles"><li class="filedivider"></li><li><a target="_blank" rel="noopener" href="/fasta/entry/2DLN/display">FASTA Sequence</a></li><li class="filedivider"></li><li><a target="_blank" rel="noopener" href="//files.rcsb.org/view/2DLN.cif">mmCIF Format</a></li><li><a target="_blank" rel="noopener" href="//files.rcsb.org/header/2DLN.cif">mmCIF Format (Header)</a></li><li class="filedivider"></li><li><a target="_blank" rel="noopener" href="//files.rcsb.org/view/2DLN.pdb">PDB Format</a></li><li><a target="_blank" rel="noopener" href="https://files.rcsb.org/header/2DLN.pdb">PDB Format (Header)</a></li></ul></div><div class="btn-group" id="DownloadFilesButton" role="group"><button class="btn btn-sm btn-primary dropdown-toggle" id="dropdownMenuDownloadFiles" type="button" data-toggle="dropdown" aria-expanded="false"><span class="fa fa-arrow-circle-o-down" aria-hidden="true" style="font-size: 14px;"></span> Download Files <span class="caret"></span></button><ul class="dropdown-menu pull-right" role="menu" aria-labelledby="dropdownMenuDownloadFiles"><li class="filedivider"></li><li><a href="/fasta/entry/2DLN">FASTA Sequence</a></li><li class="filedivider"></li><li><a href="//files.rcsb.org/download/2DLN.cif">PDBx/mmCIF Format</a></li><li><a href="//files.rcsb.org/download/2DLN.cif.gz">PDBx/mmCIF Format (gz)</a></li><li><a href="//models.rcsb.org/2DLN.bcif.gz">BinaryCIF Format (gz)</a></li><li class="filedivider"></li><li><a href="//files.rcsb.org/download/2DLN.pdb">PDB Format</a></li><li><a href="//files.rcsb.org/download/2DLN.pdb.gz">PDB Format (gz)</a></li><li class="filedivider"></li><li><a href="//files.rcsb.org/download/2DLN.xml.gz">PDBML/XML Format (gz)</a></li><li class="filedivider"></li><li><a target="_blank" rel="noopener" href="//files.rcsb.org/pub/pdb/validation_reports/dl/2dln/2dln_full_validation.pdf">Validation Full PDF</a></li><li><a target="_blank" rel="noopener" href="//files.rcsb.org/pub/pdb/validation_reports/dl/2dln/2dln_validation.xml.gz">Validation (XML - gz)</a></li><li><a target="_blank" rel="noopener" href="//files.rcsb.org/pub/pdb/validation_reports/dl/2dln/2dln_validation.cif.gz">Validation (CIF - gz)</a></li><li class="filedivider"></li><li><a href="//files.rcsb.org/download/2DLN-assembly1.cif.gz">Biological Assembly 1 (CIF - gz) <span class="fa fa-info-circle" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="top" title="Biological assembly files in .cif format."></span></a></li><li><a href="//files.rcsb.org/download/2DLN.pdb1.gz">Biological Assembly 1 (PDB - gz)</a></li></ul></div></div><div class="btn-group" role="group" style="margin-left: 2px;" target="_blank" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="Get the Data API query used to generate this page"> <a href="https://data.rcsb.org/graphql/index.html?query=query%20structure(%24id%3A%20String!)%20%7B%0A%20%20entry(entry_id%3A%20%24id)%20%7B%0A%20%20%20%20rcsb_id%0A%20%20%20%20entry%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20id%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20rcsb_entry_container_identifiers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20entity_ids%0A%20%20%20%20%20%20pubmed_id%0A%20%20%20%20%20%20emdb_ids%0A%20%20%20%20%20%20assembly_ids%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20rcsb_associated_holdings%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_repository_holdings_current_entry_container_identifiers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20assembly_ids%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_repository_holdings_current%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20repository_content_types%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20rcsb_comp_model_provenance%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20source_url%0A%20%20%20%20%20%20source_pae_url%0A%20%20%20%20%20%20entry_id%0A%20%20%20%20%20%20source_db%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20pdbx_database_status%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20pdb_format_compatible%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20struct%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20title%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20rcsb_ma_qa_metric_global%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20model_id%0A%20%20%20%20%20%20ma_qa_metric_global%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20value%0A%20%20%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20description%0A%20%20%20%20%20%20%20%20type_other_details%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20rcsb_primary_citation%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20id%0A%20%20%20%20%20%20pdbx_database_id_DOI%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20pubmed%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_pubmed_container_identifiers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20pubmed_id%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_pubmed_central_id%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_pubmed_doi%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_pubmed_abstract_text%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_pubmed_affiliation_info%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20pdbx_deposit_group%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20group_id%0A%20%20%20%20%20%20group_type%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20rcsb_external_references%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20id%0A%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20link%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20pdbx_database_PDB_obs_spr%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20id%0A%20%20%20%20%20%20replace_pdb_id%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20struct_keywords%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20pdbx_keywords%0A%20%20%20%20%20%20text%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20exptl%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20method%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20cell%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20length_a%0A%20%20%20%20%20%20length_b%0A%20%20%20%20%20%20length_c%0A%20%20%20%20%20%20angle_alpha%0A%20%20%20%20%20%20angle_beta%0A%20%20%20%20%20%20angle_gamma%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20symmetry%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20space_group_name_H_M%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20software%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20classification%0A%20%20%20%20%20%20name%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20rcsb_accession_info%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20deposit_date%0A%20%20%20%20%20%20initial_release_date%0A%20%20%20%20%20%20major_revision%0A%20%20%20%20%20%20minor_revision%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20pdbx_audit_revision_history%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20ordinal%0A%20%20%20%20%20%20data_content_type%0A%20%20%20%20%20%20major_revision%0A%20%20%20%20%20%20minor_revision%0A%20%20%20%20%20%20revision_date%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20pdbx_audit_revision_details%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20ordinal%0A%20%20%20%20%20%20revision_ordinal%0A%20%20%20%20%20%20data_content_type%0A%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20description%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20pdbx_audit_revision_group%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20ordinal%0A%20%20%20%20%20%20revision_ordinal%0A%20%20%20%20%20%20data_content_type%0A%20%20%20%20%20%20group%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20pdbx_database_related%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20content_type%0A%20%20%20%20%20%20db_id%0A%20%20%20%20%20%20details%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20audit_author%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20name%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20pdbx_audit_support%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20funding_organization%0A%20%20%20%20%20%20country%0A%20%20%20%20%20%20grant_number%0A%20%20%20%20%20%20ordinal%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20pdbx_initial_refinement_model%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20refine%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20pdbx_refine_id%0A%20%20%20%20%20%20ls_d_res_high%0A%20%20%20%20%20%20ls_R_factor_R_work%0A%20%20%20%20%20%20ls_R_factor_R_free%0A%20%20%20%20%20%20ls_R_factor_obs%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20pdbx_nmr_ensemble%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20conformers_calculated_total_number%0A%20%20%20%20%20%20conformers_submitted_total_number%0A%20%20%20%20%20%20conformer_selection_criteria%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20em_experiment%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20aggregation_state%0A%20%20%20%20%20%20reconstruction_method%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20em_3d_reconstruction%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20resolution%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20em_software%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20category%0A%20%20%20%20%20%20name%0A%20%20%20%20%20%20version%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20citation%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20id%0A%20%20%20%20%20%20title%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_journal_abbrev%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_authors%0A%20%20%20%20%20%20year%0A%20%20%20%20%20%20journal_volume%0A%20%20%20%20%20%20page_first%0A%20%20%20%20%20%20page_last%0A%20%20%20%20%20%20pdbx_database_id_PubMed%0A%20%20%20%20%20%20pdbx_database_id_DOI%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20pdbx_database_related%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20db_id%0A%20%20%20%20%20%20db_name%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20rcsb_entry_info%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20molecular_weight%0A%20%20%20%20%20%20deposited_atom_count%0A%20%20%20%20%20%20deposited_model_count%0A%20%20%20%20%20%20deposited_polymer_monomer_count%0A%20%20%20%20%20%20deposited_modeled_polymer_monomer_count%0A%20%20%20%20%20%20deposited_unmodeled_polymer_monomer_count%0A%20%20%20%20%20%20polymer_entity_count_protein%0A%20%20%20%20%20%20polymer_entity_count_nucleic_acid%0A%20%20%20%20%20%20polymer_entity_count_nucleic_acid_hybrid%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20rcsb_entry_group_membership%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20group_id%0A%20%20%20%20%20%20aggregation_method%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20rcsb_binding_affinity%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20comp_id%0A%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20value%0A%20%20%20%20%20%20unit%0A%20%20%20%20%20%20reference_sequence_identity%0A%20%20%20%20%20%20provenance_code%0A%20%20%20%20%20%20link%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20branched_entities%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_id%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_branched_entity_container_identifiers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20entry_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20entity_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20asym_ids%0A%20%20%20%20%20%20%20%20auth_asym_ids%0A%20%20%20%20%20%20%20%20reference_identifiers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20provenance_source%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20resource_name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20resource_accession%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20prd%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20pdbx_reference_molecule%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20prd_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20chem_comp_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20class%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_branched_entity%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20pdbx_description%0A%20%20%20%20%20%20%20%20formula_weight%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20pdbx_entity_branch%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_branched_component_count%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20branched_entity_instances%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_branched_entity_instance_container_identifiers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20entry_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20entity_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20asym_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20auth_asym_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_branched_struct_conn%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20connect_type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20role%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20ordinal_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20connect_partner%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20label_asym_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20label_seq_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20label_comp_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20connect_target%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20auth_seq_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20label_asym_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20label_comp_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_branched_instance_feature%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20feature_value%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20comp_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20details%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20polymer_entities%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20polymer_entity_instances%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_polymer_entity_instance_container_identifiers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20auth_asym_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20asym_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20entry_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20entity_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_polymer_entity_container_identifiers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20entry_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20entity_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20asym_ids%0A%20%20%20%20%20%20%20%20auth_asym_ids%0A%20%20%20%20%20%20%20%20uniprot_ids%0A%20%20%20%20%20%20%20%20reference_sequence_identifiers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20database_accession%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20uniprots%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_uniprot_protein%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20source_organism%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20scientific_name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_uniprot_external_reference%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20reference_name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20reference_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_polymer_entity%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20pdbx_description%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_ec_lineage%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20pdbx_ec%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_enzyme_class_combined%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20ec%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20provenance_source%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_polymer_entity_annotation%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20annotation_lineage%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20depth%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_polymer_entity_group_membership%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20group_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20similarity_cutoff%0A%20%20%20%20%20%20%20%20aggregation_method%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20entity_poly%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_entity_polymer_type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20pdbx_seq_one_letter_code_can%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_sample_sequence_length%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_mutation_count%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_entity_source_organism%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20scientific_name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20ncbi_scientific_name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_gene_name%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20value%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20provenance_source%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_entity_host_organism%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20ncbi_scientific_name%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20prd%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20pdbx_reference_molecule%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20prd_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20chem_comp_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20class%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20chem_comp_nstd_monomers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20chem_comp%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20formula%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20mon_nstd_parent_comp_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20polymer_entity_instances%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_polymer_instance_annotation%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20annotation_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_polymer_struct_conn%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20role%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20connect_type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20connect_partner%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20label_asym_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20connect_target%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20label_asym_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20nonpolymer_entities%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_nonpolymer_entity_container_identifiers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20entry_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20entity_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20auth_asym_ids%0A%20%20%20%20%20%20%20%20asym_ids%0A%20%20%20%20%20%20%20%20nonpolymer_comp_id%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_nonpolymer_entity_annotation%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20nonpolymer_entity_instances%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_nonpolymer_entity_instance_container_identifiers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20auth_seq_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20auth_asym_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20asym_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20entry_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20entity_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_nonpolymer_instance_validation_score%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20ranking_model_fit%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20ranking_model_geometry%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20average_occupancy%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20is_subject_of_investigation%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20is_subject_of_investigation_provenance%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_nonpolymer_entity%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20pdbx_description%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20nonpolymer_comp%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20chem_comp%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20formula_weight%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20formula%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20pdbx_reference_molecule%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20prd_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20chem_comp_id%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20name%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20class%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_chem_comp_descriptor%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%20%20InChIKey%0A%20%20%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20assemblies%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_assembly_container_identifiers%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20assembly_id%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20pdbx_struct_assembly%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_details%0A%20%20%20%20%20%20%20%20method_details%0A%20%20%20%20%20%20%20%20rcsb_candidate_assembly%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20pdbx_struct_assembly_auth_evidence%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20experimental_support%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_struct_symmetry%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20kind%0A%20%20%20%20%20%20%20%20type%0A%20%20%20%20%20%20%20%20symbol%0A%20%20%20%20%20%20%20%20oligomeric_state%0A%20%20%20%20%20%20%20%20stoichiometry%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%20%20rcsb_assembly_info%20%7B%0A%20%20%20%20%20%20%20%20modeled_polymer_monomer_count%0A%20%20%20%20%20%20%7D%0A%20%20%20%20%7D%0A%20%20%7D%0A%7D&variables=%7B%22id%22%3A%20%222DLN%22%7D"><button class="btn btn-sm btn-default"><span class="glyphicon glyphicon-cog"></span> Data API </button></a></div></div><h1><div class="results-content-type experimental"><span class="fa fa-flask" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="Experimental PDB Structure"></span></div><span id="structureID"> 2DLN</span></h1><h4><span id="structureTitle">VANCOMYCIN RESISTANCE: STRUCTURE OF D-ALANINE:D-ALANINE LIGASE AT 2.3 ANGSTROMS RESOLUTION</span></h4><ul class="list-inline"><li id="header_doi"><strong>PDB DOI: </strong><a href="https://doi.org/10.2210/pdb2DLN/pdb" target="_blank" rel="noopener">https://doi.org/10.2210/pdb2DLN/pdb</a></li></ul><ul class="list-unstyled"><li id="header_classification"><strong>Classification: <a href="/search?q=struct_keywords.pdbx_keywords:LIGASE(PEPTIDOGLYCAN SYNTHESIS)" onClick="sendGtag("title_section", "ssp_search_link", "classification")">LIGASE(PEPTIDOGLYCAN SYNTHESIS)</a></strong></li><li id="header_organism"><strong>Organism(s): </strong><a href="/search?q=rcsb_entity_source_organism.taxonomy_lineage.name:Escherichia coli" onClick="sendGtag("title_section", "ssp_search_link", "organism")">Escherichia coli</a></li><!-- sum of mutations of all entities--><li id="header_mutation"><strong>Mutation(s): </strong>No <span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="right" data-original-title="Indicates sequence mutations."></span></li><br><li id="header_deposited-released-dates"><strong>Deposited: </strong>1994-07-18 <strong>Released: </strong>1995-11-01 </li><li id="header_deposition-authors"><strong>Deposition Author(s): </strong><a href="/search?q=audit_author.name:Knox, J.R." onClick="sendGtag("title_section", "ssp_search_link", "depAuthor")">Knox, J.R.</a>, <a href="/search?q=audit_author.name:Moews, P.C." onClick="sendGtag("title_section", "ssp_search_link", "depAuthor")">Moews, P.C.</a>, <a href="/search?q=audit_author.name:Fan, C." onClick="sendGtag("title_section", "ssp_search_link", "depAuthor")">Fan, C.</a></li></ul><hr><div class="row"><div class="col-sm-5 col-xs-12" id="header_experimentalDataSnapshot"><p><strong>Experimental Data Snapshot</strong></p><ul class="list-unstyled" id="exp_header_0_snapshot"><li id="exp_header_0_method"><strong>Method: </strong>X-RAY DIFFRACTION</li><li id="exp_header_0_diffraction_resolution"><strong>Resolution: </strong>2.30 Å</li><li id="exp_header_0_diffraction_rvalueWork"><strong>R-Value Work: </strong>0.172 </li><li id="exp_header_0_diffraction_rvalueObserved"><strong>R-Value Observed: </strong>0.172  </li></ul></div><div class="col-sm-7 col-xs-12"><!-- Experimental Validation HTML / PDF--><!-- Experimental Validation HTML / PDF--><style>div.validation-slider { border: 1px solid #ddd; padding: 5px; } div.validation-slider img { max-width: 100%; } </style><p><strong>wwPDB Validation</strong>  <span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="right" data-original-title="For each metric, two values are noted, one for the percentile rank of the entry compared to the entire PDB archive and one compared with entries determined with the same experimental method. The blue side of the scale is considered "better" than those on the "worse" red side."> </span><span class="pull-right"><a class="btn btn-default btn-xs" href="/3d-view/2DLN?preset=validationReport"><i class="fa fa-cube"> </i>3D Report</a> <a class="btn btn-default btn-xs" target="_blank" rel="noopener" href="//files.rcsb.org/pub/pdb/validation_reports/dl/2dln/2dln_full_validation.pdf">Full Report</a></span></p><div class="validation-slider"><a target="_blank" rel="noopener" href="//files.rcsb.org/pub/pdb/validation_reports/dl/2dln/2dln_full_validation.pdf"><img src="//files.rcsb.org/pub/pdb/validation_reports/dl/2dln/2dln_multipercentile_validation.png" width="500"></a></div></div></div><br><div class="row"><div class="col-lg-12 col-md-12 col-sm-12 col-xs-12" id="currentVersionSection"><div class="well well-sm well-nomar">This is version 1.5 of the entry. See complete <a href="/versions/2DLN">history</a>. </div><br></div></div><br><div class="row"><div class="col-lg-12 col-md-12 col-sm-12 col-xs-12"><div class="panel panel-default" id="literaturepanel"><div class="panel-heading"><div class="panel-title">Literature<div class="btn-group pull-right"><button class="btn btn-default btn-xs hidden-print dropdown-toggle" type="button" data-toggle="dropdown" aria-expanded="false">Download Primary Citation <span class="caret"></span></button><ul class="dropdown-menu DropdownChangeGallery" role="menu"><li><a href="javascript:document.getElementsByTagName('body')[0].appendChild(document.createElement('script')).setAttribute('src','https://www.mendeley.com/minified/bookmarklet.js');"><img src="//cdn.rcsb.org/rcsb-pdb/explorer/SSPv2/images/MendeleyIcon.png" width="16"> Download Mendeley</a></li></ul></div></div></div><div class="panel-body"><div id="primarycitation"><h4>Vancomycin resistance: structure of D-alanine:D-alanine ligase at 2.3 A resolution.</h4><a class="querySearchLink" href="/search?q=citation.rcsb_authors:Fan, C." onClick="sendGtag("literature_section", "ssp_search_link", "pubAuthor")">Fan, C.</a>, <a class="querySearchLink" href="/search?q=citation.rcsb_authors:Moews, P.C." onClick="sendGtag("literature_section", "ssp_search_link", "pubAuthor")">Moews, P.C.</a>, <a class="querySearchLink" href="/search?q=citation.rcsb_authors:Walsh, C.T." onClick="sendGtag("literature_section", "ssp_search_link", "pubAuthor")">Walsh, C.T.</a>, <a class="querySearchLink" href="/search?q=citation.rcsb_authors:Knox, J.R." onClick="sendGtag("literature_section", "ssp_search_link", "pubAuthor")">Knox, J.R.</a><br><!-- if journal_abbrev already published--><p>(1994) Science <strong>266</strong>: 439-443</p><ul class="list-unstyled"><li id="pubmedLinks"><strong>PubMed</strong>: <a class="querySearchLink" href="/search?q=rcsb_pubmed_container_identifiers.pubmed_id:7939684" onClick="sendGtag("literature_section", "ssp_search_link", "pubmedId")">7939684</a> <span class="label label-external hidden-print"><a href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=7939684" target="_blank" rel="noopener">Search on PubMed</a></span></li><li id="pubmedDOI"><strong>DOI: </strong><a href="https://doi.org/10.1126/science.7939684" target="_blank" rel="noopener">https://doi.org/10.1126/science.7939684</a></li><li id="citationPrimaryRelatedStructures" style="word-wrap:break-word;">Primary Citation of Related Structures:  <br><a href="/structure/2DLN">2DLN</a></li><!--TODO: add "Secondary Citation of Related Structures" when data is available //add GA link tracking--><br><li id="pubmedAbstractText"><strong>PubMed Abstract: </strong><br><div class="abstract" id="abstract"><p>The molecular structure of the D-alanine:D-alanine ligase of the ddlB gene of Escherichia coli, co-crystallized with an S,R-methylphosphinate and adenosine triphosphate, was determined by x-ray diffraction to a resolution of 2.3 angstroms. A catalytic mechanism for the ligation of two D-alanine substrates is proposed in which a helix dipole and a hydrogen-bonded triad of tyrosine, serine, and glutamic acid assist binding and deprotonation steps. From sequence comparison, it is proposed that a different triad exists in a recently discovered D-alanine:D-lactate ligase (VanA) present in vancomycin-resistant enterococci. A molecular mechanism for the altered specificity of VanA is suggested.</p></div><button class="btn btn-default btn-xs" onclick="toggleAbstract()" id="toggleBtn" style="margin-top: 3px"><span class="glyphicon glyphicon-plus-sign"></span> View More</button></li><hr><strong>Organizational Affiliation</strong>: <p>Department of Molecular and Cell Biology, University of Connecticut, Storrs 06269-3125.</p></ul><!--journal_abbrev to be published--></div></div></div></div></div></div><div class="col-md-4 col-sm-12 col-xs-12"><script>// Used for Transmembrane Image Carousel var structureFirstLigand = "ADP"; var finalImageCount = 1; var isNMR = false; var modelCount = 1 var assemblies = ["1"]</script><div class="panel panel-default" id="galleryimagepanel"><div class="panel-body" id="structureimagesection"><div class="carousel slide" id="carousel-structuregallery" data-ride="carousel" data-interval="false"><div class="carousel-inner" role="listbox"><div class="item imageCarouselItem" id="Carousel-BiologicalUnit0"><div class="carousel-header">Asymmetric Unit</div><div class="clearfix"></div><img class="img-responsive center-block mainImage" src="data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAAD/ACwAAAAAAQABAAACADs=" style="image-rendering: -webkit-optimize-contrast;"><a class="btn btn-default btn-xs btn-enlargeImage" type="button" data-toggle="lightbox" data-gallery="multiimages0" href="#" data-title=""><span class="glyphicon glyphicon-resize-full" aria-hidden="true"></span></a><div class="galleryNewImages" id="AssemblyNewImage0"></div><div class="clearfix"></div><div class="carousel-footer"><p><assemblyid class="fa fa-cube"> </assemblyid><strong>Explore in 3D</strong>: <a href="/3d-view/2DLN/0">Structure</a> | <a href="/3d-sequence/2DLN?assemblyId=0">Sequence Annotations</a> | <span class="propernoun"><a href="/3d-view/2DLN?preset=validationReport">Validation Report</a></span> | <span class="propernoun"><a href="/3d-view/2DLN?preset=ligandInteraction&label_asym_id=D">Ligand Interaction</a> (ADP)</span></p></div></div><div class="item imageCarouselItem" id="Carousel-BiologicalUnit1"><div class="carousel-header">Biological Assembly 1  <a class="hidden-xs hidden-sm hidden-md icon-link" href="/docs/general-help/computed-structure-models-and-rcsborg#models-and-assembly"><span class="glyphicon glyphicon-question-sign" aria-hidden="true"></span></a></div><div class="clearfix"></div><img class="img-responsive center-block mainImage" src="data:image/gif;base64,R0lGODlhAQABAAD/ACwAAAAAAQABAAACADs=" style="image-rendering: -webkit-optimize-contrast;"><a class="btn btn-default btn-xs btn-enlargeImage" type="button" data-toggle="lightbox" data-gallery="multiimages1" href="#" data-title=""><span class="glyphicon glyphicon-resize-full" aria-hidden="true"></span></a><div class="galleryNewImages" id="AssemblyNewImage1"></div><div class="clearfix"></div><div class="carousel-footer"><p><assemblyid class="fa fa-cube"> </assemblyid><strong>Explore in 3D</strong>: <a href="/3d-view/2DLN/1">Structure</a> | <a href="/3d-sequence/2DLN?assemblyId=1">Sequence Annotations</a> | <span class="propernoun"><a href="/3d-view/2DLN?preset=validationReport">Validation Report</a></span> | <span class="propernoun"><a href="/3d-view/2DLN?preset=ligandInteraction&label_asym_id=D">Ligand Interaction</a> (ADP)</span></p><hr><strong>Global Symmetry</strong>: Asymmetric - C1 <span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="Point group symmetry for the biological assembly. Chains are considered equivalent when their sequence identities are above 95%."></span><br><strong>Global Stoichiometry</strong>: Monomer - <span style="word-wrap:break-word;">A1 </span><span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="Chains with length below 5 residues or relatively short with respect to other chains are excluded from the stoichiometry and symmetry calculation."></span><div class="hidden-print" id="symmetryPart"></div><div class="hidden-print hide" id="symmetryFull"><br><button class="btn btn-default btn-xs hidden-print" id="full_symmetry_hide"><span class="glyphicon glyphicon-minus-sign"></span> Less</button></div><hr><a href="/search?query=%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22structure%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22value%22%3A%7B%22entry_id%22%3A%222DLN%22%2C%22assembly_id%22%3A%221%22%7D%7D%7D&return_type=assembly" onClick="sendGtag("imageGallery_section", "ssp_search_link", "findSimilarAssemblies")">Find Similar Assemblies</a><hr><p>Biological assembly 1 assigned by authors.</p></div></div><a class="left carousel-control" href="#carousel-structuregallery" role="button" data-slide="prev"><span class="glyphicon glyphicon-chevron-left" aria-hidden="true"></span><span class="sr-only">Previous</span></a><a class="right carousel-control" href="#carousel-structuregallery" role="button" data-slide="next"><span class="glyphicon glyphicon-chevron-right" aria-hidden="true"></span><span class="sr-only">Next</span></a></div></div></div></div><!-- Show up only when there is a mix of structure type--><div class="well well-sm hidden-sm hidden-xs well-nomar" id="macromoleculeContent"><p><strong>Macromolecule Content</strong></p><ul><li id="contentStructureWeight">Total Structure Weight: 33.62 kDa <span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="Molecular weight (in kDa) of all non-water atoms in the deposited model, based on the full deposited sample sequence. Hydrogen atoms are included for the charged state in ARG, HIS & LYS residues."></span></li><li id="contentAtomSiteCount">Atom Count: 2,642 <span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="Number of modeled non-hydrogen atoms in the deposited model."></span></li><li id="contentResidueCount">Modelled Residue Count: 306 <span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="Number of modeled polymer monomers in the deposited model."></span></li><li id="contentResidueCount">Deposited Residue Count: 306 <span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="Number of all (modeled or unmodeled) polymer monomers in the deposited model."></span></li><li id="contentProteinChainCount">Unique protein chains: 1</li></ul></div></div></div><br></div><div class="panel panel-default" id="macromoleculespanel"><div class="panel-heading"><div class="panel-title">Macromolecules</div></div><div class="panel-body"><div class="row"><div class="col-md-12 col-sm-12 col-xs-12"><div id="MacromoleculeTable"><div style="display: flow-root; margin-bottom: 5px;">Find similar proteins by: <div class="btn-group" role="group"><button class="btn-group btn btn-sm btn-default dropdown-toggle" id="dropdownCutOff" type="button" data-toggle="dropdown" aria-expanded="false" role="group" style="color: #337ab7; text-decoration: none;">Sequence <span class="caret"></span></button><ul class="dropdown-menu" role="menu" aria-labelledby="dropdownCutOff"><li><a href="/search?query=%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22sequence%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22target%22%3A%22pdb_protein_sequence%22%2C%22value%22%3A%22MTDKIAVLLGGTSAEREVSLNSGAAVLAGLREGGIDAYPVDPKEVDVTQLKSMGFQKVFIALHGRGGEDGTLQGMLELMGLPYTGSGVMASALSMDKLRSKLLWQGAGLPVAPWVALTRAEFEKGLSDKQLAEISALGLPVIVKPSREGSSVGMSKVVAENALQDALRLAFQHDEEVLIEKWLSGPEFTVAILGEEILPSIRIQPSGTFYDYEAKYLSDETQYFCPAGLEASQEANLQALVLKAWTTLGCKGWGRIDVMLDSDGQFYLLEANTSPGMTSHSLVPMAARQAGMSFSQLVVRILELAD%22%2C%22identity_cutoff%22%3A1%7D%7D&return_type=polymer_entity" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "proteinBySequenceCutoff")">100%</a></li><li><a href="/search?query=%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22sequence%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22target%22%3A%22pdb_protein_sequence%22%2C%22value%22%3A%22MTDKIAVLLGGTSAEREVSLNSGAAVLAGLREGGIDAYPVDPKEVDVTQLKSMGFQKVFIALHGRGGEDGTLQGMLELMGLPYTGSGVMASALSMDKLRSKLLWQGAGLPVAPWVALTRAEFEKGLSDKQLAEISALGLPVIVKPSREGSSVGMSKVVAENALQDALRLAFQHDEEVLIEKWLSGPEFTVAILGEEILPSIRIQPSGTFYDYEAKYLSDETQYFCPAGLEASQEANLQALVLKAWTTLGCKGWGRIDVMLDSDGQFYLLEANTSPGMTSHSLVPMAARQAGMSFSQLVVRILELAD%22%2C%22identity_cutoff%22%3A0.95%7D%7D&return_type=polymer_entity" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "proteinBySequenceCutoff")">95%</a></li><li><a href="/search?query=%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22sequence%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22target%22%3A%22pdb_protein_sequence%22%2C%22value%22%3A%22MTDKIAVLLGGTSAEREVSLNSGAAVLAGLREGGIDAYPVDPKEVDVTQLKSMGFQKVFIALHGRGGEDGTLQGMLELMGLPYTGSGVMASALSMDKLRSKLLWQGAGLPVAPWVALTRAEFEKGLSDKQLAEISALGLPVIVKPSREGSSVGMSKVVAENALQDALRLAFQHDEEVLIEKWLSGPEFTVAILGEEILPSIRIQPSGTFYDYEAKYLSDETQYFCPAGLEASQEANLQALVLKAWTTLGCKGWGRIDVMLDSDGQFYLLEANTSPGMTSHSLVPMAARQAGMSFSQLVVRILELAD%22%2C%22identity_cutoff%22%3A0.9%7D%7D&return_type=polymer_entity" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "proteinBySequenceCutoff")">90%</a></li><li><a href="/search?query=%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22sequence%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22target%22%3A%22pdb_protein_sequence%22%2C%22value%22%3A%22MTDKIAVLLGGTSAEREVSLNSGAAVLAGLREGGIDAYPVDPKEVDVTQLKSMGFQKVFIALHGRGGEDGTLQGMLELMGLPYTGSGVMASALSMDKLRSKLLWQGAGLPVAPWVALTRAEFEKGLSDKQLAEISALGLPVIVKPSREGSSVGMSKVVAENALQDALRLAFQHDEEVLIEKWLSGPEFTVAILGEEILPSIRIQPSGTFYDYEAKYLSDETQYFCPAGLEASQEANLQALVLKAWTTLGCKGWGRIDVMLDSDGQFYLLEANTSPGMTSHSLVPMAARQAGMSFSQLVVRILELAD%22%2C%22identity_cutoff%22%3A0.8%7D%7D&return_type=polymer_entity" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "proteinBySequenceCutoff")">80%</a></li><li><a href="/search?query=%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22sequence%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22target%22%3A%22pdb_protein_sequence%22%2C%22value%22%3A%22MTDKIAVLLGGTSAEREVSLNSGAAVLAGLREGGIDAYPVDPKEVDVTQLKSMGFQKVFIALHGRGGEDGTLQGMLELMGLPYTGSGVMASALSMDKLRSKLLWQGAGLPVAPWVALTRAEFEKGLSDKQLAEISALGLPVIVKPSREGSSVGMSKVVAENALQDALRLAFQHDEEVLIEKWLSGPEFTVAILGEEILPSIRIQPSGTFYDYEAKYLSDETQYFCPAGLEASQEANLQALVLKAWTTLGCKGWGRIDVMLDSDGQFYLLEANTSPGMTSHSLVPMAARQAGMSFSQLVVRILELAD%22%2C%22identity_cutoff%22%3A0.7%7D%7D&return_type=polymer_entity" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "proteinBySequenceCutoff")">70%</a></li><li><a href="/search?query=%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22sequence%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22target%22%3A%22pdb_protein_sequence%22%2C%22value%22%3A%22MTDKIAVLLGGTSAEREVSLNSGAAVLAGLREGGIDAYPVDPKEVDVTQLKSMGFQKVFIALHGRGGEDGTLQGMLELMGLPYTGSGVMASALSMDKLRSKLLWQGAGLPVAPWVALTRAEFEKGLSDKQLAEISALGLPVIVKPSREGSSVGMSKVVAENALQDALRLAFQHDEEVLIEKWLSGPEFTVAILGEEILPSIRIQPSGTFYDYEAKYLSDETQYFCPAGLEASQEANLQALVLKAWTTLGCKGWGRIDVMLDSDGQFYLLEANTSPGMTSHSLVPMAARQAGMSFSQLVVRILELAD%22%2C%22identity_cutoff%22%3A0.6%7D%7D&return_type=polymer_entity" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "proteinBySequenceCutoff")">60%</a></li><li><a href="/search?query=%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22sequence%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22target%22%3A%22pdb_protein_sequence%22%2C%22value%22%3A%22MTDKIAVLLGGTSAEREVSLNSGAAVLAGLREGGIDAYPVDPKEVDVTQLKSMGFQKVFIALHGRGGEDGTLQGMLELMGLPYTGSGVMASALSMDKLRSKLLWQGAGLPVAPWVALTRAEFEKGLSDKQLAEISALGLPVIVKPSREGSSVGMSKVVAENALQDALRLAFQHDEEVLIEKWLSGPEFTVAILGEEILPSIRIQPSGTFYDYEAKYLSDETQYFCPAGLEASQEANLQALVLKAWTTLGCKGWGRIDVMLDSDGQFYLLEANTSPGMTSHSLVPMAARQAGMSFSQLVVRILELAD%22%2C%22identity_cutoff%22%3A0.5%7D%7D&return_type=polymer_entity" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "proteinBySequenceCutoff")">50%</a></li><li><a href="/search?query=%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22sequence%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22target%22%3A%22pdb_protein_sequence%22%2C%22value%22%3A%22MTDKIAVLLGGTSAEREVSLNSGAAVLAGLREGGIDAYPVDPKEVDVTQLKSMGFQKVFIALHGRGGEDGTLQGMLELMGLPYTGSGVMASALSMDKLRSKLLWQGAGLPVAPWVALTRAEFEKGLSDKQLAEISALGLPVIVKPSREGSSVGMSKVVAENALQDALRLAFQHDEEVLIEKWLSGPEFTVAILGEEILPSIRIQPSGTFYDYEAKYLSDETQYFCPAGLEASQEANLQALVLKAWTTLGCKGWGRIDVMLDSDGQFYLLEANTSPGMTSHSLVPMAARQAGMSFSQLVVRILELAD%22%2C%22identity_cutoff%22%3A0.4%7D%7D&return_type=polymer_entity" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "proteinBySequenceCutoff")">40%</a></li><li><a href="/search?query=%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22sequence%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22target%22%3A%22pdb_protein_sequence%22%2C%22value%22%3A%22MTDKIAVLLGGTSAEREVSLNSGAAVLAGLREGGIDAYPVDPKEVDVTQLKSMGFQKVFIALHGRGGEDGTLQGMLELMGLPYTGSGVMASALSMDKLRSKLLWQGAGLPVAPWVALTRAEFEKGLSDKQLAEISALGLPVIVKPSREGSSVGMSKVVAENALQDALRLAFQHDEEVLIEKWLSGPEFTVAILGEEILPSIRIQPSGTFYDYEAKYLSDETQYFCPAGLEASQEANLQALVLKAWTTLGCKGWGRIDVMLDSDGQFYLLEANTSPGMTSHSLVPMAARQAGMSFSQLVVRILELAD%22%2C%22identity_cutoff%22%3A0.3%7D%7D&return_type=polymer_entity" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "proteinBySequenceCutoff")">30%</a></li></ul></div> (by identity cutoff) | <a href="/search?query=%7B%22type%22%3A%22terminal%22%2C%22service%22%3A%22structure%22%2C%22parameters%22%3A%7B%22value%22%3A%7B%22entry_id%22%3A%222DLN%22%2C%22asym_id%22%3A%22A%22%7D%7D%7D&return_type=polymer_entity" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "proteinBy3Dstructure")">3D Structure</a></div><div class="table-responsive"><a class="entity-anchor" name="entity-1"></a><table class="table table-bordered table-condensed tableEntity" id="table_macromolecule-protein-entityId-1"><tbody><tr class="info" style="color: #315880"><th colspan="6" style="padding-bottom: 0px; padding-top: 0px"><h5 style="font-weight: bold; font-size: 15px">Entity ID: 1</h5></th></tr><tr><th class="col-sm-2 col-lg-2 pad-by-five">Molecule</th><th class="col-sm-2 col-lg-2 pad-by-five">Chains <span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="If the two PDB chain IDs (label_asym_id; assigned by the PDB) and auth_asym_id (selected by the author) do not coincide, the chain ID is displayed as “label_asym_id [auth auth_asym_id]”"></span></th><th class="col-sm-2 col-lg-2 pad-by-five">Sequence Length</th><th class="col-sm-2 col-lg-2 pad-by-five">Organism</th><th class="col-sm-2 col-lg-2 pad-by-five">Details</th><th class="col-sm-2 col-lg-2 pad-by-five">Image</th></tr><tr id="macromolecule-entityId-1-rowDescription"><td>D-ALANINE--D-ALANINE LIGASE</td><td style="width:200px;"><div><a href="/sequence/2DLN#A">A</a></div></td><td>306</td><td><!-- Check if there is any data inside organism array--><a class="querySearchLink" href="/search?q=rcsb_entity_source_organism.taxonomy_lineage.name:Escherichia coli" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "organism")">Escherichia coli</a></td><td style="word-break: break-all;"><strong>Mutation(s)</strong>: 0 <span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="The number of mutations in this polymer sequence that are engineered from the reference sequence."></span><br><strong>EC: </strong><a class="querySearchLink" href="/search?q=rcsb_polymer_entity.rcsb_ec_lineage.id:6.3.2.4" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "ec")">6.3.2.4</a><br></td><td style="text-align: center; vertical-align: middle"><a data-toggle="lightbox" data-title="2DLN_1: Represented by Chain A" href="https://cdn.rcsb.org/images/structures/2dln_chain-A.jpeg"><img src="https://cdn.rcsb.org/images/structures/2dln_chain-A.jpeg" style="width:100px;"></a></td></tr><tr><td colspan="6" style="padding-bottom: 0px; padding-top: 0px; background-color: #f5f5f5;"><h5 style="font-weight: bold; font-size: 15px">UniProt</h5></td></tr><tr><td colspan="6"><div class="col-lg-6 col-md-6 text-left" style="padding-left: 0">Find proteins for <a class="querySearchLink" href="/search?q=rcsb_polymer_entity_container_identifiers.reference_sequence_identifiers.database_accession:P07862 AND rcsb_polymer_entity_container_identifiers.reference_sequence_identifiers.database_name:UniProt" onClick="sendGtag("macromolecule_section", "ssp_search_link", "uniprotId")">P07862</a> <i>(Escherichia coli (strain K12))</i></div><div class="col-lg-3 col-md-3">Explore <span class="label label-rcsb"><a href="/groups/sequence/polymer_entity/P07862">P07862</a></span> <span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="Explore entries with the same UniProt reference sequence."></span></div><div class="col-lg-3 col-md-3 text-right" style="padding-right: 0">Go to UniProtKB:  <span class="label label-external"><a href="https://www.uniprot.org/uniprot/P07862" target="_blank" rel="noopener">P07862</a></span></div></td></tr><tr><td colspan="6" style="padding-bottom: 0px; padding-top: 0px; background-color: #f5f5f5;"><h5 style="font-weight: bold; font-size: 15px">Entity Groups  <span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="This entity has been grouped together with similar entities from other structures. Use the links below to navigate to the corresponding group pages and explore the characteristics of similar entities." style="vertical-align: bottom;"></span></h5></td></tr><tr><td class="col-lg-2 col-md-2">Sequence Clusters</td><td class="col-lg-10 col-md-10 group-membership" colspan="5"><span class="label label-rcsb"><a href="/groups/summary/polymer_entity/227_30">30% Identity<span class="fa fa-clone"></span></a></span><span class="label label-rcsb"><a href="/groups/summary/polymer_entity/1594_50">50% Identity<span class="fa fa-clone"></span></a></span><span class="label label-rcsb"><a href="/groups/summary/polymer_entity/3343_70">70% Identity<span class="fa fa-clone"></span></a></span><span class="label label-rcsb"><a href="/groups/summary/polymer_entity/6689_90">90% Identity<span class="fa fa-clone"></span></a></span><span class="label label-rcsb"><a href="/groups/summary/polymer_entity/9193_95">95% Identity<span class="fa fa-clone"></span></a></span><span class="label label-rcsb"><a href="/groups/summary/polymer_entity/13904_100">100% Identity<span class="fa fa-clone"></span></a></span></td></tr><tr><td class="col-lg-2 col-md-2">UniProt Group</td><td class="col-lg-10 col-md-10 group-membership" colspan="5"><span class="label label-rcsb"><a href="/groups/summary/polymer_entity/P07862">P07862<span class="fa fa-clone"></span></a></span></td></tr><tr><td colspan="6" style="padding-bottom: 0px; padding-top: 0px; background-color: #f5f5f5;"><h5 style="font-weight: bold; font-size: 15px; display:inline-block;float:left">Sequence Annotations</h5><h5 style="font-weight: bold; font-size: 15px; display:inline-block;float:right;"><a href="/sequence/2DLN#A">Expand</a></h5></td></tr><tr style="border-bottom: 5px solid #ddd" id="RcsbFv"><td class="ProteinFeatureView" colspan="6"><div id="entity" style="margin-top:20px"><div class="col-xs-12 col-sm-12 col-md-4 col-lg-4 form-group" style="margin-bottom: 0; padding-left: 0"><ul class="list-group" style="margin-bottom:0;display:inline-block;width:50%;"><li class="list-group-item" style="border-color:#fff;"><strong>Reference Sequence</strong></li></ul><div id="rcsbWebAppSelect_1" style="display:inline-block;"></div><div class="material-switch pull-right"></div></div></div><div class="clearfix"></div><div id="rcsbWebApp_1" style="margin-bottom: 50px;"></div><script>var headers = { "Rcsb-Analytics-Traffic-Origin": "internal", "Rcsb-Analytics-Traffic-Stage": "saguaro" }; [window.RcsbFvWebApp, window.RcsbChartWebApp, window.RcsbFv3D].forEach(webApp=>{ if (webApp) { webApp.RcsbRequestContextManager.initializeBorregoClient({ api: RC.sequenceCoordinatesUrl + 'graphql', requestConfig: { headers } }); webApp.RcsbRequestContextManager.initializeYosemiteClient({ api: RC.dataUrl + 'graphql', requestConfig: { headers } }); webApp.RcsbRequestContextManager.initializeArchesClient({ uri: RC.searchUrl + 'query', requestConfig: { headers } }); } });</script><script>setTimeout(function(){ RcsbFvWebApp.buildEntitySummaryFv( "rcsbWebApp_1", "rcsbWebAppSelect_1", "2DLN_1" ); },100) </script></td></tr></tbody></table></div></div></div></div></div></div><div class="panel panel-default" id="smallMoleculespanel"><div class="panel-heading"><div class="panel-title">Small Molecules</div></div><div class="panel-body"><div class="row"><div class="col-md-12 col-sm-12 col-xs-12"><div class="table-responsive" id="LigandsTable"><table class="table table-bordered table-condensed" id="LigandsMainTable"><tr class="active"><th colspan="6">Ligands <span class="badge">3 Unique</span></th></tr><tr><th class="col-sm-2 col-lg-2 pad-by-five">ID</th><th class="col-sm-1 col-lg-1 pad-by-five">Chains <span class="glyphicon glyphicon-info-sign hidden-xs hidden-sm hidden-md" aria-hidden="true" data-toggle="tooltip" data-placement="top" data-original-title="If the two PDB chain IDs (label_asym_id; assigned by the PDB) and auth_asym_id (selected by the author) do not coincide, the chain ID is displayed as “label_asym_id [auth auth_asym_id]”"></span></th><th class="col-sm-3 col-lg-4 pad-by-five">Name / Formula / InChI Key</th><th class="col-sm-3 col-lg-3 pad-by-five">2D Diagram</th><th class="col-sm-2 col-lg-2 pad-by-five">3D Interactions</th></tr><tbody><a name="chem-comp-ADP"></a><tr id="ligand_row_ADP"><td><a href="/ligand/ADP">ADP</a><br><a class="hidden-print querySearchLink" href="/search?q=rcsb_chem_comp_container_identifiers.comp_id:ADP" onClick="sendGtag("smallmoleculeLigand_section", "ssp_search_link", "ligandId")">Query on ADP</a><br><hr><a class="btn btn-default btn-xs hidden-print" href="https://files.rcsb.org/ligands/download/ADP.cif">Download Ideal Coordinates CCD File <span class="glyphicon glyphicon-download"></span></a><br><div style="display: list-item; margin-bottom: 5px;"><div class="btn-group" role="group" style="position: absolute"><button class="btn btn-xs btn-default dropdown-toggle" id="dropdownMenuDisplayCordinateFiles" type="button" data-toggle="dropdown" aria-expanded="false" role="group">Download Instance Coordinates <span class="caret"></span></button><ul class="dropdown-menu" role="menu" aria-labelledby="dropdownMenuDisplayCordinateFiles"><li><a href="https://models.rcsb.org/v1/2dln/ligand?auth_seq_id=310&label_asym_id=D&encoding=sdf&filename=2dln_D_ADP.sdf">SDF format, chain D [auth A]</a></li><li class="divider"></li><li><a href="https://models.rcsb.org/v1/2dln/ligand?auth_seq_id=310&label_asym_id=D&encoding=mol2&filename=2dln_D_ADP.mol2">MOL2 format, chain D [auth A]</a></li><li class="divider"><li><a href="https://models.rcsb.org/v1/2dln/ligand?auth_seq_id=310&label_asym_id=D&filename=2dln_D_ADP.cif">mmCIF format, chain D [auth A]</a></li></li></ul></div></div></td><td>D [auth A]</td><td><strong>ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE</strong><br>C<sub>10</sub> H<sub>15</sub> N<sub>5</sub> O<sub>10</sub> P<sub>2</sub><br>XTWYTFMLZFPYCI-KQYNXXCUSA-N</td><td><a data-toggle="lightbox" data-title="2DLN: Ligand ADP" href="https://cdn.rcsb.org/images/ccd/labeled/A/ADP.svg"><img src="https://cdn.rcsb.org/images/ccd/unlabeled/A/ADP.svg" style="width:116px; margin: 0 auto; display: block;"></a></td><td><div class="btn-group view-button-3d" role="group" style="position: absolute;"><a class="btn btn-default btn-xs dropdown-toggle" id="dropdownMenuLigandFocus_ADP" type="button" data-toggle="dropdown" aria-expanded="false" role="group" title="Focus on a ligand and show non-covalent interactions with its surroundings."><i class="fa fa-cube"> </i>Interactions <span class="caret"></span></a><ul class="dropdown-menu" role="menu" aria-labelledby="dropdownMenuLigandFocus_ADP"><li><a href="/3d-view/2DLN?preset=ligandInteraction&label_asym_id=D">Focus chain D [auth A]</a></li></ul></div></td></tr><a name="chem-comp-PHY"></a><tr id="ligand_row_PHY"><td><a href="/ligand/PHY">PHY</a><br><a class="hidden-print querySearchLink" href="/search?q=rcsb_chem_comp_container_identifiers.comp_id:PHY" onClick="sendGtag("smallmoleculeLigand_section", "ssp_search_link", "ligandId")">Query on PHY</a><br><hr><a class="btn btn-default btn-xs hidden-print" href="https://files.rcsb.org/ligands/download/PHY.cif">Download Ideal Coordinates CCD File <span class="glyphicon glyphicon-download"></span></a><br><div style="display: list-item; margin-bottom: 5px;"><div class="btn-group" role="group" style="position: absolute"><button class="btn btn-xs btn-default dropdown-toggle" id="dropdownMenuDisplayCordinateFiles" type="button" data-toggle="dropdown" aria-expanded="false" role="group">Download Instance Coordinates <span class="caret"></span></button><ul class="dropdown-menu" role="menu" aria-labelledby="dropdownMenuDisplayCordinateFiles"><li><a href="https://models.rcsb.org/v1/2dln/ligand?auth_seq_id=320&label_asym_id=E&encoding=sdf&filename=2dln_E_PHY.sdf">SDF format, chain E [auth A]</a></li><li class="divider"></li><li><a href="https://models.rcsb.org/v1/2dln/ligand?auth_seq_id=320&label_asym_id=E&encoding=mol2&filename=2dln_E_PHY.mol2">MOL2 format, chain E [auth A]</a></li><li class="divider"><li><a href="https://models.rcsb.org/v1/2dln/ligand?auth_seq_id=320&label_asym_id=E&filename=2dln_E_PHY.cif">mmCIF format, chain E [auth A]</a></li></li></ul></div></div></td><td>E [auth A]</td><td><strong>1(S)-AMINOETHYL-(2-CARBOXYPROPYL)PHOSPHORYL-PHOSPHINIC ACID</strong><br>C<sub>6</sub> H<sub>15</sub> N O<sub>7</sub> P<sub>2</sub><br>BAIYWTZQRMCJBV-DKDXWZAISA-N</td><td><a data-toggle="lightbox" data-title="2DLN: Ligand PHY" href="https://cdn.rcsb.org/images/ccd/labeled/P/PHY.svg"><img src="https://cdn.rcsb.org/images/ccd/unlabeled/P/PHY.svg" style="width:116px; margin: 0 auto; display: block;"></a></td><td><div class="btn-group view-button-3d" role="group" style="position: absolute;"><a class="btn btn-default btn-xs dropdown-toggle" id="dropdownMenuLigandFocus_PHY" type="button" data-toggle="dropdown" aria-expanded="false" role="group" title="Focus on a ligand and show non-covalent interactions with its surroundings."><i class="fa fa-cube"> </i>Interactions <span class="caret"></span></a><ul class="dropdown-menu" role="menu" aria-labelledby="dropdownMenuLigandFocus_PHY"><li><a href="/3d-view/2DLN?preset=ligandInteraction&label_asym_id=E">Focus chain E [auth A]</a></li></ul></div></td></tr><a name="chem-comp-MG"></a><tr id="ligand_row_MG"><td><a href="/ligand/MG">MG</a><br><a class="hidden-print querySearchLink" href="/search?q=rcsb_chem_comp_container_identifiers.comp_id:MG" onClick="sendGtag("smallmoleculeLigand_section", "ssp_search_link", "ligandId")">Query on MG</a><br><hr><a class="btn btn-default btn-xs hidden-print" href="https://files.rcsb.org/ligands/download/MG.cif">Download Ideal Coordinates CCD File <span class="glyphicon glyphicon-download"></span></a><br><div style="display: list-item; margin-bottom: 5px;"><div class="btn-group" role="group" style="position: absolute"><button class="btn btn-xs btn-default dropdown-toggle" id="dropdownMenuDisplayCordinateFiles" type="button" data-toggle="dropdown" aria-expanded="false" role="group">Download Instance Coordinates <span class="caret"></span></button><ul class="dropdown-menu" role="menu" aria-labelledby="dropdownMenuDisplayCordinateFiles"><li><a href="https://models.rcsb.org/v1/2dln/ligand?auth_seq_id=330&label_asym_id=B&encoding=sdf&filename=2dln_B_MG.sdf">SDF format, chain B [auth A]</a></li><li><a href="https://models.rcsb.org/v1/2dln/ligand?auth_seq_id=331&label_asym_id=C&encoding=sdf&filename=2dln_C_MG.sdf">SDF format, chain C [auth A]</a></li><li class="divider"></li><li><a href="https://models.rcsb.org/v1/2dln/ligand?auth_seq_id=330&label_asym_id=B&encoding=mol2&filename=2dln_B_MG.mol2">MOL2 format, chain B [auth A]</a></li><li><a href="https://models.rcsb.org/v1/2dln/ligand?auth_seq_id=331&label_asym_id=C&encoding=mol2&filename=2dln_C_MG.mol2">MOL2 format, chain C [auth A]</a></li><li class="divider"><li><a href="https://models.rcsb.org/v1/2dln/ligand?auth_seq_id=330&label_asym_id=B&filename=2dln_B_MG.cif">mmCIF format, chain B [auth A]</a></li><li><a href="https://models.rcsb.org/v1/2dln/ligand?auth_seq_id=331&label_asym_id=C&filename=2dln_C_MG.cif">mmCIF format, chain C [auth A]</a></li></li></ul></div></div></td><td>B [auth A],<br>C [auth A]</td><td><strong>MAGNESIUM ION</strong><br>Mg<br>JLVVSXFLKOJNIY-UHFFFAOYSA-N</td><td><a data-toggle="lightbox" data-title="2DLN: Ligand MG" href="https://cdn.rcsb.org/images/ccd/labeled/M/MG.svg"><img src="https://cdn.rcsb.org/images/ccd/unlabeled/M/MG.svg" style="width:116px; margin: 0 auto; display: block;"></a></td><td><div class="btn-group view-button-3d" role="group" style="position: absolute;"><a class="btn btn-default btn-xs dropdown-toggle" id="dropdownMenuLigandFocus_MG" type="button" data-toggle="dropdown" aria-expanded="false" role="group" title="Focus on a ligand and show non-covalent interactions with its surroundings."><i class="fa fa-cube"> </i>Interactions <span class="caret"></span></a><ul class="dropdown-menu" role="menu" aria-labelledby="dropdownMenuLigandFocus_MG"><li><a href="/3d-view/2DLN?preset=ligandInteraction&label_asym_id=B">Focus chain B [auth A]</a></li><li><a href="/3d-view/2DLN?preset=ligandInteraction&label_asym_id=C">Focus chain C [auth A]</a></li></ul></div></td></tr></tbody></table></div></div></div></div></div><div class="panel panel-default" id="experimentaldata-validation"><div class="panel-heading"><div class="panel-title">Experimental Data & Validation</div></div><div class="panel-body"><div class="row"><div class="col-md-6 col-sm-12 col-xs-12"><h4>Experimental Data</h4><div class="row"><ul class="list-unstyled col-sm-12 col-lg-12 col-md-12" id="experimentaldatabottom"><li id="exp_header_0_method"><strong>Method: </strong>X-RAY DIFFRACTION</li><li id="exp_header_0_diffraction_resolution"><strong>Resolution: </strong>2.30 Å</li><li id="exp_header_0_diffraction_rvalueWork"><strong>R-Value Work: </strong>0.172 </li><li id="exp_header_0_diffraction_rvalueObserved"><strong>R-Value Observed: </strong>0.172 </li><li id="exp_undefined_xray_spaceGroup"><strong>Space Group: <a class="querySearchLink" href="/search?q=symmetry.space_group_name_H_M:P 21 21 2" onClick="sendGtag("experimental_section", "ssp_search_link", "spaceGroup")">P 2<sub>1</sub> 2<sub>1</sub> 2</a></strong></li></ul><div class="col-lg-12 col-md-12 col-sm-12"><strong>Unit Cell</strong>:<table class="table table-bordered table-condensed" id="unitCellTable"><thead><tr class="active"><th>Length ( Å )</th><th>Angle ( ˚ )</th></tr></thead><tbody><tr><td>a = 99.3</td><td>α = 90</td></tr><tr><td>b = 51.4</td><td>β = 90</td></tr><tr><td>c = 51.2</td><td>γ = 90</td></tr></tbody></table></div></div><strong>Software Package:</strong><table class="table table-bordered table-condensed" id="xraysoftwarePackages"><thead><tr class="active"><th>Software Name</th><th>Purpose</th></tr></thead><tbody><tr><td>X-PLOR</td><td>model building</td></tr><tr><td>PROLSQ</td><td>refinement</td></tr><tr><td>X-PLOR</td><td>refinement</td></tr><tr><td>X-PLOR</td><td>phasing</td></tr></tbody></table></div><div class="col-md-6 col-sm-12 col-xs-12"><!-- Experimental Validation HTML / PDF--><h4>Structure Validation</h4><!-- NOTE: check pdx/idf/ftp.json file--><p id="validationSection">View <a target="_blank" rel="noopener" href="//files.rcsb.org/pub/pdb/validation_reports/dl/2dln/2dln_full_validation.pdf">Full Validation Report</a></p><a target="_blank" rel="noopener" href="//files.rcsb.org/pub/pdb/validation_reports/dl/2dln/2dln_full_validation.pdf"><img class="img-thumbnail" src="//files.rcsb.org/pub/pdb/validation_reports/dl/2dln/2dln_multipercentile_validation.png" width="500"></a><br></div></div><br><div class="row"><div class="col-md-6 col-sm-12 col-xs-12"><a class="btn btn-sm btn-default hidden-print" href="/experimental/2DLN">View more in-depth experimental data</a></div></div></div></div><div class="panel panel-default" id="entry-history"><div class="panel-heading"><div class="panel-title">Entry History </div></div><div class="panel-body"><div class="row"><div class="col-md-6 col-sm-6 col-xs-12 col-xs-12"><h4>Deposition Data</h4><ul class="list-unstyled" id="DepositionDataList"><li><strong>Released Date: </strong>1995-11-01 </li><strong>Deposition Author(s): </strong><a href="/search?q=audit_author.name:Knox, J.R." onClick="sendGtag("entryHistory_section", "ssp_search_link", "depAuthor")">Knox, J.R.</a>, <a href="/search?q=audit_author.name:Moews, P.C." onClick="sendGtag("entryHistory_section", "ssp_search_link", "depAuthor")">Moews, P.C.</a>, <a href="/search?q=audit_author.name:Fan, C." onClick="sendGtag("entryHistory_section", "ssp_search_link", "depAuthor")">Fan, C.</a></ul></div><div class="col-md-6 col-sm-6 col-xs-12 col-xs-12"><h4>Revision History <small><a href="/versions/2DLN">(Full details and data files)</a></small></h4><ul id="revisionHistorySection"><li><strong>Version 1.0: 1995-11-01</strong><br>Type: Initial release<br></li><li><strong>Version 1.1: 2008-03-03</strong><br>Changes: Version format compliance </li><li><strong>Version 1.2: 2011-07-13</strong><br>Changes: Version format compliance </li><li><strong>Version 1.3: 2019-07-17</strong><br>Changes: Data collection, Other, Refinement description </li><li><strong>Version 1.4: 2019-08-14</strong><br>Changes: Data collection, Refinement description </li><li><strong>Version 1.5: 2024-02-14</strong><br>Changes: Data collection, Database references, Derived calculations </li></ul></div></div></div></div></div><div class="clearfix"></div><script>$("#structuresummarytab").addClass("active"); </script><script src="/js/structure/helper.js"></script><script src="/js/structure/image_carousel_helper.js"></script></div><div data-elastic-exclude><div class="hidden-print" id="footer_main"><div class="container" style="padding:0"><div class="row"><div class="col-md-6 col-sm-12" style="padding-left:0"> <div class="row"><div class="col-sm-4"><ul><li><span class="row_header">About</span></li><li><a href="/pages/about-us/index">About Us</a></li><li><a href="/pages/policies#References">Citing Us</a></li><li><a href="/pages/publications">Publications</a></li><li><a href="/pages/team">Team</a></li><li><a href="/pages/jobs">Careers</a></li><li><a href="/pages/policies">Usage & Privacy</a></li></ul></div><div class="col-sm-4" style="padding-left:0"><ul><li><span class="row_header">Support</span></li><li><a href="/pages/contactus">Contact Us</a></li><li><a href="/help">Help</a></li><li><a href="/docs/general-help/website-faq">Website FAQ</a></li><li><a href="/docs/general-help/glossary">Glossary</a></li><li><a href="https://status.rcsb.org/" target="_blank">Service Status</a></li></ul></div><div class="col-md-4 hidden-sm"></div></div></div><div class="col-md-6 col-sm-12" style="padding-left:5px"> <div class="row"><div class="col-sm-4"><p class="row_header">RCSB PDB is hosted by</p><div class="footerLogos"><hr><a href="http://www.rutgers.edu/"><img class="Rutgerslogo" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb//v2/common/images/Logo_Rutgers-2024.png" alt="Rutgers University logo"></a><hr><a href="https://ucsd.edu/"><img class="UCSDlogo" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb//v2/common/images/Logo_UCSD-navy.png" alt="Uiversity of California San Diego logo"></a><a href="https://www.sdsc.edu/"><img class="SDSClogo" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb//v2/common/images/Logo_SDSC-black.png" alt="San Diego Supercomputer Center logo"></a><hr><a href="https://www.ucsf.edu/"><img class="UCSFlogo" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb//v2/common/images/Logo_UCSF.png" alt="University of California San Francisco Logo"></a></div></div><div class="col-sm-4"><p class="row_header">RCSB PDB is a member of the</p><div class="footerLogos"><span id="pdbmembers_footer"><hr><a href="https://www.wwpdb.org" target="_blank" rel="noopener"><img class="wwpdblogo" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb//v2/common/images/Logo_wwpdb.png" alt="wwPDB"></a><hr><a href="https://www.emdataresource.org" target="_blank" rel="noopener"><img id="emdatabanklogo_footer" src="https://cdn.rcsb.org/rcsb-pdb//v2/common/images/EMDataResourcelogo.png" alt="EMDataResource"></a></span></div></div><div class="col-sm-4"><ul><li><span class="row_header">RCSB Partners</span></li><li><a href="https://nakb.org/" target="_blank" rel="noopener">Nucleic Acid Knowledgebase</a></li></ul><ul><li><span class="row_header"><a href="https://www.wwpdb.org/" target="_blank" rel="noopener" style="text-decoration: none; color: black">wwPDB Partners</a></span></li><li><a href="/">RCSB PDB</a></li><li><a href="https://www.ebi.ac.uk/pdbe/" target="_blank" rel="noopener">PDBe</a></li><li><a href="https://www.pdbj.org/" target="_blank" rel="noopener">PDBj</a></li><li><a href="https://bmrb.io/" target="_blank" rel="noopener">BMRB</a></li><li><a href="https://emdb-empiar.org/" target="_blank" rel="noopener">EMDB</a></li></ul></div></div></div></div></div></div><div id="footer_grant"><div class="container"><div class="row"><p>RCSB PDB Core Operations are funded by the <a href="http://www.nsf.gov/" target="_blank" rel="noopener">U.S. National Science Foundation</a> (DBI-2321666), the <a href="http://science.energy.gov/" target="_blank" rel="noopener">US Department of Energy</a> (DE-SC0019749), and the <a href="http://www.cancer.gov/" target="_blank" rel="noopener">National Cancer Institute</a>, <a href="http://www.niaid.nih.gov/" target="_blank" rel="noopener">National Institute of Allergy and Infectious Diseases</a>, and <a href="http://www.nigms.nih.gov/" target="_blank" rel="noopener">National Institute of General Medical Sciences</a> of the <a href="http://www.nih.gov/" target="_blank" rel="noopener">National Institutes of Health</a> under grant R01GM157729.</p></div></div></div><div id="jira-fdbck"></div></div></div></body></html>