Japanese Genotype-phenotype Archive

<!DOCTYPE html> <html lang="ja"> <head> <meta charset="UTF-8" /> <meta property="og:title" content="Japanese Genotype-phenotype Archive" /> <meta property="og:url" content="https://www.ddbj.nig.ac.jp/jga/index.html" /> <meta property="og:description" content="概要Japanese Genotype-phenotype Archive (JGA)は個人レベルの遺伝学的なデータと匿名化された表現型情報を保存し，提供してい..." /> <meta property6="og:image" content="/images/thumbnail/logo_ddbj_fb.png" /> <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1.0" /> <title>Japanese Genotype-phenotype Archive</title> <script async src="https://www.google-analytics.com/analytics.js"></script> <script src="https://code.jquery.com/jquery-3.5.0.js" integrity="sha256-r/AaFHrszJtwpe+tHyNi/XCfMxYpbsRg2Uqn0x3s2zc=" crossorigin="anonymous"></script> <script src="https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/jquery.hoverintent/1.10.1/jquery.hoverIntent.min.js" integrity="sha512-gx3WTM6qxahpOC/hBNUvkdZARQ2ObXSp/m+jmsEN8ZNJPymj8/Jamf8+/3kJQY1RZA2DR+KQfT+b3JEB0r9YRg==" crossorigin="anonymous"></script> <script src="https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/spin.js/4.1.0/spin.min.js" integrity="sha512-CbohqWjAgarTqRHcX1MbwkF2pujwbsCee1PABpnBWC+VqSldvlNEEI5+4OSsR/HbFQOFFpwY2YvZZNjBMxNnXg==" crossorigin="anonymous"></script> <script type="text/javascript" src="https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/jquery.colorbox/1.6.4/jquery.colorbox-min.js"></script> <script type="text/javascript" src="https://cdnjs.cloudflare.com/ajax/libs/jquery-deparam/0.5.3/jquery-deparam.min.js"></script> <script type="text/javascript" src="https://www.ddbj.nig.ac.jp/assets/js/jquery.trace.js"></script> <script type="text/javascript" src="https://www.ddbj.nig.ac.jp/assets/js/jquery.json_search.js"></script> <link rel="icon" href="https://www.ddbj.nig.ac.jp/assets/images/favicon_ddbj.ico"> <link rel="stylesheet" href="https://www.ddbj.nig.ac.jp/assets/css/colorbox.css" /> <link rel="stylesheet" href="https://www.ddbj.nig.ac.jp/assets/css/main.css" /> <link rel="alternate" type="application/rss+xml" title="My Site RSS" href="/feed.xml" /> <script src="https://www.ddbj.nig.ac.jp/assets/js/main.js"></script> </head> <body data-category="jga"> <script src="https://www.ddbj.nig.ac.jp/assets/js/ddbj_common_framework.js" id="DDBJ_common_framework" style="display: block; height: 40px;" data-bottom-menu="true" data-ddbj-home-page="true" data-search="true" ></script> <section class="top-news-view"> <div class="inner"> <ul> <li class="item"> <a href="https://www.ddbj.nig.ac.jp/news/ja/2024-10-22">国際塩基配列データベース「DDBJ」に対するサイバー脅迫に関するご報告</a> </li> <li class="item"> <a href="https://www.ddbj.nig.ac.jp/news/ja/2024-11-25">(12/12 8:00-12/20 12:00) DDBJ センターの登録、検索・解析サービス停止のお知らせ</a> </li> </ul> </div> </section> <div id="primary"> <div id="TopPageView"> <div class="inner"> <section class="maincolumn"> <header data-category="jga"> <h1 class="title">Japanese Genotype-phenotype Archive</h1> <div class="description"></div> </header> <nav class="tab-menu-view"> <ul class="tabmenucontainer"> <li class=" -current"> <a href="/jga/index.html">Home</a> </li> <li class=" -haschild"> <a href="https://humandbs.biosciencedbc.jp/data-use/all-researches">Browse researches at NBDC</a> <ul> <li> <a href="https://ddbj.nig.ac.jp/search">DDBJ Search</a> </li> </ul> </li> <li class=" -haschild"> <a href="/jga/submission.html">Submission</a> <ul> <li> <a href="/jga/submission-step.html">How to submit</a> </li> <li> <a href="/jga/download.html">How to access data</a> </li> <li> <a href="/jga/group.html">Groups</a> </li> <li> <a href="https://github.com/ddbj/submission-excel2xml/tree/main/example">Example submission</a> </li> <li> <a href="https://github.com/ddbj/pub/tree/master/docs/jga/xsd/">XML Schema</a> </li> </ul> </li> <li class=""> <a href="/faq/ja/index.html?tag=jga">FAQ</a> </li> </ul> </nav> <nav class="breadcrumb-view"> <ul> <li> <a href="https://www.ddbj.nig.ac.jp/index.html">ホーム</a> </li> <li> <a href="https://www.ddbj.nig.ac.jp/jga/index.html">jga</a> </li> <li><a>Japanese Genotype-phenotype Archive</a></li> </ul> </nav> <main class="md-content"> <h2 id="introduction">概要</h2> <p>Japanese Genotype-phenotype Archive (JGA) は個人レベルの遺伝学的なデータと匿名化された表現型情報を保存し，提供しています。データが収集された個人との間の同意に基づく協定により，JGA のデータ利用は特定の研究目的に制限されています。 JGA は厳格なプロトコールに従い，情報を管理，格納，提供しています。登録処理が終わった全てのデータは暗号化されます。 JGA チームには<a href="/contact-ddbj.html">こちらから連絡</a>することができます。<br /> なお，JGA に登録されるデータおよびデータの利用についての審査は<a href="http://humandbs.dbcls.jp/">ライフサイエンス統合データベースセンタ (DBCLS)</a> が実施しています。</p> <h2 id="access">データの利用</h2> <p>JGA はデータを格納する際にそのデータに適用される利用制限ポリシーを登録しますが，利用者のデータ利用の可否については <a href="http://humandbs.dbcls.jp/">DBCLS</a> が審査します。利用者は <a href="http://humandbs.dbcls.jp/">DBCLS</a> にデータの利用を申請し，JGA は DBCLS からの利用承認連絡を受け，利用者にデータへの安全なアクセスを提供します。</p> <h2 id="submission">データの登録</h2> <p>JGA は DBCLS で承認された匿名化されたデータだけを受け付けています (<a href="/policies.html#submission-of-human-data">ヒトを対象とした研究データの登録について</a>)。登録者は <a href="http://humandbs.dbcls.jp/">DBCLS</a> に JGA へのデータ提供を申請し， DBCLS からデータ提供の承認連絡を受けた登録者は <a href="/contact-ddbj.html">JGA に連絡</a>します。JGA チームはその連絡を受け，登録者に登録手順を別途案内します。</p> <p>データの受領後，JGA はデータベースへの格納のためにデータを処理し，同時に投稿されたオリジナルなファイル形式も保存します。JGA では多岐にわたるデータを受け付けており，アレイと新世代シークエンサーからの生データ，遺伝子型・構造変異，統計解析などの解析処理されたデータを保存しています。また，JGA はサンプルの表現型についてのデータをも登録しています。その他のヒトに関するデータについては，<a href="http://humandbs.dbcls.jp/">ヒトデータ審査委員会事務局</a>にご相談下さい。</p> <h2 id="release">データの公開</h2> <p>NBDC ヒトデータベースで JGA データに対応する <a href="https://humandbs.dbcls.jp/data-use/all-researches">hum 番号の専用サイト</a>が公開されると、JGA データも公開されます。</p> </main> <ul class="panel-view-container"> </ul> </section> <aside class="pickup-news-view"> <div class="container"> <h2 class="title">NEWS</h2> <ul class="list"> <li class="item"> <article class="news"> <a href="/news/ja/2024-11-25.html"> <h3 class="title">(12/12 8:00-12/20 12:00) DDBJ センターの登録、検索・解析サービス停止のお知らせ</h3> <ul class="tag-list-view"> <li class="date"><time datetime="2024-11-25 09:00:00 +0900">2024/11/25</time></li> <li class="tag-view" data-tag="メンテナンス">メンテナンス</li> <li class="tag-view" data-tag="ddbj" title="Annotated/Assembled Sequences (DDBJ)">DDBJ</li> <li class="tag-view" data-tag="bioproject" title="BioProject">BioProject</li> <li class="tag-view" data-tag="biosample" title="BioSample">BioSample</li> <li class="tag-view" data-tag="dra" title="Sequence Read Archive (DRA)">DRA</li> <li class="tag-view" data-tag="gea" title="Genomic Expression Archive (GEA)">GEA</li> <li class="tag-view" data-tag="jga" title="Japanese Genotype-phenotype Archive (JGA)">JGA</li> <li class="tag-view" data-tag="agd" title="AMED Genome Group Sharing Database (AGD)">AGD</li> <li class="tag-view" data-tag="top" title="DDBJ Center">DDBJ Center</li> </ul> </a> </article> </li> </ul> <a class="arrowed-link" href="/news/ja/index.html?tag=jga">more</a> </div> </aside> </div> </div> </div> <footer></footer> <div id="back-top"></div> </body> </html>

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