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BINDS - 創薬等先端技術支援基盤プラットフォーム
<!DOCTYPE html> <html lang="ja"> <head> <meta charset="utf-8"> <meta http-equiv="X-UA-Compatible" content="IE=edge"> <!-- <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1"> --> <title> BINDS - 創薬等先端技術支援基盤プラットフォーム </title> <script> var shiftWindow = function() { scrollBy(0, -120) }; window.addEventListener("hashchange", shiftWindow); function load() { if (window.location.hash) shiftWindow(); } </script> <link rel="stylesheet" href="https://maxcdn.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.3.7/css/bootstrap.min.css"> <link rel="stylesheet" type="text/css" href="/css/non-responsive.css"/> <link rel="stylesheet" type="text/css" href="/css/yamm.css"/> <link rel="stylesheet" type="text/css" href="/css/jquery.fancybox.css"/> <link rel="stylesheet" type="text/css" href="/css/style.css?20190603"/> </head> <body onload="load()" style="padding-top: 20px !important;" id="supports"> <div id="top"></div> <div class="container"> <div class="row"> <div class="col-xs-12"> <h1 class="maintitle c03"> 支援メニュー <div class="pull-right" style="padding-top: 10px;font-size: 1.5rem;"> 全メニューPDFは<a href="/files/pdf/binds_menu.pdf" target="_blank">ここから</a>ダウンロード<br> 領域別PDFは<a href="/downloads/" target="_blank">ここから</a>ダウンロード </div> </h1> </div> </div> <div class="row"> <div class="col-xs-12"> <nav class="navbar yamm supportnav _navbar-primary" role="navigation"> <ul class="_nav navbar-nav nav-fix"> <li class=""><a href="/supports/keyword" class="btn btn-lg btn-primary">キーワード検索から</a></li> <li class="dropdown yamm-fw"> <a href="#" class="dropdown-toggle btn btn-lg btn-primary" data-toggle="dropdown">ユニット/領域名から</a> <ul class="dropdown-menu"> <li> <div class="yamm-content"> <div class="row"> <div class="col-xs-12"> <div class="panel-group" id="menulist_unit"> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading sub_7"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist_unit" href="#menu_unit_7" class="listtitle">プラットフォーム機能最適化ユニット </a> </h4> </div> <div id="menu_unit_7" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_unit_7_1"> <ul> <li><a href="/supports/view/1" target="_blank">データベースの構築とホモロジーモデリングによる機能推定の支援</a></li> <li><a href="/supports/view/2" target="_blank">電子顕微鏡画像・計算結果のアーカイブ及び構造関連データベースの運用</a></li> <li><a href="/supports/view/3" target="_blank">ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定</a></li> <li><a href="/supports/view/4" target="_blank">講習会・セミナーの実施、広報活動</a></li> <li><a href="/supports/view/5" target="_blank">医薬関連情報データベースの構築・公開とVaProSの高度化</a></li> <li><a href="/supports/view/6" target="_blank">知識ベース超分子モデリングによる疾患メカニズム解析</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading sub_1"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist_unit" href="#menu_unit_1" class="listtitle">構造解析ユニット(構造解析領域) </a> </h4> </div> <div id="menu_unit_1" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_unit_1_1"> <ul> <li><a href="/supports/view/7" target="_blank">SPring-8高難度タンパク質結晶構造解析</a></li> <li><a href="/supports/view/8" target="_blank">SPring-8遠隔実験支援システム</a></li> <li><a href="/supports/view/9" target="_blank">高エネルギーX線を利用した結晶構造解析</a></li> <li><a href="/supports/view/10" target="_blank">SPring-8:温湿度制御(HAG法)による生理活性状態での構造変化の解析</a></li> <li><a href="/supports/view/12" target="_blank">SPring-8タンパク質溶液散乱測定</a></li> <li><a href="/supports/view/11" target="_blank">X線自由電子レーザーを用いたシリアルフェムト秒結晶構造解析法</a></li> <li><a href="/supports/view/13" target="_blank">KEK-PFタンパク質結晶構造解析プラットフォーム</a></li> <li><a href="/supports/view/14" target="_blank">KEK-PF天然タンパク質に含まれる硫黄原子を利用したタンパク質の構造解析</a></li> <li><a href="/supports/view/15" target="_blank">KEK-PF生体高分子X線溶液散乱</a></li> <li><a href="/supports/view/16" target="_blank">KEKクライオ電子顕微鏡による単粒子解析に向けたデータ測定</a></li> <li><a href="/supports/view/17" target="_blank">創薬等ライフサイエンス研究のための多階層構造生命科学解析支援</a></li> <li><a href="/supports/view/18" target="_blank">生体超分子複合体を中心としたタンパク質結晶構造解析(BL44XU)</a></li> <li><a href="/supports/view/19" target="_blank">高分解能クライオ電子顕微鏡解析</a></li> <li><a href="/supports/view/20" target="_blank">NMR生体分子構造相互作用解析</a></li> <li><a href="/supports/view/21" target="_blank">NMRによるタンパク質の相互作用解析</a></li> <li><a href="/supports/view/22" target="_blank">クライオ電顕ネイティブ複合体解析</a></li> <li><a href="/supports/view/23" target="_blank">クライオ電子顕微鏡による構造解析(トモグラフィー・単粒子解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/24" target="_blank">クライオ電子顕微鏡法による生体分子構造解析の高分解能化と効率化</a></li> <li><a href="/supports/view/25" target="_blank">クライオ電子顕微鏡による膜タンパク質の単粒子解析</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading sub_2"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist_unit" href="#menu_unit_2" class="listtitle">構造解析ユニット(タンパク質生産領域) </a> </h4> </div> <div id="menu_unit_2" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_unit_2_1"> <ul> <li><a href="/supports/view/26" target="_blank">クライオ電子顕微鏡法のための膜タンパク質複合体の生産と試料調製技術</a></li> <li><a href="/supports/view/27" target="_blank">高難度創薬ターゲット蛋白質の構造解析品質での迅速生産</a></li> <li><a href="/supports/view/28" target="_blank">創薬ターゲットに対する構造認識抗体/バインダーの生産支援</a></li> <li><a href="/supports/view/29" target="_blank">エピジェネティクス研究と創薬のための再構成クロマチンの提供</a></li> <li><a href="/supports/view/30" target="_blank">コムギ無細胞系を用いた複合体タンパク質の生産及び低分子抗体作製</a></li> <li><a href="/supports/view/31" target="_blank">高難度モノクローナル抗体開発とその包括的エンジニアリング</a></li> <li><a href="/supports/view/32" target="_blank">次世代構造創薬研究を先導するヒト膜タンパク質・抗体の生産技術支援</a></li> <li><a href="/supports/view/33" target="_blank">創薬関連ヒト膜タンパク質の生産から結晶化/ワンストップ支援とその高度化</a></li> <li><a href="/supports/view/34" target="_blank">無細胞系・生細胞系による高難度タンパク質生産支援</a></li> <li><a href="/supports/view/35" target="_blank">単粒子解析に向けたタンパク質複合体の生産</a></li> <li><a href="/supports/view/36" target="_blank">X線結晶構造解析のための全自動大規模結晶化スクリーニング</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading sub_3"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist_unit" href="#menu_unit_3" class="listtitle">ケミカルシーズ・リード 探索ユニット(ライブラリー・スクリーニング領域) </a> </h4> </div> <div id="menu_unit_3" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_unit_3_1"> <ul> <li><a href="/supports/view/37" target="_blank">化合物ライブラリー</a></li> <li><a href="/supports/view/38" target="_blank">ハイスループットスクリーニングとヒット化合物の周辺探索</a></li> <li><a href="/supports/view/39" target="_blank">大規模な東大化合物ライブラリーからのサンプル提供</a></li> <li><a href="/supports/view/40" target="_blank">創薬機構の化合物スクリーニング支援</a></li> <li><a href="/supports/view/41" target="_blank">感染症創薬スクリーニング支援</a></li> <li><a href="/supports/view/42" target="_blank">海洋微生物抽出物ライブラリーを用いた創薬スクリーニング支援</a></li> <li><a href="/supports/view/43" target="_blank">非RI細胞障害性アッセイシステム</a></li> <li><a href="/supports/view/44" target="_blank"> 特殊ペプチド探索技術が加速する生命科学と創薬の支援</a></li> <li><a href="/supports/view/45" target="_blank">スクリーニング支援(HTS機器の技術支援およびアッセイ系構築を支援)</a></li> <li><a href="/supports/view/46" target="_blank">ヒット化合物の最適化と合成技術の高度化</a></li> <li><a href="/supports/view/47" target="_blank">疾患モデルでの解析(慢性疼痛・掻痒モデルでの解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/48" target="_blank">疾患モデルでの解析(循環器疾患モデルでの解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/49" target="_blank">疾患モデルでの解析(がんモデルでの解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/50" target="_blank">動物モデルでの薬物動態解析</a></li> <li><a href="/supports/view/51" target="_blank">Structure-aided drug discovery</a></li> <li><a href="/supports/view/52" target="_blank">化合物スクリーニングと創薬研究機器・受託解析活用支援</a></li> <li><a href="/supports/view/53" target="_blank">創薬シーズ発掘から前臨床研究支援まで北のアカデミア創薬研究支援</a></li> <li><a href="/supports/view/54" target="_blank">物理化学測定によるヒット・リード化合物結合の“質”評価</a></li> <li><a href="/supports/view/55" target="_blank">東北大学化合物ライブラリー</a></li> <li><a href="/supports/view/56" target="_blank">天然化合物に由来するケミカルスペースの開拓</a></li> <li><a href="/supports/view/57" target="_blank">需要に応じたスクリーニングシステム</a></li> <li><a href="/supports/view/58" target="_blank">簡便で安価なGPCR活性化測定法 -TGFα切断アッセイ-</a></li> <li><a href="/supports/view/59" target="_blank">ホルモン核内受容体を基盤とした内分泌代謝疾患の新規創薬</a></li> <li><a href="/supports/view/60" target="_blank">モデル動物及びイメージング質量分析を用いた創薬研究を加速する高度化技術</a></li> <li><a href="/supports/view/61" target="_blank">低酸素細胞培養解析系による薬剤評価とタンパク質機能解析</a></li> <li><a href="/supports/view/106" target="_blank">細胞外タンパク質を標的とした創薬研究の高度化技術</a></li> <li><a href="/supports/view/110" target="_blank">300kVハイエンド透過型電子顕微鏡を用いたクライオ電子顕微鏡構造解析支援</a></li> <li><a href="/supports/view/62" target="_blank">大村天然化合物ライブラリー</a></li> <li><a href="/supports/view/63" target="_blank">抗体様分子標的HLHペプチドの開発</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading sub_4"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist_unit" href="#menu_unit_4" class="listtitle">ケミカルシーズ・リード 探索ユニット(構造展開領域) </a> </h4> </div> <div id="menu_unit_4" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_unit_4_1"> <ul> <li><a href="/supports/view/64" target="_blank">創薬研究の推進に向けた創薬コンサルティングと構造展開</a></li> <li><a href="/supports/view/65" target="_blank">低分子化合物の物性と<i>in vitro</i> ADMET評価</a></li> <li><a href="/supports/view/66" target="_blank">アカデミア創薬の想いをカタチに(ワンストップ・リード創製)</a></li> <li><a href="/supports/view/67" target="_blank">アカデミア創薬の想いをカタチに(ワンストップ・ADME/物性評価)</a></li> <li><a href="/supports/view/68" target="_blank">高機能ADMET評価を基盤とした成功確率の高いリード創出・最適化支援</a></li> <li><a href="/supports/view/69" target="_blank">ヒット化合物の迅速プローブ化支援</a></li> <li><a href="/supports/view/70" target="_blank">天然物をはじめとする生物活性化合物の構造展開及び分子プローブ化</a></li> <li><a href="/supports/view/71" target="_blank">分子触媒を用いた物質変換法</a></li> <li><a href="/supports/view/72" target="_blank">有機分子へのハロゲン官能基の導入</a></li> <li><a href="/supports/view/104" target="_blank">遺伝学的アプローチによる薬剤標的分子の同定</a></li> <li><a href="/supports/view/73" target="_blank">高化学選択的有機合成手法による迅速な分子構造展開</a></li> <li><a href="/supports/view/74" target="_blank">アルカロイド様化合物を中心とした含窒素化合物の自在な構造展開</a></li> <li><a href="/supports/view/75" target="_blank">天然化合物を活用した構造展開とライブラリー構築・提供</a></li> <li><a href="/supports/view/76" target="_blank">ペプチドライブラリー合成・提供</a></li> <li><a href="/supports/view/77" target="_blank">遷移金属触媒を用いる多様な複素環化合物の合成</a></li> <li><a href="/supports/view/78" target="_blank">系内発生アミド塩基が触媒する複素芳香族炭素-水素結合の分子変換</a></li> <li><a href="/supports/view/79" target="_blank">効率的で汎用性の高い合成法によるマクロライド及び多環性炭素骨格の合成・提供</a></li> <li><a href="/supports/view/80" target="_blank">グリコペプチド抗生物質誘導体及びグアニン誘導体の合成</a></li> <li><a href="/supports/view/81" target="_blank">塩基配列認識を基盤とするライブラリー提供支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading sub_5"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist_unit" href="#menu_unit_5" class="listtitle">バイオロジカルシーズ探索ユニット </a> </h4> </div> <div id="menu_unit_5" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_unit_5_1"> <ul> <li><a href="/supports/view/82" target="_blank">機能ゲノミクス解析による創薬等支援</a></li> <li><a href="/supports/view/83" target="_blank">微量検体からの高精度1塩基解像度メチローム解析</a></li> <li><a href="/supports/view/84" target="_blank">1細胞・微小組織サンプルからのトランスクリプトーム及び微生物1細胞ゲノム解析</a></li> <li><a href="/supports/view/85" target="_blank">ゲノム高次構造と転写ネットワークの統合的理解に向けた技術基盤提供支援</a></li> <li><a href="/supports/view/86" target="_blank">ゲノム編集等の技術を用いた疾患モデルマウスの作製</a></li> <li><a href="/supports/view/87" target="_blank">次世代型疾患モデル動物作出</a></li> <li><a href="/supports/view/107" target="_blank">エピゲノム疾患モデルマウス(シルバーラッセル症候群モデルマウス)</a></li> <li><a href="/supports/view/88" target="_blank">ヒト化マウスを基盤とした創薬支援プラットフォーム</a></li> <li><a href="/supports/view/89" target="_blank">心血管安全性評価を通じた創薬支援</a></li> <li><a href="/supports/view/90" target="_blank"><i>In vivo</i>薬物動態試験</a></li> <li><a href="/supports/view/91" target="_blank"><i>In vivo</i>安全性試験</a></li> <li><a href="/supports/view/108" target="_blank">薬物動態イメージング解析</a></li> <li><a href="/supports/view/92" target="_blank">人工染色体技術を用いたヒト化マウス/ラットおよび多機能細胞による創薬支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading sub_6"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist_unit" href="#menu_unit_6" class="listtitle">インシリコユニット </a> </h4> </div> <div id="menu_unit_6" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_unit_6_1"> <ul> <li><a href="/supports/view/93" target="_blank">天然変性領域の構造アンサンブル解析とアミノ酸変異等の影響解析</a></li> <li><a href="/supports/view/94" target="_blank">低分解能実験データを用いた超分子の立体構造モデリング</a></li> <li><a href="/supports/view/95" target="_blank">分子シミュレーションによるタンパク質の機能解析</a></li> <li><a href="/supports/view/96" target="_blank">タンパク質の相互作用予測、相互作用部位予測</a></li> <li><a href="/supports/view/97" target="_blank">バイオマーカーおよび治療法開発を加速するデータ駆動型モデリング</a></li> <li><a href="/supports/view/98" target="_blank">X線小角散乱などの実験データと分子動力学シミュレーションの連携研究</a></li> <li><a href="/supports/view/99" target="_blank">タンパク質の高次構造情報を利用した創薬等研究加速に向けたバイオインフォマティクス研究</a></li> <li><a href="/supports/view/100" target="_blank">ナチュラルドラッグ(薬草由来)のネットワーク構造創薬(NSBDD)</a></li> <li><a href="/supports/view/101" target="_blank">スーパーコンピュータTSUBAME3の計算機利用とインシリコスクリーニング支援</a></li> <li><a href="/supports/view/102" target="_blank">インシリコスクリーニング及びFMO法による相互作用解析</a></li> <li><a href="/supports/view/103" target="_blank">分子モデリング及びシミュレーションを活用したインシリコ創薬支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading sub_8"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist_unit" href="#menu_unit_8" class="listtitle">中分子創薬ライブラリーユニット </a> </h4> </div> <div id="menu_unit_8" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_unit_8_1"> <ul> <li><a href="/supports/view/109" target="_blank">タンパク質間相互作用阻害にフォーカスした中分子化合物ライブラリーの提供</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </li> </ul> </li> <li class="dropdown yamm-fw"> <a href="#" class="dropdown-toggle btn btn-lg btn-primary" data-toggle="dropdown">支援メニュー目次から</a> <ul class="dropdown-menu"> <li> <div class="yamm-content"> <div class="row"> <div class="col-xs-12"> <div class="panel-group" id="menulist"> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist" href="#menu_1" class="listtitle">タンパク質の試料調製で困っている方へ </a> </h4> </div> <div id="menu_1" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_1_1"> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_1_1" href="#col_1_1_1" class="accordion-toggle collapsed">組換えタンパク質の発現生産、精製を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_1_1_1" class="panel-collapse collapse _in"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/27">高難度創薬ターゲット蛋白質の構造解析品質での迅速生産</a></li> <li><a href="/supports/view/35">単粒子解析に向けたタンパク質複合体の生産</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_1_1" href="#col_1_1_2" class="accordion-toggle collapsed">無細胞系でのタンパク質の発現生産を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_1_1_2" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/30">コムギ無細胞系を用いた複合体タンパク質の生産及び低分子抗体作製</a></li> <li><a href="/supports/view/34">無細胞系・生細胞系による高難度タンパク質生産支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_1_1" href="#col_1_1_3" class="accordion-toggle collapsed">核内タンパク質の発現生産を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_1_1_3" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/29">エピジェネティクス研究と創薬のための再構成クロマチンの提供</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_1_1" href="#col_1_1_4" class="accordion-toggle collapsed">膜タンパク質の発現生産、精製を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_1_1_4" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/26">クライオ電子顕微鏡法のための膜タンパク質複合体の生産と試料調製技術</a></li> <li><a href="/supports/view/32">次世代構造創薬研究を先導するヒト膜タンパク質・抗体の生産技術支援</a></li> <li><a href="/supports/view/33">創薬関連ヒト膜タンパク質の生産から結晶化/ワンストップ支援とその高度化</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_1_1" href="#col_1_1_5" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質と相互作用する(特殊)ペプチドを提供支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_1_1_5" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/44">特殊ペプチド探索技術が加速する生命科学と創薬の支援</a></li> <li><a href="/supports/view/63">抗体様分子標的HLHペプチドの開発</a></li> <li><a href="/supports/view/76">ペプチドライブラリー合成・提供</a></li> </ul> </div> </div> </div> <!-- <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_1_1" href="#col_1_1_6" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の標識や修飾を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_1_1_6" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/34">無細胞系・生細胞系による高難度タンパク質生産支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> --> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_1_1" href="#col_1_1_7" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の機能解析を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_1_1_7" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/61">低酸素細胞培養解析系による薬剤評価とタンパク質機能解析</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_1_1" href="#col_1_1_8" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の相互作用解析を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_1_1_8" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/59">ホルモン核内受容体を基盤とした内分泌代謝疾患の新規創薬</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist" href="#menu_2" class="listtitle">有用な低分子や中分子化合物を探したい方へ </a> </h4> </div> <div id="menu_2" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_2_1"> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_2_1" href="#col_2_1_1" class="accordion-toggle collapsed">化合物のスクリーニングのために各種測定装置の利用を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_2_1_1" class="panel-collapse collapse _in"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/37">化合物ライブラリー</a></li> <li><a href="/supports/view/38">ハイスループットスクリーニングとヒット化合物の周辺探索</a></li> <li><a href="/supports/view/39">大規模な東大化合物ライブラリーからのサンプル提供</a></li> <li><a href="/supports/view/40">創薬機構の化合物スクリーニング支援</a></li> <li><a href="/supports/view/41">感染症創薬スクリーニング支援</a></li> <li><a href="/supports/view/45">スクリーニング支援(HTS機器の技術支援およびアッセイ系構築を支援)</a></li> <li><a href="/supports/view/52">化合物スクリーニングと創薬研究機器・受託解析活用支援</a></li> <li><a href="/supports/view/53">創薬シーズ発掘から前臨床研究支援まで北のアカデミア創薬研究支援</a></li> <li><a href="/supports/view/57">需要に応じたスクリーニングシステム</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_2_1" href="#col_2_1_2" class="accordion-toggle collapsed">化合物のスクリーニングを支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_2_1_2" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/37">化合物ライブラリー</a></li> <li><a href="/supports/view/38">ハイスループットスクリーニングとヒット化合物の周辺探索</a></li> <li><a href="/supports/view/39">大規模な東大化合物ライブラリーからのサンプル提供</a></li> <li><a href="/supports/view/40">創薬機構の化合物スクリーニング支援</a></li> <li><a href="/supports/view/41">感染症創薬スクリーニング支援</a></li> <li><a href="/supports/view/42">海洋微生物抽出物ライブラリーを用いた創薬スクリーニング支援</a></li> <li><a href="/supports/view/45">スクリーニング支援(HTS機器の技術支援およびアッセイ系構築を支援)</a></li> <li><a href="/supports/view/52">化合物スクリーニングと創薬研究機器・受託解析活用支援</a></li> <li><a href="/supports/view/53">創薬シーズ発掘から前臨床研究支援まで北のアカデミア創薬研究支援</a></li> <li><a href="/supports/view/54">物理化学測定によるヒット・リード化合物結合の“質”評価</a></li> <li><a href="/supports/view/55">東北大学化合物ライブラリー</a></li> <li><a href="/supports/view/58">簡便で安価なGPCR活性化測定法 -TGFα切断アッセイ-</a></li> <li><a href="/supports/view/59">ホルモン核内受容体を基盤とした内分泌代謝疾患の新規創薬</a></li> <li><a href="/supports/view/62">大村天然化合物ライブラリー</a></li> <li><a href="/supports/view/81">塩基配列認識を基盤とするライブラリー提供支援</a></li> <li><a href="/supports/view/109">タンパク質間相互作用阻害にフォーカスした中分子化合物ライブラリーの提供</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_2_1" href="#col_2_1_22" class="accordion-toggle collapsed">化合物の標的分子探索を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_2_1_22" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/104">遺伝学的アプローチによる薬剤標的分子の同定</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_2_1" href="#col_2_1_3" class="accordion-toggle collapsed">細胞の状態を制御する化合物のスクリーニングシステムを支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_2_1_3" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/43">非RI細胞障害性アッセイシステム</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_2_1" href="#col_2_1_4" class="accordion-toggle collapsed">発見した有用化合物の構造最適化のための化学合成を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_2_1_4" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/46">ヒット化合物の最適化と合成技術の高度化</a></li> <li><a href="/supports/view/62">大村天然化合物ライブラリー</a></li> <li><a href="/supports/view/64">ヒット化合物の最適化と合成技術の高度化</a></li> <li><a href="/supports/view/66">アカデミア創薬の想いをカタチに(ワンストップ・リード創製)</a></li> <li><a href="/supports/view/68">高機能ADMET評価を基盤とした成功確率の高いリード創出・最適化支援</a></li> <li><a href="/supports/view/69">ヒット化合物の迅速プローブ化支援</a></li> <li><a href="/supports/view/70">天然物をはじめとする生物活性化合物の構造展開及び分子プローブ化</a></li> <li><a href="/supports/view/71">分子触媒を用いた物質変換法</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_2_1" href="#col_2_1_5" class="accordion-toggle collapsed">各種化合物の合成を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_2_1_5" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/44">特殊ペプチド探索技術が加速する生命科学と創薬の支援</a></li> <li><a href="/supports/view/56">天然化合物に由来するケミカルスペースの開拓</a></li> <li><a href="/supports/view/63">抗体様分子標的HLHペプチドの開発</a></li> <li><a href="/supports/view/71">分子触媒を用いた物質変換法</a></li> <li><a href="/supports/view/72">有機分子へのハロゲン官能基の導入</a></li> <li><a href="/supports/view/73">高化学選択的有機合成手法による迅速な分子構造展開</a></li> <li><a href="/supports/view/74">アルカロイド様化合物を中心とした含窒素化合物の自在な構造展開</a></li> <li><a href="/supports/view/75">天然化合物を活用した構造展開とライブラリー構築・提供</a></li> <li><a href="/supports/view/76">ペプチドライブラリー合成・提供</a></li> <li><a href="/supports/view/77">遷移金属触媒を用いる多様な複素環化合物の合成</a></li> <li><a href="/supports/view/78">系内発生アミド塩基が触媒する複素芳香族炭素-水素結合の分子変換</a></li> <li><a href="/supports/view/79">効率的で汎用性の高い合成法によるマクロライド及び多環性炭素骨格の合成・提供</a></li> <li><a href="/supports/view/80">グリコペプチド抗生物質誘導体及びグアニン誘導体の合成</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_2_1" href="#col_2_1_6" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質に結合するリガンドのインシリコスクリーニングと構造最適化を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_2_1_6" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/51">Structure-aided drug discovery</a></li> <li><a href="/supports/view/97">バイオマーカーおよび治療法開発を加速するデータ駆動型モデリング</a></li> <li><a href="/supports/view/99">タンパク質の高次構造情報を利用した創薬等研究加速に向けたバイオインフォマティクス研究</a></li> <li><a href="/supports/view/100">ナチュラルドラッグ(薬草由来)のネットワーク構造創薬(NSBDD)</a></li> <li><a href="/supports/view/101">スーパーコンピュータTSUBAME3の計算機利用とインシリコスクリーニング支援</a></li> <li><a href="/supports/view/102">インシリコスクリーニング及びFMO法による相互作用解析</a></li> <li><a href="/supports/view/103">分子モデリング及びシミュレーションを活用したインシリコ創薬支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_2_1" href="#col_2_1_7" class="accordion-toggle collapsed">疾患モデルマウスを用いた化合物の薬効評価を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_2_1_7" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/47">疾患モデルでの解析(慢性疼痛・掻痒モデルでの解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/48">疾患モデルでの解析(循環器疾患モデルでの解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/49">疾患モデルでの解析(がんモデルでの解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/50">動物モデルでの薬物動態解析</a></li> <li><a href="/supports/view/60">モデル動物及びイメージング質量分析を用いた創薬研究を加速する高度化技術</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_2_1" href="#col_2_1_8" class="accordion-toggle collapsed">薬物動態や毒性評価を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_2_1_8" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/50">動物モデルでの薬物動態解析</a></li> <li><a href="/supports/view/60">モデル動物及びイメージング質量分析を用いた創薬研究を加速する高度化技術</a></li> <li><a href="/supports/view/61">低酸素細胞培養解析系による薬剤評価とタンパク質機能解析</a></li> <li><a href="/supports/view/64">構造展開とADMET評価に基づく低分子創薬研究の推進</a></li> <li><a href="/supports/view/65">低分子化合物の物性と<i>in vitro</i> ADMET評価</a></li> <li><a href="/supports/view/67">アカデミア創薬の想いをカタチに(ワンストップ・ADME/物性評価)</a></li> <li><a href="/supports/view/68">高機能ADMET評価を基盤とした成功確率の高いリード創出・最適化支援</a></li> <li><a href="/supports/view/81">塩基配列認識を基盤とするライブラリー提供支援</a></li> <li><a href="/supports/view/89">心血管安全性評価を通じた創薬支援</a></li> <li><a href="/supports/view/90"><i>In vivo</i>薬物動態試験</a></li> <li><a href="/supports/view/91"><i>In vivo</i>安全性試験</a></li> <li><a href="/supports/view/92">人工染色体技術を用いたヒト化マウス/ラットおよび多機能細胞による創薬支援</a></li> <li><a href="/supports/view/105">Patient-derived cells (PDC)を用いた創薬評価支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist" href="#menu_7" class="listtitle">動物を用いた実験を実施したい方へ</a> </h4> </div> <div id="menu_7" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_7_1"> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_7_1" href="#col_7_1_1" class="accordion-toggle collapsed">薬物動態解析を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_7_1_1" class="panel-collapse collapse _in"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/47">疾患モデルでの解析(慢性疼痛・掻痒モデルでの解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/50">動物モデルでの薬物動態解析</a></li> <li><a href="/supports/view/60">モデル動物及びイメージング質量分析を用いた創薬研究を加速する高度化技術</a></li> <li><a href="/supports/view/88">ヒト化マウスを基盤とした創薬支援プラットフォーム</a></li> <li><a href="/supports/view/90"><i>In vivo</i>薬物動態試験</a></li> <li><a href="/supports/view/108">薬物動態イメージング解析</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_7_1" href="#col_7_1_2" class="accordion-toggle collapsed">モデル動物の提供/作成を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_7_1_2" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/47">疾患モデルでの解析(慢性疼痛・掻痒モデルでの解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/48">疾患モデルでの解析(循環器疾患モデルでの解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/49">疾患モデルでの解析(がんモデルでの解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/60">モデル動物及びイメージング質量分析を用いた創薬研究を加速する高度化技術</a></li> <li><a href="/supports/view/86">ゲノム編集等の技術を用いた疾患モデルマウスの作製</a></li> <li><a href="/supports/view/87">次世代型疾患モデル動物作出</a></li> <li><a href="/supports/view/92">人工染色体技術を用いたヒト化マウス/ラットおよび多機能細胞による創薬支援</a></li> <li><a href="/supports/view/107">エピゲノム疾患モデルマウス(シルバーラッセル症候群モデルマウス)</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_7_1" href="#col_7_1_3" class="accordion-toggle collapsed">毒性/安全性評価を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_7_1_3" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/60">モデル動物及びイメージング質量分析を用いた創薬研究を加速する高度化技術</a></li> <li><a href="/supports/view/88">ヒト化マウスを基盤とした創薬支援プラットフォーム</a></li> <li><a href="/supports/view/89">心血管安全性評価を通じた創薬支援</a></li> <li><a href="/supports/view/91"><i>In vivo</i>安全性試験</a></li> <li><a href="/supports/view/106">細胞外タンパク質を標的とした創薬研究の高度化技術</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist" href="#menu_3" class="listtitle">タンパク質の構造解析を目指す方へ </a> </h4> </div> <div id="menu_3" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_3_1"> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_1" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の結晶化を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_3_1_1" class="panel-collapse collapse _in"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/27">高難度創薬ターゲット蛋白質の構造解析品質での迅速生産</a></li> <li><a href="/supports/view/30">コムギ無細胞系を用いた複合体タンパク質の生産及び低分子抗体作製</a></li> <li><a href="/supports/view/33">創薬関連ヒト膜タンパク質の生産から結晶化/ワンストップ支援とその高度化</a></li> <li><a href="/supports/view/36">X線結晶構造解析のための全自動大規模結晶化スクリーニング</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_2" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の結晶化を促進する抗体などの相互作用分子の設計、調製を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_2" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/28">創薬ターゲットに対する構造認識抗体/バインダーの生産支援</a></li> <li><a href="/supports/view/30">コムギ無細胞系を用いた複合体タンパク質の生産及び低分子抗体作製</a></li> <li><a href="/supports/view/31">高難度モノクローナル抗体開発とその包括的エンジニアリング</a></li> <li><a href="/supports/view/32">次世代構造創薬研究を先導するヒト膜タンパク質・抗体の生産技術支援</a></li> <li><a href="/supports/view/106">細胞外タンパク質を標的とした創薬研究の高度化技術</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_3" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の結晶構造解析のためのビームタイムを供給します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_3" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/7">SPring-8高難度タンパク質結晶構造解析</a></li> <li><a href="/supports/view/10">SPring-8:温湿度制御(HAG法)による生理活性状態での構造変化の解析</a></li> <li><a href="/supports/view/13">KEK-PFタンパク質結晶構造解析プラットフォーム</a></li> <li><a href="/supports/view/18">生体超分子複合体を中心としたタンパク質結晶構造解析(BL44XU)</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_4" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質のX線回折データの収集を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_4" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/7">SPring-8高難度タンパク質結晶構造解析</a></li> <li><a href="/supports/view/8">SPring-8遠隔実験支援システム</a></li> <li><a href="/supports/view/9">高エネルギーX線を利用した結晶構造解析</a></li> <li><a href="/supports/view/13">KEK-PFタンパク質結晶構造解析プラットフォーム</a></li> <li><a href="/supports/view/15">KEK-PF生体高分子X線溶液散乱</a></li> <li><a href="/supports/view/17">創薬等ライフサイエンス研究のための多階層構造生命科学解析支援</a></li> <li><a href="/supports/view/18">生体超分子複合体を中心としたタンパク質結晶構造解析(BL44XU)</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_5" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質のX線回折データの位相決定及び構造解析を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_5" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/14">KEK-PF天然タンパク質に含まれる硫黄原子を利用したタンパク質の構造解析</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_6" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質のX線自由電子レーザによる構造解析を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_6" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/11">X線自由電子レーザーを用いたシリアルフェムト秒結晶構造解析法</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_7" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質のX線溶液散乱データの収集、解析を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_7" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/12">Pring-8タンパク質溶液散乱測定</a></li> <li><a href="/supports/view/15">KEK-PF生体高分子X線溶液散乱</a></li> <li><a href="/supports/view/98">X線小角散乱などの実験データと分子動力学シミュレーションの連携研究</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_8" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質のNMRによる相互作用解析を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_8" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/17">創薬等ライフサイエンス研究のための多階層構造生命科学解析支援</a></li> <li><a href="/supports/view/20">NMR生体分子構造相互作用解析</a></li> <li><a href="/supports/view/21">NMRによるタンパク質の相互作用解析</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_9" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の電子顕微鏡による構造解析を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_9" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/16">KEKクライオ電子顕微鏡による単粒子解析に向けたデータ測定</a></li> <li><a href="/supports/view/17">創薬等ライフサイエンス研究のための多階層構造生命科学解析支援</a></li> <li><a href="/supports/view/19">高分解能クライオ電子顕微鏡解析</a></li> <li><a href="/supports/view/22">クライオ電顕ネイティブ複合体解析</a></li> <li><a href="/supports/view/23">クライオ電子顕微鏡による構造解析(トモグラフィー・単粒子解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/24">クライオ電子顕微鏡法による生体分子構造解析の高分解能化と効率化</a></li> <li><a href="/supports/view/25">クライオ電子顕微鏡による膜タンパク質の単粒子解析</a></li> <li><a href="/supports/view/26">クライオ電子顕微鏡法のための膜タンパク質複合体の生産と試料調製技術</a></li> <li><a href="/supports/view/35">単粒子解析に向けたタンパク質複合体の生産</a></li> <li><a href="/supports/view/110">300kVハイエンド透過型電子顕微鏡を用いたクライオ電子顕微鏡構造解析支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> <!-- <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist" href="#menu_3" class="listtitle">タンパク質の構造解析を目指す方へ </a> </h4> </div> <div id="menu_3" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_3_1"> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_1" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の結晶化を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_3_1_1" class="panel-collapse collapse _in"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/27">高難度創薬ターゲット蛋白質の構造解析品質での迅速生産</a></li> <li><a href="/supports/view/30">コムギ無細胞系を用いた複合体タンパク質の生産及び低分子抗体作製</a></li> <li><a href="/supports/view/33">創薬関連ヒト膜タンパク質の生産から結晶化/ワンストップ支援とその高度化</a></li> <li><a href="/supports/view/36">X線結晶構造解析のための全自動大規模結晶化スクリーニング</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_2" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の結晶化を促進する抗体などの相互作用分子の設計、調製を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_2" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/28">創薬ターゲットに対する構造認識抗体/バインダーの生産支援</a></li> <li><a href="/supports/view/30">コムギ無細胞系を用いた複合体タンパク質の生産及び低分子抗体作製</a></li> <li><a href="/supports/view/31">高難度モノクローナル抗体開発とその包括的エンジニアリング</a></li> <li><a href="/supports/view/32">次世代構造創薬研究を先導するヒト膜タンパク質・抗体の生産技術支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_3" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の結晶構造解析のためのビームタイムを供給します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_3" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/7">SPring-8高難度タンパク質結晶構造解析</a></li> <li><a href="/supports/view/10">SPring-8:温湿度制御(HAG法)による生理活性状態での構造変化の解析</a></li> <li><a href="/supports/view/13">Photon Factoryタンパク質結晶構造解析プラットフォーム</a></li> <li><a href="/supports/view/18">生体超分子複合体を中心としたタンパク質結晶構造解析(BL44XU)</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_4" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質のX線回折データの収集を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_4" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/7">SPring-8高難度タンパク質結晶構造解析</a></li> <li><a href="/supports/view/8">SPring-8遠隔実験支援システム</a></li> <li><a href="/supports/view/9">高エネルギーX線を利用した結晶構造解析</a></li> <li><a href="/supports/view/13">Photon Factoryタンパク質結晶構造解析プラットフォーム</a></li> <li><a href="/supports/view/15">Photon Factory生体高分子X線溶液散乱</a></li> <li><a href="/supports/view/17">創薬等ライフサイエンス研究のための多階層構造生命科学解析支援</a></li> <li><a href="/supports/view/18">生体超分子複合体を中心としたタンパク質結晶構造解析(BL44XU)</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_5" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質のX線回折データの位相決定及び構造解析を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_5" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/14">天然タンパク質に含まれる硫黄原子を利用したタンパク質の構造解析</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_6" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質のX線自由電子レーザによる構造解析を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_6" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/11">X線自由電子レーザーを用いたシリアルフェムト秒結晶構造解析法</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_7" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質のX線溶液散乱データの収集、解析を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_7" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/12">Pring-8タンパク質溶液散乱測定</a></li> <li><a href="/supports/view/15">Photon Factory生体高分子X線溶液散乱</a></li> <li><a href="/supports/view/98">X線小角散乱などの実験データと分子動力学シミュレーションの連携研究</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_8" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質のNMRによる相互作用解析を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_8" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/17">創薬等ライフサイエンス研究のための多階層構造生命科学解析支援</a></li> <li><a href="/supports/view/20">NMR生体分子構造相互作用解析</a></li> <li><a href="/supports/view/21">NMRによるタンパク質の相互作用解析</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_3_1" href="#col_3_1_9" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の電子顕微鏡による構造解析を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_3_1_9" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/16"> クライオ電子顕微鏡による単粒子解析に向けたデータ測定</a></li> <li><a href="/supports/view/17">創薬等ライフサイエンス研究のための多階層構造生命科学解析支援</a></li> <li><a href="/supports/view/19">高分解能クライオ電子顕微鏡解析</a></li> <li><a href="/supports/view/22">クライオ電顕ネイティブ複合体解析</a></li> <li><a href="/supports/view/23">クライオ電子顕微鏡による構造解析(トモグラフィー・単粒子解析)</a></li> <li><a href="/supports/view/24">クライオ電子顕微鏡法による生体分子構造解析の高分解能化と効率化</a></li> <li><a href="/supports/view/25">クライオ電子顕微鏡による膜タンパク質の単粒子解析</a></li> <li><a href="/supports/view/26">クライオ電子顕微鏡法のための膜タンパク質複合体の生産と試料調製技術</a></li> <li><a href="/supports/view/35">単粒子解析に向けたタンパク質複合体の生産</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> --> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist" href="#menu_4" class="listtitle">構造バイオインフォマティクスの力を借りたい方へ </a> </h4> </div> <div id="menu_4" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_4_1"> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_4_1" href="#col_4_1_1" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の立体構造のモデリングを支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_4_1_1" class="panel-collapse collapse _in"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/1">データベースの構築とホモロジーモデリングによる機能推定の支援</a></li> <li><a href="/supports/view/2">電子顕微鏡画像・計算結果のアーカイブ及び構造関連データベースの運用</a></li> <li><a href="/supports/view/3">ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定</a></li> <li><a href="/supports/view/6">知識ベース超分子モデリングによる疾患メカニズム解析</a></li> <li><a href="/supports/view/94">低分解能実験データを用いた超分子の立体構造モデリング</a></li> <li><a href="/supports/view/99">タンパク質の高次構造情報を利用した創薬等研究加速に向けたバイオインフォマティクス研究</a></li> <li><a href="/supports/view/101"> スーパーコンピュータTSUBAME3の計算機利用とインシリコスクリーニング支援</a></li> <li><a href="/supports/view/103">分子モデリング及びシミュレーションを活用したインシリコ創薬支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_4_1" href="#col_4_1_2" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質と他の分子との相互作用部位及び複合体構造の予測を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_4_1_2" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/2">電子顕微鏡画像・計算結果のアーカイブ及び構造関連データベースの運用</a></li> <li><a href="/supports/view/3">ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定</a></li> <li><a href="/supports/view/95">分子シミュレーションによるタンパク質の機能解析</a></li> <li><a href="/supports/view/96">タンパク質の相互作用予測、相互作用部位予測</a></li> <li><a href="/supports/view/97">バイオマーカーおよび治療法開発を加速するデータ駆動型モデリング</a></li> <li><a href="/supports/view/98">X線小角散乱などの実験データと分子動力学シミュレーションの連携研究</a></li> <li><a href="/supports/view/99">タンパク質の高次構造情報を利用した創薬等研究加速に向けたバイオインフォマティクス研究</a></li> <li><a href="/supports/view/100">ナチュラルドラッグ(薬草由来)のネットワーク構造創薬(NSBDD)</a></li> <!-- <li><a href="/supports/view/101">---</a></li> --> <li><a href="/supports/view/102">インシリコスクリーニング及びFMO法による相互作用解析</a></li> <li><a href="/supports/view/103">分子モデリング及びシミュレーションを活用したインシリコ創薬支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_4_1" href="#col_4_1_3" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質の動的構造解析を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_4_1_3" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/3">ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定</a></li> <li><a href="/supports/view/93">天然変性領域の構造アンサンブル解析とアミノ酸変異等の影響解析</a></li> <li><a href="/supports/view/95">分子シミュレーションによるタンパク質の機能解析</a></li> <li><a href="/supports/view/98">X線小角散乱などの実験データと分子動力学シミュレーションの連携研究</a></li> <li><a href="/supports/view/101">スーパーコンピュータTSUBAME3の計算機利用とインシリコスクリーニング支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_4_1" href="#col_4_1_4" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質のアミノ酸配列に基づく各種解析を支援します。</a> </h4> </div> <div id="col_4_1_4" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/2">電子顕微鏡画像・計算結果のアーカイブ及び構造関連データベースの運用</a></li> <li><a href="/supports/view/3">ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定</a></li> <li><a href="/supports/view/6">知識ベース超分子モデリングによる疾患メカニズム解析</a></li> <li><a href="/supports/view/99">タンパク質の高次構造情報を利用した創薬等研究加速に向けたバイオインフォマティクス研究</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist" href="#menu_5" class="listtitle">ゲノムから始めたい方へ </a> </h4> </div> <div id="menu_5" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_5_1"> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_5_1" href="#col_5_1_1" class="accordion-toggle collapsed">エクソーム、トランスクリプトーム、メチローム解析を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_5_1_1" class="panel-collapse collapse _in"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/3">ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定</a></li> <li><a href="/supports/view/82">機能ゲノミクス解析による創薬等支援</a></li> <li><a href="/supports/view/83">微量検体からの高精度1塩基解像度メチローム解析</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_5_1" href="#col_5_1_2" class="accordion-toggle collapsed">ChIp-seq解析を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_5_1_2" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/82">機能ゲノミクス解析による創薬等支援</a></li> <li><a href="/supports/view/85">ゲノム高次構造と転写ネットワークの統合的理解に向けた技術基盤提供支援</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_5_1" href="#col_5_1_3" class="accordion-toggle collapsed">1細胞遺伝子発現解析を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_5_1_3" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/84">1細胞・微小組織サンプルからのトランスクリプトーム及び微生物1細胞ゲノム解析</a></li> </ul> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_5_1" href="#col_5_1_4" class="accordion-toggle collapsed">ゲノム編集を用いた疾患モデルマウス作成の支援をします。 </a> </h4> </div> <div id="col_5_1_4" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/86">ゲノム編集等の技術を用いた疾患モデルマウスの作製</a></li> <li><a href="/supports/view/87">次世代型疾患モデル動物作出</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist" href="#menu_6" class="listtitle">データを活用したい方へ </a> </h4> </div> <div id="menu_6" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_6_1"> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_6_1" href="#col_6_1_1" class="accordion-toggle collapsed">タンパク質および遺伝子のデータベースや解析ツールの利用を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_6_1_1" class="panel-collapse collapse _in"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/1">データベースの構築とホモロジーモデリングによる機能推定の支援</a></li> <li><a href="/supports/view/2">電子顕微鏡画像・計算結果のアーカイブ及び構造関連データベースの運用</a></li> <li><a href="/supports/view/3">ゲノム・発現量・タンパク質情報をつなぐ変異の遺伝子機能変化への影響推定</a></li> <li><a href="/supports/view/5">医薬関連情報データベースの構築・公開とVaProSの高度化</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menulist" href="#menu_8" class="listtitle">広報活動やセミナーを利用したい方へ </a> </h4> </div> <div id="menu_8" class="panel-collapse collapse"> <div class="panel-body"> <div class="panel-group" id="menu_8_1"> <div class="panel panel-default"> <div class="panel-heading"> <h4 class="panel-title"> <a data-toggle="collapse" data-parent="#menu_8_1" href="#col_8_1_1" class="accordion-toggle collapsed">講習会、セミナーの開催と企画を支援します。 </a> </h4> </div> <div id="col_8_1_1" class="panel-collapse collapse _in"> <div class="panel-body"> <ul> <li><a href="/supports/view/4">講習会・セミナーの実施、広報活動</a></li> </ul> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </div> </li> </ul> </li> </ul> <ul class="nav pull-right"> <li class=""><a href="https://www.supportbinds.jp/?g=200&m=7" target="_blank" class="btn btn-lg btn-danger">支援申請する</a></li> </ul> </nav> <!-- <a href="/supports/keyword" class="btn btn-lg btn-primary">キーワード検索から</a> <a href="/supports/" class="btn btn-lg btn-primary">ユニット/領域名から</a> <a href="/supports/" class="btn btn-lg btn-primary">支援メニュー目次から</a> <a href="https://www.supportbinds.jp" class="btn btn-lg btn-danger pull-right">支援申請する</a> --> </div> </div> <div class="row mt40"> <div class="col-xs-12"> <div class="menuplus menu_bg_7"> <h1>A5-1 知識ベース超分子モデリングによる疾患メカニズム解析</h1> <p> 超分子モデリングパイプラインで立体構造モデルを構築し、疾患変異マッピングで疾患メカニズムの解析・ドラッグデザインを支援 </p> <h2>[1] 支援担当者</h2> <table class="table table-bordered"> <tr> <th colspan="2">所属</th> <th>①長浜バイオ大学 バイオサイエンス学部</th> </tr> <tr> <th colspan="2">氏名</th> <th>①土方 敦司、塩生 真史、白井 剛</th> </tr> <tr> <td rowspan="2">AMED<br>事業</td> <td>ユニット/領域名<br>課題名</td> <td> プラットフォーム機能最適化ユニット<br> 創薬等ライフサイエンス研究を促進する研究支援とデータサイエンス </td> </tr> <tr> <td>代表機関<br>代表者</td> <td>長浜バイオ大学<br>白井 剛</td> </tr> <tr> <td colspan="2">支援技術のキーワード</td> <td>超分子モデリング、疾患分子メカニズム解析、分子間相互作用予測</td> </tr> </table> <h2>[2] 支援技術の概要</h2> <ul> <li>超分子モデリングテンプレート探索システムSIRDによる知識ベースモデリング・ドメイン=ドッキングシミュレーション・粗視化シミューレーション・複合体モデル可視化解析システムを組み合わせたモデリングパイプラインで、多面的・多角的に超分子複合体の立体構造モデル構築を支援する。SIRDはPDBのタンパク質・リガンドの構造と相互作用データの分類データを保持しており、モデルを作成したいタンパク質サブユニットのアミノ酸配列やリガンドの構造をマルチクエリとして検索することで、類似性に基づいた超分子モデリングに利用可能なテンプレート(既知構造情報)の情報が得られる(Fig.1)。</li> <li>疾患関連変異を超分子モデル上にマッピングするツールMutation@A Glanceを高度化し、疾患メカニズムの解析やドラッグデザインを支援する。Mutation@A GlanceはdbSNP、ClinVar、CONSMICなどの疾患関連変異や多型の情報と、それらの既知タンパク質立体構造上へのマッピングの情報を保持しており、新たに発見された変異と既知変異の立体構造上での関係を解析できる(Fig.2)。</li> <li>承認薬(Drug)、ヒトタンパク質(Target)、および疾患医療統計の情報を保持し、Drug-Target-疾患・医療統計の組み合わせを検索することができるデータベースDTX(Drug Target Excavator)を開発した。承認薬(Drug)情報には、薬効(ATCコード)・化合物分類(CASコード)・国立医薬品食品衛生研究所既存化学物質毒性データベース(JECDB)からの化合物毒性情報などが、ヒトタンパク質(Target)情報には、ホモログを含めた立体構造の解明の程度・マップされる疾患関連変異の個数・GWASにより疾患関連性が指摘された回数などの情報が含まれる。疾患医療統計は国際疾患分類(ICD-10)・医薬品医療機器総合機構(PMDA)の副作用情報、厚生労働省NDBオープンデータからのレセプト情報(薬価・医療費)・患者数・死亡原因の情報が含まれる。ターゲットタンパク質のアミノ酸配列やドラッグ候補の構造をクエリとすることで、類似したドラックターゲット・既存ドラッグ・関連した疾患の関係をグラフとして解析できる(Fig. 3)。</li> </ul> <div class="row"> <a href="/img/supports/6/6_1.png" class="popup"><img src="/img/supports/6/6_1.png" class="img-responsive _col-xs-6 center-block"></a> </div> <div class="row"> <a href="/img/supports/6/6_2.png" class="popup"><img src="/img/supports/6/6_2.png" class="img-responsive _col-xs-6 center-block"></a> </div> <div class="row"> <a href="/img/supports/6/6_3.png" class="popup"><img src="/img/supports/6/6_3.png" class="img-responsive _col-xs-6 center-block"></a> </div> <h2>[3] 支援技術の利用例</h2> <ul> <li>超分子モデリングパイプラインを構築し、疾患関連遺伝子産物のモデリングによる疾患メカニズム解析を支援した。これまでにプリオン病(BSE・CJD)の原因とされるPrP<sup>Sc</sup>の構造 (東北大学、<i>Structure, 22, 560-571</i>, 2014)、Aicardi-Goutieres症候群関連タンパク質IFIH1ーRNA複合体(京都大学、<i>Am. J. Hum. Genet. 95, 121-125</i>, 2014)、カンジダ症の原因遺伝子STAT1 (理研、<i>J. Biol. Chem. 292, 6240-6254</i>, 2017)など、50件以上の疾患関連分子モデルを構築して支援研究者に提供した。</li> <li>古細菌から新規に発見された、バックグラウンド配列に依存せず塩基ミスマッチDNAを特異的に切断するエンドヌクレアーゼEndoMS(NucS)-PCNA-DNA複合体モデルを構築し、ミスマッチ塩基認識メカニズムの解析を支援した。この支援研究はEndoMSを用いたPCRによる簡便な遺伝子診断技術の開発研究に発展した (九州大学・タカラバイオ株式会社、<i>NAR</i> 2016:Breakthrough Article, <i>Structure</i> 2017,「耐熱性ミスマッチエンドヌクレアーゼの利用方法」PCT/JP2015/075603)(Fig. 4)。</li> <li>超分子モデリングパイプラインを用いたモデリングにより、flap endonuclease (FEN)-DNA ligase (Lig)-PCNA(DNA clamp)-DNA複合体など、クライオ電顕解析における超分子モデル構築を支援した(Sci. Rep. 8:16209, 2018) (Fig. 5)</li> </ul> <div class="row"> <a href="/img/supports/6/6_4.png" class="popup"><img src="/img/supports/6/6_4.png" class="img-responsive _col-xs-6 center-block"></a> </div> <div class="row"> <a href="/img/supports/6/6_5.png" class="popup"><img src="/img/supports/6/6_5.png" class="img-responsive _col-xs-6 center-block"></a> </div> <h2>[4] 支援担当者の研究概要</h2> <ul> <li>構造データベースと相互作用データベースの統合による知識ベース超分子モデル構築法を開発した。この方法により約4,500のヒトタンパク質超分子モデルを構築し、1,001の新規PPI(Protein-Protein Interaction)インターフェースを予測し、10種のヒト疾患についてPPIの関与を始めて示した (Sci Rep. 5:16341, 2015、IIBMP2015 Excellent Research Award)。Mutation@A Glanceを利用し、これらのモデルの相互作用インターフェースと疾患関連変異の形質発現様式(ドミナントネガティブ、機能獲得、ハプロ不全)の相関を解析したところ、機能獲得変異はドメイン間相互作用、ハプロ不全はタンパク質-DNA相互作用に対するオッズ比が高いことが判明した(Sci Rep. 7:8541, 2017)。また、超分子複合体内の複数のサブユニットにGWAS(全ゲノム相関解析)データをマッピングし、同一GWAS形質が有意に多くマップされる超分子モデル(疾患関連超分子)を1,226個特定した。これらのモデル中には、ある疾患や形質に関連した変異がマップされた複数のサブユニットと相互作用していながら、自身には同じ疾患や形質のアノテーションが付与されていない(未発見の疾患関連遺伝子の可能性がある)サブユニットが174種類存在した。これらのサブユニットの多くは、リン酸化シグナル伝達系の必須遺伝子にコードされるハブタンパク質であることが示された。また、複数のGWAS形質がアサインされるが、関連変異がマップされるサブユニットがGWAS間で重複しないモデルは642個存在した。これらのモデルは異なる疾患の関連性を解析するために利用できると考えらえる(Fig. 6)。</li> <li>プラットフォーム機能最適化ユニットで開発中のVaProSの高度化を目的として、タンパク質配列やドラッグ構造をクエリとして、クエリ配列の立体構造の新規性やドラッグターゲットとしての新規性などの調査を行うデータベースシステムDrug Target Excavator (DTX)を開発した。新規創薬ターゲットの発見のために、DTXを用いて「疾患」-「疾患関連遺伝子(タンパク質)」-「既知のDrug Target」?「承認薬(Drug)」の間の関連性について調査を行った結果、合理的創薬の典型的なパターンである「疾患関連遺伝子が既知であり、承認薬が存在し、なおかつターゲットは疾患関連遺伝子(タンパク質)そのものか、それと直接相互作用するか、あるいは同一パスウェイ上に存在する」に該当する疾患は、全体の8%であった。最も多いパターンは、ターゲット発見がボトルネックになっていると考えられる「疾患関連遺伝子(タンパク質)が既知であるが、承認薬が存在せずターゲットも未知である」場合であり、全疾患の63%がこれに該当した。興味深い点として、「疾患関連遺伝子(タンパク質)が既知であり、承認薬が存在しターゲットも既知であるが、疾患関連遺伝子とターゲットの分子間相互作用は自明ではない」パターンが3%程度存在し、これらを解析することで、効率的ターゲット探索法へのヒントが得られるのではないかと予想される(Fig.7)。</li> </ul> <div class="row"> <a href="/img/supports/6/6_6.png" class="popup"><img src="/img/supports/6/6_6.png" class="img-responsive _col-xs-6 center-block"></a> </div> <div class="row"> <a href="/img/supports/6/6_7.png" class="popup"><img src="/img/supports/6/6_7.png" class="img-responsive _col-xs-6 center-block"></a> </div> </div> </div> </div> <div class="row mt30"> <div class="col-xs-12"> <div class="text-right"> <a href="#top" class="btn btn-primary">⇡ ページ上に戻る</a> </div> </div> </div> </div> <div class="container-fruid" id="footer"> <div class="container"> <div class="row"> <div class="col-xs-4 col-xs-offset-4"> <a href="https://www.binds.jp/"><img src="/img/logo.png" class="img-responsive"></a> </div> </div> </div> </div> <script src="https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1.11.3/jquery.min.js"></script> <script src="https://maxcdn.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.3.7/js/bootstrap.min.js"></script> <!--[if lt IE 9]> <script src="https://oss.maxcdn.com/html5shiv/3.7.2/html5shiv.min.js"></script> <script src="https://oss.maxcdn.com/respond/1.4.2/respond.min.js"></script> <![endif]--> <script src="/js/jquery.fancybox.pack.js"></script> <script> $(document).on('click', '.yamm .dropdown-menu', function(e) { e.stopPropagation() }); $('a.popup').fancybox(); </script> <!-- Global site tag (gtag.js) - Google Analytics --> <script async src="https://www.googletagmanager.com/gtag/js?id=UA-74239207-7"></script> <script> window.dataLayer = window.dataLayer || []; function gtag(){dataLayer.push(arguments);} gtag('js', new Date()); gtag('config', 'UA-74239207-7'); </script> </body> </html>