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Detecting footprints of selection - Lehrstuhl für Pflanzenzüchtung
<!DOCTYPE html> <html lang="de"> <head> <meta charset="utf-8"> <!-- This website is powered by TYPO3 - inspiring people to share! TYPO3 is a free open source Content Management Framework initially created by Kasper Skaarhoj and licensed under GNU/GPL. TYPO3 is copyright 1998-2024 of Kasper Skaarhoj. Extensions are copyright of their respective owners. Information and contribution at https://typo3.org/ --> <title>Detecting footprints of selection - Lehrstuhl für Pflanzenzüchtung</title> <meta name="generator" content="TYPO3 CMS"> <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1"> <meta property="og:title" content="Detecting footprints of selection"> <meta name="twitter:card" content="summary_large_image"> <meta name="twitter:title" content="Detecting footprints of selection"> <link rel="stylesheet" href="/typo3temp/assets/compressed/7015c8c4ac5ff815b57530b221005fc6-5ab2ce075797896de7b656f7e5cf42f2.css?1732518344" media="all" nonce="Dk7wYK3PtfjkGiyboD2r8IMW7etxBOEIhuWLwWdCYlK9L6Cy95W1dw"> <link rel="stylesheet" href="/typo3temp/assets/compressed/tum-icons.min-09a15c6641eaec8470b4599b0ba1df4d.css?1732518344" media="all" nonce="Dk7wYK3PtfjkGiyboD2r8IMW7etxBOEIhuWLwWdCYlK9L6Cy95W1dw"> <link href="/_frontend/sitetum/bundled/assets/main-DnW-jTz_.css?1732259416" rel="stylesheet" > <script nonce="Dk7wYK3PtfjkGiyboD2r8IMW7etxBOEIhuWLwWdCYlK9L6Cy95W1dw"> /*<![CDATA[*/ var TYPO3 = Object.assign(TYPO3 || {}, Object.fromEntries(Object.entries({"settings":{"TS":{"m2cCookieLifetime":"7"}}}).filter((entry) => !['__proto__', 'prototype', 'constructor'].includes(entry[0])))); 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Jan. 2011 – 31. Dez. 2013<br> Projektpartner: Karl Schmid, Universität Hohenheim; Stefan Taudien, Fritz-Lipmann-Institut Jena<br> Förderung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)</p> <p class="bodytext">Projektbeschreibung:</p> <p class="bodytext">Die Züchtungsgeschichte vieler Getreidearten ist bekannt, aber die Auswirkungen anthropogener/züchterischer Selektion auf die Getreidegenome wurden nur wenig untersucht. Schwerpunkt dieses Projekts ist die Identifizierung von Genen, die einem Selektionsprozess unterliegen. Die Auswirkungen der Selektion werden im Roggen (Secale cereale L.) durch die Bearbeitung von drei Arbeitshypothesen untersucht: 1) Züchtungsfortschritt ist korreliert mit einem Rückgang der Nukleotiddiversität. 2) Die Frequenz der Allele, die an ein vorteilhaftes Allel gekoppelt sind, steigt an, während die benachbarte DNA Sequenz einen Verlust an zuvor vorhandenen Polymorphismen erfährt (=„selective sweep“). 3) Die Kennzeichen eines „selective sweeps“ werden in den chromosomalen Regionen, die von dem vorteilhaften Allel beeinflusst sind, beobachtet. Unter Verwendung der „Genome-Capture” Technologie und der Hochdurchsatz-Sequenzierung werden mehr als 500 Gene sequenziert. Sequenzdaten werden in Roggenpopulationen erhoben, welche die Züchtungsgeschichte des Roggens von Landrassen hin zu Elite-Inzuchtlinien repräsentieren. Die Sequenzanalyse umfasst die Exon-Intron-Zuordnung, die SNP Detektion, die Bestimmung von Nukleotiddiversität und Kopplungsphasenungleichgewicht sowohl innerhalb und zwischen den Genen als auch innerhalb und zwischen den Populationen. Ziel dieses umfangreichen Selektionsscreens ist die Erstellung der ersten Selektionskarte für Roggen. Die identifizierten Gene decken Kandidatengene für agronomisch wichtige Merkmale auf und sind von Bedeutung für Assoziationsstudien.</p> </div> </div> <div class="c-link-to-top js-link-to-top"> <a href="#topbar" title="nach oben springen"> To top </a> </div> </div> <div class="col-md-3 col-xl-2 c-content-area__aside js-link-checker"> <div id="sidebar" class="sidebar"> <aside class="c-aside"> <div id="c1802" class="frame frame-type-textmedia frame-layout-0"> <h3> Lehrstuhl für Pflanzenzüchtung </h3> <p><strong>Prof. Dr. Chris-Carolin Schön</strong></p> <p>Liesel-Beckmann-Str. 2<br> D-85354 Freising</p> <p>Tel.: +49.8161.71.3422<br> Tel.: +49.8161.71.3419<br> Fax: +49.8161.71.4511<br> E-Mail: <a href="#" data-mailto-token="wksvdy4coubodkbskd8zjJdew8no" data-mailto-vector="10">sekretariat.pz</a></p> </div> </aside> </div> </div> </div> </div> </main> <footer class="c-footer"> <div class="c-footer__legal"> <nav class="container" aria-label="legal links"> <ul class="list-inline"><li class="list-inline-item"><a href="/plantbreeding/datenschutz/">Datenschutz</a></li><li class="list-inline-item"><a href="/plantbreeding/impressum/">Impressum</a></li><li class="list-inline-item"><a href="/plantbreeding/barrierefreiheit/">Barrierefreiheit</a></li></ul> <img aria-hidden="true" src="https://tum.de/hsts/default" height="1" width="1" /> </nav> </div> </footer> <script type="module" src="/_frontend/sitetum/bundled/assets/main-Ccf65gYE.js?1732259416"></script> <script data-ignore="1" data-dp-cookiedesc="layout" nonce="Dk7wYK3PtfjkGiyboD2r8IMW7etxBOEIhuWLwWdCYlK9L6Cy95W1dw" type="text/plain"> Diese Webseite verwendet Cookies, um die Bedienfreundlichkeit zu erhöhen. <a aria-label="Weitere Informationen zu unseren verwendeten Cookies" class="cc-link" href="/plantbreeding/datenschutz/#AktiveKomponenten" rel="noopener noreferrer nofollow" target="_blank" > Weitere Informationen </a> </script> <script data-ignore="1" data-dp-cookieselect="layout" nonce="Dk7wYK3PtfjkGiyboD2r8IMW7etxBOEIhuWLwWdCYlK9L6Cy95W1dw" type="text/plain"> <div class="dp--cookie-check" xmlns:f="http://www.w3.org/1999/html"> <label for="dp--cookie-required"> <input class="dp--check-box" id="dp--cookie-required" tabindex="-1" type="checkbox" name="" value="" checked disabled> Notwendig </label> <label for="dp--cookie-statistics"> <input class="dp--check-box" id="dp--cookie-statistics" tabindex="1" type="checkbox" name="" value=""> Statistiken </label> </div> </script> <script data-ignore="1" data-dp-cookierevoke="layout" nonce="Dk7wYK3PtfjkGiyboD2r8IMW7etxBOEIhuWLwWdCYlK9L6Cy95W1dw" type="text/plain"> <button type="button" aria-label="Cookie Consent widerrufen" class="dp--revoke {{classes}}" > <i class="dp--icon-fingerprint"></i> <span class="dp--hover">Cookies</span> </button> </script> <script data-ignore="1" data-dp-cookieiframe="layout" nonce="Dk7wYK3PtfjkGiyboD2r8IMW7etxBOEIhuWLwWdCYlK9L6Cy95W1dw" type="text/plain"> <div class="dp--overlay-inner" data-nosnippet> <div class="dp--overlay-header">{{notice}}</div> <div class="dp--overlay-description">{{desc}}</div> <div class="dp--overlay-button"> <button class="db--overlay-submit" onclick="window.DPCookieConsent.forceAccept(this)" data-cookieconsent="{{type}}"> {{btn}} </button> </div> </div> </script> <script data-ignore="1" nonce="Dk7wYK3PtfjkGiyboD2r8IMW7etxBOEIhuWLwWdCYlK9L6Cy95W1dw" type="text/javascript"> window.cookieconsent_options = { overlay: { notice: true, box: { background: 'rgba(48,112,179,.75)', text: '#fff' }, btn: { background: '#b81839', text: '#fff' } }, content: { message:'Diese Webseite verwendet Cookies, um die Bedienfreundlichkeit zu erhöhen.', dismiss:'Cookies zulassen!', allow:'Speichern', deny: 'notwendige <span></span>Cookies', link:'Weitere Informationen', href:'/plantbreeding/datenschutz/', target:'_blank', 'allow-all': 'Alle akzeptieren!', config: 'Anpassen', 'config-header': 'Einstellungen für die Zustimmung anpassen', cookie: 'Cookies', duration: 'Duration', vendor: 'Vendor', media: { notice: 'Cookie-Hinweis', desc: 'Durch das Laden dieser Ressource wird eine Verbindung zu externen Servern hergestellt, die Cookies und andere Tracking-Technologien verwenden, um die Benutzererfahrung zu personalisieren und zu verbessern. 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